Testing/CMakeLists.txt

   1 # CMakeLists for Testing purpose
   2 # Cxx file that need a file to run should be place aproprietly
   3
   4 SET(CXX_TEST_PATH ${EXECUTABLE_OUTPUT_PATH})
   5
   6 SET(GDCM_TESTS ${CXX_TEST_PATH}/gdcmTests)
   7
   8 # add test that does not require data:
   9 # They usally return if no argument is given
  10 SET(TEST_SOURCES
  11   TestBug.cxx
  12   TestDcm2Acr.cxx
  13   TestHash.cxx
  14   TestWrite.cxx
  15 )
  16
  17 # add tests that require data
  18 IF (GDCM_DATA_ROOT)
  19   SET(TEST_SOURCES ${TEST_SOURCES}
  20     #PrintHeader.cxx       #require test.acr
  21     PrintDocument.cxx     #require test.acr
  22     PrintDicomDir.cxx
  23     TestFindTags.cxx
  24     TestChangeHeader.cxx
  25     TestDicomDir.cxx      #require DICOMDIR
  26     BuildUpDicomDir.cxx
  27     TestReadWrite.cxx
  28     makeDicomDir.cxx
  29   )
  30   # add test that require VTK:
  31   IF(GDCM_VTK)
  32     INCLUDE_DIRECTORIES(
  33       ${GDCM_SOURCE_DIR}/vtk/
  34       )
  35     SET(TEST_SOURCES ${TEST_SOURCES}
  36       ShowDicom.cxx
  37       )
  38   ENDIF(GDCM_VTK)
  39 ENDIF (GDCM_DATA_ROOT)
  40
  41
  42
  43 # include stuff
  44 INCLUDE_DIRECTORIES(
  45   ${GDCM_SOURCE_DIR}/src/
  46   ${GDCM_BINARY_DIR}/
  47 )
  48
  49 CREATE_TEST_SOURCELIST(Tests gdcmTests.cxx ${TEST_SOURCES})
  50 ADD_EXECUTABLE(gdcmTests ${Tests})
  51 IF(GDCM_VTK)
  52   TARGET_LINK_LIBRARIES(gdcmTests vtkgdcm vtkRendering)
  53 ELSE(GDCM_VTK)
  54   TARGET_LINK_LIBRARIES(gdcmTests gdcm)
  55 ENDIF(GDCM_VTK)
  56
  57 SET (TestsToRun ${Tests})
  58 REMOVE (TestsToRun gdcmTests.cxx)
  59
  60 # Loop over files and create executables
  61 FOREACH(file ${TEST_SOURCES})
  62   GET_FILENAME_COMPONENT(name ${file} NAME_WE)
  63 #  IF (GDCM_DATA_ROOT)
  64 #    ADD_TEST(${name} ${GDCM_TESTS} ${name}
  65 #        -D ${GDCM_DATA_ROOT}
  66 #        -T ${GDCM_BINARY_DIR}/Testing/Temporary
  67 #        -V Baseline/gdcm/${name}.png)
  68 #  ELSE (GDCM_DATA_ROOT)
  69     ADD_TEST(${name} ${GDCM_TESTS} ${name})
  70 #  ENDIF (GDCM_DATA_ROOT)
  71 ENDFOREACH(file ${TEST_SOURCES})
  72
  73 #-----------------------------------------------------------------------------
  74
  75 # We need to test the reading of all dicom images in the gdcmData directory
  76 # First parse this directory and extract all images
  77
  78 IF(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
  79   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB
  80     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.acr"
  81     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.dcm"
  82     )
  83 ELSE(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
  84   # Since there is a bug in cmake 1.8.3, I'll have to do two separate globs
  85   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR
  86     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.acr"
  87     )
  88   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_DCM
  89     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.dcm"
  90     )
  91   SET(GDCM_DATA_IMAGES_GLOB ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_DCM} ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR})
  92   #SET(GDCM_DATA_IMAGES_GLOB  ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR})
  93 ENDIF(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
  94
  95 # Black list of images known to break lots of readers (efilm, xmedcon ...):
  96 SET(BLACK_LIST
  97   "gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm"
  98   "cr172241.dcm"  #temporarily remove as it kills my gnome session (but not kde)
  99   "emptyImage.dcm"  #the png looks ugly...
 100   "gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm" weird looks exactly the same as gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
 101   "gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm" png looks ugly
 102   "irmPhlipsNew1.dcm" png looks ugly
 103   "mriThruVPRO.dcm"   png looks ugly
 104   "US.3405.1.dcm" looks exactly the same as US.1.2.dcm
 105   )
 106
 107 #   gdcm-ACR-LibIDO seems to be cut
 108 #   test.acr is very bright
 109
 110 # This is a GLOB expression, change it into a list separated with a comma and \n
 111 SET(GDCM_DATA_IMAGES)
 112 FOREACH(filename ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB})
 113   GET_FILENAME_COMPONENT(filename_temp ${filename} NAME)
 114   STRING(REGEX MATCH ${filename_temp} bad_dicom ${BLACK_LIST})
 115   IF(NOT bad_dicom)
 116     SET(GDCM_DATA_IMAGES "${GDCM_DATA_IMAGES}\n\"${filename_temp}\",")
 117   ENDIF(NOT bad_dicom)
 118 ENDFOREACH(filename)
 119
 120 # Populate GDCM_DATA_IMAGES:
 121 FILE(WRITE "${GDCM_BINARY_DIR}/gdcmDataImages.h"
 122   "const char * const gdcmDataImages[] = { ${GDCM_DATA_IMAGES}\n0 };\n"
 123   )