Testing/CMakeLists.txt

   1 # CMakeLists for Testing purpose
   2 # Cxx file that need a file to run should be place aproprietly
   3
   4 SET(CXX_TEST_PATH ${EXECUTABLE_OUTPUT_PATH})
   5
   6 SET(GDCM_TESTS ${CXX_TEST_PATH}/gdcmTests)
   7
   8 # add test that does not require data:
   9 # They usally return if no argument is given
  10 SET(TEST_SOURCES
  11   TestBug.cxx
  12   TestHash.cxx
  13   TestTS.cxx
  14   TestVR.cxx
  15   TestDicomString.cxx
  16 )
  17
  18 # add tests that require data
  19 IF (GDCM_DATA_ROOT)
  20   SET(TEST_SOURCES ${TEST_SOURCES}
  21     TestReadWriteReadCompare.cxx     # includes generated gdcmDataImages.h
  22     PrintAllDocument.cxx             # includes generated gdcmDataImages.h
  23     TestAllReadCompareDicom.cxx      # includes generated gdcmDataImages.h
  24     TestAllEntryVerify.cxx           # includes generated gdcmDataImages.h
  25     PrintDicomDir.cxx
  26     #TestChangeHeader.cxx
  27     TestDicomDir.cxx                 # require DICOMDIR
  28     BuildUpDicomDir.cxx              # writes a file named "NewDICOMDIR"
  29     makeDicomDir.cxx                 # writes a file named "NewDICOMDIR"
  30     TestCopyDicom.cxx
  31   )
  32   # add test that require VTK:
  33   IF(GDCM_VTK)
  34     # Include the VTK library
  35     INCLUDE(${VTK_USE_FILE})
  36
  37     INCLUDE_DIRECTORIES(
  38       ${GDCM_SOURCE_DIR}/vtk/
  39       )
  40     SET(TEST_SOURCES ${TEST_SOURCES}
  41       ShowDicom.cxx
  42       )
  43   ENDIF(GDCM_VTK)
  44 ENDIF (GDCM_DATA_ROOT)
  45
  46
  47
  48 # include stuff
  49 INCLUDE_DIRECTORIES(
  50   ${GDCM_SOURCE_DIR}/src/
  51   ${GDCM_BINARY_DIR}/
  52 )
  53
  54 CREATE_TEST_SOURCELIST(Tests gdcmTests.cxx ${TEST_SOURCES})
  55 ADD_EXECUTABLE(gdcmTests ${Tests})
  56 IF(GDCM_VTK)
  57   TARGET_LINK_LIBRARIES(gdcmTests vtkgdcm vtkRendering)
  58 ELSE(GDCM_VTK)
  59   TARGET_LINK_LIBRARIES(gdcmTests gdcm)
  60 ENDIF(GDCM_VTK)
  61
  62 SET (TestsToRun ${Tests})
  63 REMOVE (TestsToRun gdcmTests.cxx)
  64
  65 # Loop over files and create executables
  66 FOREACH(file ${TEST_SOURCES})
  67   GET_FILENAME_COMPONENT(name ${file} NAME_WE)
  68 #  IF (GDCM_DATA_ROOT)
  69 #    ADD_TEST(${name} ${GDCM_TESTS} ${name}
  70 #        -D ${GDCM_DATA_ROOT}
  71 #        -T ${GDCM_BINARY_DIR}/Testing/Temporary
  72 #        -V Baseline/gdcm/${name}.png)
  73 #  ELSE (GDCM_DATA_ROOT)
  74     ADD_TEST(${name} ${GDCM_TESTS} ${name})
  75 #  ENDIF (GDCM_DATA_ROOT)
  76 ENDFOREACH(file ${TEST_SOURCES})
  77
  78 #-----------------------------------------------------------------------------
  79
  80 # We need to test the reading of all dicom images in the gdcmData directory
  81 # First parse this directory and extract all images
  82
  83 IF(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
  84   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB
  85     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.acr"
  86     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.dcm"
  87     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.nema"
  88     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.ima"
  89     )
  90 ELSE(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
  91   # Since there is a bug in cmake 1.8.3, I'll have to do two separate globs
  92   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR
  93     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.acr"
  94     )
  95   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_DCM
  96     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.dcm"
  97     )
  98   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_NEMA
  99     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.nema"
 100     )
 101   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_IMA
 102     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.ima"
 103     )
 104   SET(GDCM_DATA_IMAGES_GLOB
 105     ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_DCM} ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR}
 106     ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_NEMA} ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_IMA})
 107   #SET(GDCM_DATA_IMAGES_GLOB  ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR})
 108 ENDIF(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
 109
 110 # Black list of images known to break lots of readers (efilm, xmedcon ...):
 111 SET(BLACK_LIST
 112   # serial killer (also segfaults vtkgdcmViewer, but NOT PrintFile)
 113   "gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm"
 114
 115   # Mathieu: temporarily remove as it kills my gnome session (but not kde)
 116   # JPR: also breaks TestReadWriteReadCompare : Pixel differ (as expanded
 117   #      in memory)
 118   "KODAK-12-MONO1-Odd_Terminated_Sequence.dcm"
 119   )
 120
 121 IF(APPLE)
 122   SET(BLACK_LIST ${BLACK_LIST}
 123     "SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr"  # This image contains a wrong length
 124     # Which led us to read pass the end of the file. This seg fault on MacOSX
 125     )
 126 ENDIF(APPLE)
 127
 128 # This is a GLOB expression, change it into a list separated with a comma and \n
 129 SET(GDCM_DATA_IMAGES)
 130 FOREACH(filename ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB})
 131   GET_FILENAME_COMPONENT(filename_temp ${filename} NAME)
 132   STRING(REGEX MATCH ${filename_temp} bad_dicom ${BLACK_LIST})
 133   IF(NOT bad_dicom)
 134     SET(GDCM_DATA_IMAGES "${GDCM_DATA_IMAGES}\n\"${filename_temp}\",")
 135   ENDIF(NOT bad_dicom)
 136 ENDFOREACH(filename)
 137
 138 # Populate GDCM_DATA_IMAGES:
 139 FILE(WRITE "${GDCM_BINARY_DIR}/gdcmDataImages.h"
 140   "const char * const gdcmDataImages[] = { ${GDCM_DATA_IMAGES}\n0 };\n"
 141   )