Testing/CMakeLists.txt

   1 # CMakeLists for Testing purpose
   2 # Cxx file that need a file to run should be place aproprietly
   3
   4 SET(CXX_TEST_PATH ${EXECUTABLE_OUTPUT_PATH})
   5
   6 SET(GDCM_TESTS ${CXX_TEST_PATH}/gdcmTests)
   7
   8 # add test that does not require data:
   9 # They usally return if no argument is given
  10 SET(TEST_SOURCES
  11   TestUtil.cxx
  12   TestBug.cxx
  13   TestHash.cxx
  14   TestTS.cxx
  15   TestVR.cxx
  16   TestDictGroupName.cxx
  17   TestDict.cxx
  18   TestWriteSimple.cxx
  19   TestImageSet.cxx
  20   TestDicomDirElement.cxx
  21   TestDicomString.cxx
  22   #TestValidate.cxx
  23 )
  24
  25 # add tests that require data
  26 IF (GDCM_DATA_ROOT)
  27   SET(TEST_SOURCES ${TEST_SOURCES}
  28     TestFileAccessors.cxx
  29     TestMakeIcon.cxx
  30     TestLoadAllDocumentsNoPrivNoSeq.cxx # includes generated gdcmDataImages.h
  31     TestPrintAllDocument.cxx         # includes generated gdcmDataImages.h
  32     #TestAllEntryVerify.cxx           # includes generated gdcmDataImages.h
  33     TestAllReadCompareDicom.cxx      # includes generated gdcmDataImages.h
  34     TestReadWriteReadCompare.cxx     # includes generated gdcmDataImages.h
  35     #TestCopyDicom.cxx                # includes generated gdcmDataImages.h
  36     #    TestCopyRescaleDicom.cxx         # includes generated gdcmDataImages.h
  37     #TestChangeHeader.cxx
  38     #    TestAnonymize.cxx
  39     TestDirList.cxx
  40     TestDicomDir.cxx                 # require DICOMDIR
  41     TestBuildUpDicomDir.cxx          # writes a file named "NewDICOMDIR"
  42     TestMakeDicomDir.cxx             # writes a file named "NewDICOMDIR"
  43     TestSerieHelper.cxx              # uses gdcmData as a default root directory
  44   )
  45   # add test that require VTK:
  46   IF(GDCM_VTK)
  47     IF("${VTK_MAJOR_VERSION}" LESS 4)
  48       MESSAGE(FATAL_ERROR "This VTK version is not supported, you are on your own !")
  49     ELSE("${VTK_MAJOR_VERSION}" LESS 4)
  50       IF("${VTK_MAJOR_VERSION}" EQUAL 4 AND "${VTK_MINOR_VERSION}" EQUAL 2)
  51         MESSAGE(FATAL_ERROR "This VTK version is not supported, you are on your own !"
  52                              "Although gdcm should compile fine. You just need to turn BUILD_TESTING:=OFF")
  53       ENDIF("${VTK_MAJOR_VERSION}" EQUAL 4 AND "${VTK_MINOR_VERSION}" EQUAL 2)
  54       IF("${VTK_MAJOR_VERSION}" EQUAL 4 AND "${VTK_MINOR_VERSION}" EQUAL 4 AND "${VTK_BUILD_VERSION}" LESS 3)
  55         MESSAGE(FATAL_ERROR "This VTK version is not supported, you are on your own !"
  56                              "Although gdcm should compile fine. You just need to turn BUILD_TESTING:=OFF")
  57       ENDIF("${VTK_MAJOR_VERSION}" EQUAL 4 AND "${VTK_MINOR_VERSION}" EQUAL 4 AND "${VTK_BUILD_VERSION}" LESS 3)
  58       # Include the VTK library since we know this is going to work
  59       INCLUDE(${VTK_USE_FILE})
  60
  61       INCLUDE_DIRECTORIES(
  62         ${GDCM_SOURCE_DIR}/vtk/
  63       )
  64       SET(TEST_SOURCES ${TEST_SOURCES}
  65         VTKTestRead.cxx
  66         VTKTestReadSeq.cxx
  67         VTKTestWrite.cxx
  68         VTKTestWriteSeq.cxx
  69       )
  70     ENDIF("${VTK_MAJOR_VERSION}" LESS 4)
  71   ENDIF(GDCM_VTK)
  72 ENDIF (GDCM_DATA_ROOT)
  73
  74
  75
  76 # include stuff
  77 INCLUDE_DIRECTORIES(
  78   ${GDCM_SOURCE_DIR}/src/
  79   ${GDCM_BINARY_DIR}/
  80 )
  81
  82 CREATE_TEST_SOURCELIST(Tests gdcmTests.cxx ${TEST_SOURCES})
  83 ADD_EXECUTABLE(gdcmTests ${Tests})
  84 IF(GDCM_VTK)
  85   TARGET_LINK_LIBRARIES(gdcmTests vtkgdcm vtkRendering)
  86 ELSE(GDCM_VTK)
  87   TARGET_LINK_LIBRARIES(gdcmTests gdcm)
  88 ENDIF(GDCM_VTK)
  89
  90 SET (TestsToRun ${Tests})
  91 REMOVE (TestsToRun gdcmTests.cxx)
  92
  93 # Loop over files and create executables
  94 FOREACH(file ${TEST_SOURCES})
  95   GET_FILENAME_COMPONENT(name ${file} NAME_WE)
  96   ADD_TEST(${name} ${GDCM_TESTS} ${name})
  97 ENDFOREACH(file ${TEST_SOURCES})
  98
  99 #-----------------------------------------------------------------------------
 100
 101 # We need to test the reading of all dicom images in the gdcmData directory
 102 # First parse this directory and extract all images
 103
 104 FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB
 105   "${GDCM_DATA_ROOT}/*.acr"
 106   "${GDCM_DATA_ROOT}/*.dcm"
 107   "${GDCM_DATA_ROOT}/*.nema"
 108   "${GDCM_DATA_ROOT}/*.ima"
 109   )
 110
 111 # Black list of images known to break lots of readers (efilm, xmedcon ...):
 112 SET(BLACK_LIST
 113   # Multiframe Papyrus format image
 114   # Just to remember this format exists, and is gdcm::File compliant
 115   # (NOT gdcm::FileHelper ...)
