Testing/CMakeLists.txt

   1 # CMakeLists for Testing purpose
   2 # Cxx file that need a file to run should be place aproprietly
   3
   4 SET(CXX_TEST_PATH ${EXECUTABLE_OUTPUT_PATH})
   5
   6 SET(GDCM_TESTS ${CXX_TEST_PATH}/gdcmTests)
   7
   8 # add test that does not require data:
   9 # They usally return if no argument is given
  10 SET(TEST_SOURCES
  11   TestBug.cxx
  12   TestHash.cxx
  13   TestTS.cxx
  14   TestVR.cxx
  15   TestUtil.cxx
  16   TestDicomString.cxx
  17 )
  18
  19 # add tests that require data
  20 IF (GDCM_DATA_ROOT)
  21   SET(TEST_SOURCES ${TEST_SOURCES}
  22     TestReadWriteReadCompare.cxx     # includes generated gdcmDataImages.h
  23     PrintAllDocument.cxx             # includes generated gdcmDataImages.h
  24     TestAllReadCompareDicom.cxx      # includes generated gdcmDataImages.h
  25     TestAllEntryVerify.cxx           # includes generated gdcmDataImages.h
  26     PrintDicomDir.cxx
  27     #TestChangeHeader.cxx
  28     TestDicomDir.cxx                 # require DICOMDIR
  29     BuildUpDicomDir.cxx              # writes a file named "NewDICOMDIR"
  30     makeDicomDir.cxx                 # writes a file named "NewDICOMDIR"
  31     TestCopyDicom.cxx
  32   )
  33   # add test that require VTK:
  34   IF(GDCM_VTK)
  35     # Include the VTK library
  36     INCLUDE(${VTK_USE_FILE})
  37
  38     INCLUDE_DIRECTORIES(
  39       ${GDCM_SOURCE_DIR}/vtk/
  40       )
  41     SET(TEST_SOURCES ${TEST_SOURCES}
  42       ShowDicom.cxx
  43       )
  44   ENDIF(GDCM_VTK)
  45 ENDIF (GDCM_DATA_ROOT)
  46
  47
  48
  49 # include stuff
  50 INCLUDE_DIRECTORIES(
  51   ${GDCM_SOURCE_DIR}/src/
  52   ${GDCM_BINARY_DIR}/
  53 )
  54
  55 CREATE_TEST_SOURCELIST(Tests gdcmTests.cxx ${TEST_SOURCES})
  56 ADD_EXECUTABLE(gdcmTests ${Tests})
  57 IF(GDCM_VTK)
  58   TARGET_LINK_LIBRARIES(gdcmTests vtkgdcm vtkRendering)
  59 ELSE(GDCM_VTK)
  60   TARGET_LINK_LIBRARIES(gdcmTests gdcm)
  61 ENDIF(GDCM_VTK)
  62
  63 SET (TestsToRun ${Tests})
  64 REMOVE (TestsToRun gdcmTests.cxx)
  65
  66 # Loop over files and create executables
  67 FOREACH(file ${TEST_SOURCES})
  68   GET_FILENAME_COMPONENT(name ${file} NAME_WE)
  69 #  IF (GDCM_DATA_ROOT)
  70 #    ADD_TEST(${name} ${GDCM_TESTS} ${name}
  71 #        -D ${GDCM_DATA_ROOT}
  72 #        -T ${GDCM_BINARY_DIR}/Testing/Temporary
  73 #        -V Baseline/gdcm/${name}.png)
  74 #  ELSE (GDCM_DATA_ROOT)
  75     ADD_TEST(${name} ${GDCM_TESTS} ${name})
  76 #  ENDIF (GDCM_DATA_ROOT)
  77 ENDFOREACH(file ${TEST_SOURCES})
  78
  79 #-----------------------------------------------------------------------------
  80
  81 # We need to test the reading of all dicom images in the gdcmData directory
  82 # First parse this directory and extract all images
  83
  84 IF(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
  85   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB
  86     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.acr"
  87     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.dcm"
  88     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.nema"
  89     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.ima"
  90     )
  91 ELSE(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
  92   # Since there is a bug in cmake 1.8.3, I'll have to do two separate globs
  93   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR
  94     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.acr"
  95     )
  96   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_DCM
  97     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.dcm"
  98     )
  99   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_NEMA
 100     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.nema"
 101     )
 102   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_IMA
 103     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.ima"
 104     )
 105   SET(GDCM_DATA_IMAGES_GLOB
 106     ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_DCM} ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR}
 107     ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_NEMA} ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_IMA})
 108   #SET(GDCM_DATA_IMAGES_GLOB  ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR})
 109 ENDIF(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
 110
 111 # Black list of images known to break lots of readers (efilm, xmedcon ...):
 112 SET(BLACK_LIST
 113   # serial killer (also segfaults vtkgdcmViewer, but NOT PrintFile)
 114   "gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm"
 115
 116   # Mathieu: temporarily remove as it kills my gnome session (but not kde)
 117   # JPR: also breaks TestReadWriteReadCompare : Pixel differ (as expanded
 118   #      in memory)
 119   "KODAK-12-MONO1-Odd_Terminated_Sequence.dcm"
 120   )
 121
 122 IF(APPLE)
 123   SET(BLACK_LIST ${BLACK_LIST}
 124     "SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr"  # This image contains a wrong length
 125     # Which led us to read pass the end of the file. This seg fault on MacOSX
 126     )
 127 ENDIF(APPLE)
 128
 129 # This is a GLOB expression, change it into a list separated with a comma and \n
 130 SET(GDCM_DATA_IMAGES)
 131 FOREACH(filename ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB})
 132   GET_FILENAME_COMPONENT(filename_temp ${filename} NAME)
 133   STRING(REGEX MATCH ${filename_temp} bad_dicom ${BLACK_LIST})
 134   IF(NOT bad_dicom)
 135     SET(GDCM_DATA_IMAGES "${GDCM_DATA_IMAGES}\n\"${filename_temp}\",")
 136   ENDIF(NOT bad_dicom)
 137 ENDFOREACH(filename)
 138
 139 # Populate GDCM_DATA_IMAGES:
 140 FILE(WRITE "${GDCM_BINARY_DIR}/gdcmDataImages.h"
 141   "const char * const gdcmDataImages[] = { ${GDCM_DATA_IMAGES}\n0 };\n"
 142   )