Testing/CMakeLists.txt

   1 # CMakeLists for Testing purpose
   2 # Cxx file that need a file to run should be place aproprietly
   3
   4 SET(CXX_TEST_PATH ${EXECUTABLE_OUTPUT_PATH})
   5
   6 SET(GDCM_TESTS ${CXX_TEST_PATH}/gdcmTests)
   7
   8 # add test that does not require data:
   9 # They usally return if no argument is given
  10 SET(TEST_SOURCES
  11   TestBug.cxx
  12   TestHash.cxx
  13   TestTS.cxx
  14   TestVR.cxx
  15   TestUtil.cxx
  16   TestDicomString.cxx
  17 )
  18
  19 # add tests that require data
  20 IF (GDCM_DATA_ROOT)
  21   SET(TEST_SOURCES ${TEST_SOURCES}
  22     TestReadWriteReadCompare.cxx     # includes generated gdcmDataImages.h
  23     PrintAllDocument.cxx             # includes generated gdcmDataImages.h
  24     TestAllReadCompareDicom.cxx      # includes generated gdcmDataImages.h
  25     TestAllEntryVerify.cxx           # includes generated gdcmDataImages.h
  26     PrintDicomDir.cxx
  27     #TestChangeHeader.cxx
  28     TestDicomDir.cxx                 # require DICOMDIR
  29     BuildUpDicomDir.cxx              # writes a file named "NewDICOMDIR"
  30     makeDicomDir.cxx                 # writes a file named "NewDICOMDIR"
  31     TestCopyDicom.cxx
  32     TestCopyRescaleDicom.cxx
  33   )
  34   # add test that require VTK:
  35   IF(GDCM_VTK)
  36     # Include the VTK library
  37     INCLUDE(${VTK_USE_FILE})
  38
  39     INCLUDE_DIRECTORIES(
  40       ${GDCM_SOURCE_DIR}/vtk/
  41       )
  42     SET(TEST_SOURCES ${TEST_SOURCES}
  43       ShowDicom.cxx
  44       TestWriteWithVTK.cxx
  45       )
  46   ENDIF(GDCM_VTK)
  47 ENDIF (GDCM_DATA_ROOT)
  48
  49
  50
  51 # include stuff
  52 INCLUDE_DIRECTORIES(
  53   ${GDCM_SOURCE_DIR}/src/
  54   ${GDCM_BINARY_DIR}/
  55 )
  56
  57 CREATE_TEST_SOURCELIST(Tests gdcmTests.cxx ${TEST_SOURCES})
  58 ADD_EXECUTABLE(gdcmTests ${Tests})
  59 IF(GDCM_VTK)
  60   TARGET_LINK_LIBRARIES(gdcmTests vtkgdcm vtkRendering)
  61 ELSE(GDCM_VTK)
  62   TARGET_LINK_LIBRARIES(gdcmTests gdcm)
  63 ENDIF(GDCM_VTK)
  64
  65 SET (TestsToRun ${Tests})
  66 REMOVE (TestsToRun gdcmTests.cxx)
  67
  68 # Loop over files and create executables
  69 FOREACH(file ${TEST_SOURCES})
  70   GET_FILENAME_COMPONENT(name ${file} NAME_WE)
  71 #  IF (GDCM_DATA_ROOT)
  72 #    ADD_TEST(${name} ${GDCM_TESTS} ${name}
  73 #        -D ${GDCM_DATA_ROOT}
  74 #        -T ${GDCM_BINARY_DIR}/Testing/Temporary
  75 #        -V Baseline/gdcm/${name}.png)
  76 #  ELSE (GDCM_DATA_ROOT)
  77     ADD_TEST(${name} ${GDCM_TESTS} ${name})
  78 #  ENDIF (GDCM_DATA_ROOT)
  79 ENDFOREACH(file ${TEST_SOURCES})
  80
  81 #-----------------------------------------------------------------------------
  82
  83 # We need to test the reading of all dicom images in the gdcmData directory
  84 # First parse this directory and extract all images
  85
  86 IF(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
  87   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB
  88     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.acr"
  89     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.dcm"
  90     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.nema"
  91     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.ima"
  92     )
  93 ELSE(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
  94   # Since there is a bug in cmake 1.8.3, I'll have to do two separate globs
  95   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR
  96     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.acr"
  97     )
  98   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_DCM
  99     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.dcm"
 100     )
 101   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_NEMA
 102     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.nema"
 103     )
 104   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_IMA
 105     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.ima"
 106     )
 107   SET(GDCM_DATA_IMAGES_GLOB
 108     ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_DCM} ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR}
 109     ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_NEMA} ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_IMA})
 110   #SET(GDCM_DATA_IMAGES_GLOB  ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR})
 111 ENDIF(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
 112
 113 # Black list of images known to break lots of readers (efilm, xmedcon ...):
 114 SET(BLACK_LIST
 115   # serial killer (also segfaults vtkgdcmViewer, but NOT PrintFile)
 116   "gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm"
 117
 118   # Mathieu: temporarily remove as it kills my gnome session (but not kde)
 119   # JPR: also breaks TestReadWriteReadCompare : Pixel differ (as expanded
 120   #      in memory)
 121   "KODAK-12-MONO1-Odd_Terminated_Sequence.dcm"
 122   )
 123
 124 IF(APPLE)
 125   SET(BLACK_LIST ${BLACK_LIST}
 126     "SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr"  # This image contains a wrong length
 127     # Which led us to read pass the end of the file. This seg fault on MacOSX
 128     )
 129 ENDIF(APPLE)
 130
 131 # This is a GLOB expression, change it into a list separated with a comma and \n
 132 SET(GDCM_DATA_IMAGES)
 133 FOREACH(filename ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB})
 134   GET_FILENAME_COMPONENT(filename_temp ${filename} NAME)
 135   STRING(REGEX MATCH ${filename_temp} bad_dicom ${BLACK_LIST})
 136   IF(NOT bad_dicom)
 137     SET(GDCM_DATA_IMAGES "${GDCM_DATA_IMAGES}\n\"${filename_temp}\",")
 138   ENDIF(NOT bad_dicom)
 139 ENDFOREACH(filename)
 140
 141 # Populate GDCM_DATA_IMAGES:
 142 FILE(WRITE "${GDCM_BINARY_DIR}/gdcmDataImages.h"
 143   "const char * const gdcmDataImages[] = { ${GDCM_DATA_IMAGES}\n0 };\n"
 144   )