 116   # any contribution is welcome
 117   "PET-cardio-Multiframe-Papyrus.dcm"
 118   # From David Clunie's Compresion Dataset
 119   "D_CLUNIE_CT1_JLSN.dcm"
 120   "D_CLUNIE_CT1_JLSL.dcm"
 121   #Not a Dicom Image, but a RT Object
 122   "RS2.16.124.113534.2.3.5.0.120040728.21342.353.12747_anonimized.dcm"
 123   #Dicom MPEG image
 124   "ETIAM_video_002.dcm"
 125   #Something stupid occured in the code for LibIDO images.
 126   #I Black list them for a while. JP
 127   "gdcm-ACR-LibIDO.acr"
 128   "LIBIDO-24-ACR_NEMA-Rectangle.dcm"
 129   #16 Bits per pixel images with LUT 16 Bits.
 130   #I wait to be 100% sure before releasing them. JP
 131   "rle16sti.dcm"
 132   "rle16loo.dcm"
 133   # Jasper cannot handle this image, only kakadu so far, unless you patch jasper
 134   # but then it breaks other images...
 135   "CT_Phillips_JPEG2K_Decompr_Problem.dcm"
 136   #
 137   # ------------
 138   #
 139   # I probabely messed up smething with the .png, .tst of
 140   # the images I recently added to the Test Suite
 141   # I Black list them, untill I find where is the pb.
 142   "US-RGB-8-esopecho.dcm"
 143   "MR_Philips_Intera_No_PrivateSequenceImplicitVR.dcm"
 144   "MR_Philips_Intera_PrivateSequenceImplicitVR.dcm"
 145   "MR_SIEMENS_forceLoad29-1010_29-1020.dcm"
 146   )
 147
 148 # Create a specific list of dicom files that we know are part of a sequence
 149 SET(SEQ_LIST
 150   "SIEMENS_MAGNETOM-12-MONO2-FileSeq[0-9].dcm"
 151   )
 152
 153 # Add a special test that requires dciodvfy from dicom3tools
 154 INCLUDE(${GDCM_SOURCE_DIR}/CMake/FindDicom3Tools.cmake)
 155
 156 # This is a GLOB expression, change it into a list separated with a comma and \n
 157 SET(GDCM_DATA_IMAGES)
 158 SET(GDCM_DATA_SEQ_IMAGES)
 159 FOREACH(filename ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB})
 160   GET_FILENAME_COMPONENT(filename_temp ${filename} NAME)
 161   IF(DCIODVFY_FOUND)
 162     ADD_TEST("DCIODVFY-INPUT-${filename_temp}" "${DCIODVFY_EXECUTABLE}" "${filename}")
 163     ADD_TEST("DCIODVFY-OUTPUT-${filename_temp}" "${DCIODVFY_EXECUTABLE}" "${GDCM_DATA_ROOT}/BaselineDicom/${filename_temp}")
 164   ENDIF(DCIODVFY_FOUND)
 165   STRING(REGEX MATCH ${filename_temp} bad_dicom ${BLACK_LIST})
 166   IF(NOT bad_dicom)
 167     SET(GDCM_DATA_IMAGES "${GDCM_DATA_IMAGES}\n\"${filename_temp}\",")
 168     # SEQ_LIST is a regular expression:
 169     STRING(REGEX MATCH ${SEQ_LIST} is_seq ${filename_temp})
 170     IF(is_seq)
 171       SET(GDCM_DATA_SEQ_IMAGES "${GDCM_DATA_SEQ_IMAGES}\n\"${filename_temp}\",")
 172     ENDIF(is_seq)
 173   ENDIF(NOT bad_dicom)
 174 ENDFOREACH(filename)
 175
 176 # Populate GDCM_DATA_IMAGES:
 177 FILE(WRITE "${GDCM_BINARY_DIR}/gdcmDataImages.h"
 178   "const char * const gdcmDataImages[] = { ${GDCM_DATA_IMAGES}\n0 };\n"
 179 )
 180
 181 # Populate GDCM_DATA_SEQ_IMAGES:
 182 FILE(WRITE "${GDCM_BINARY_DIR}/gdcmDataSeqImages.h"
 183   "const char * const gdcmDataSeqImages[] = { ${GDCM_DATA_SEQ_IMAGES}\n0 };\n"
 184 )
 185
 186 #-----------------------------------------------------------------------------
 187 # Trying to solve a bizarre problem when loading shared lib if gdcm is static
 188 # Therefore I disable the test when building SHAREDLIBS
 189 IF(UNIX AND NOT GDCM_BUILD_SHARED_LIBS)
 190   ADD_LIBRARY(dynmodule MODULE dynmodule.cxx)
 191   TARGET_LINK_LIBRARIES(dynmodule gdcm)
 192   ADD_EXECUTABLE(loadmodule loadmodule.cxx )
 193   TARGET_LINK_LIBRARIES(loadmodule gdcm -ldl)
 194   ADD_TEST(loadmodule ${CXX_TEST_PATH}/loadmodule)
 195 ENDIF(UNIX AND NOT GDCM_BUILD_SHARED_LIBS)
 196
 197
 198