Testing/CMakeLists.txt

   1 # CMakeLists for Testing purpose
   2 # Cxx file that need a file to run should be place aproprietly
   3
   4 SET(CXX_TEST_PATH ${EXECUTABLE_OUTPUT_PATH})
   5
   6 SET(GDCM_TESTS ${CXX_TEST_PATH}/gdcmTests)
   7
   8 # add test that does not require data:
   9 # They usally return if no argument is given
  10 SET(TEST_SOURCES
  11   TestBug.cxx
  12   TestHash.cxx
  13   TestTS.cxx
  14   TestVR.cxx
  15   TestUtil.cxx
  16   TestDicomString.cxx
  17 )
  18
  19 # add tests that require data
  20 IF (GDCM_DATA_ROOT)
  21   SET(TEST_SOURCES ${TEST_SOURCES}
  22     TestReadWriteReadCompare.cxx     # includes generated gdcmDataImages.h
  23     PrintAllDocument.cxx             # includes generated gdcmDataImages.h
  24     TestAllReadCompareDicom.cxx      # includes generated gdcmDataImages.h
  25     TestAllEntryVerify.cxx           # includes generated gdcmDataImages.h
  26     PrintDicomDir.cxx
  27     #TestChangeHeader.cxx
  28     TestDicomDir.cxx                 # require DICOMDIR
  29     BuildUpDicomDir.cxx              # writes a file named "NewDICOMDIR"
  30     makeDicomDir.cxx                 # writes a file named "NewDICOMDIR"
  31     TestCopyDicom.cxx
  32     TestCopyRescaleDicom.cxx
  33   )
  34   # add test that require VTK:
  35   IF(GDCM_VTK)
  36     # Include the VTK library
  37     INCLUDE(${VTK_USE_FILE})
  38
  39     INCLUDE_DIRECTORIES(
  40       ${GDCM_SOURCE_DIR}/vtk/
  41       )
  42     SET(TEST_SOURCES ${TEST_SOURCES}
  43       ShowDicom.cxx
  44       )
  45   ENDIF(GDCM_VTK)
  46 ENDIF (GDCM_DATA_ROOT)
  47
  48
  49
  50 # include stuff
  51 INCLUDE_DIRECTORIES(
  52   ${GDCM_SOURCE_DIR}/src/
  53   ${GDCM_BINARY_DIR}/
  54 )
  55
  56 CREATE_TEST_SOURCELIST(Tests gdcmTests.cxx ${TEST_SOURCES})
  57 ADD_EXECUTABLE(gdcmTests ${Tests})
  58 IF(GDCM_VTK)
  59   TARGET_LINK_LIBRARIES(gdcmTests vtkgdcm vtkRendering)
  60 ELSE(GDCM_VTK)
  61   TARGET_LINK_LIBRARIES(gdcmTests gdcm)
  62 ENDIF(GDCM_VTK)
  63
  64 SET (TestsToRun ${Tests})
  65 REMOVE (TestsToRun gdcmTests.cxx)
  66
  67 # Loop over files and create executables
  68 FOREACH(file ${TEST_SOURCES})
  69   GET_FILENAME_COMPONENT(name ${file} NAME_WE)
  70 #  IF (GDCM_DATA_ROOT)
  71 #    ADD_TEST(${name} ${GDCM_TESTS} ${name}
  72 #        -D ${GDCM_DATA_ROOT}
  73 #        -T ${GDCM_BINARY_DIR}/Testing/Temporary
  74 #        -V Baseline/gdcm/${name}.png)
  75 #  ELSE (GDCM_DATA_ROOT)
  76     ADD_TEST(${name} ${GDCM_TESTS} ${name})
  77 #  ENDIF (GDCM_DATA_ROOT)
  78 ENDFOREACH(file ${TEST_SOURCES})
  79
  80 #-----------------------------------------------------------------------------
  81
  82 # We need to test the reading of all dicom images in the gdcmData directory
  83 # First parse this directory and extract all images
  84
  85 IF(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
  86   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB
  87     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.acr"
  88     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.dcm"
  89     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.nema"
  90     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.ima"
  91     )
  92 ELSE(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
  93   # Since there is a bug in cmake 1.8.3, I'll have to do two separate globs
  94   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR
  95     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.acr"
  96     )
  97   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_DCM
  98     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.dcm"
  99     )
 100   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_NEMA
 101     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.nema"
 102     )
 103   FILE(GLOB GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_IMA
 104     "${GDCM_DATA_ROOT}/*.ima"
 105     )
 106   SET(GDCM_DATA_IMAGES_GLOB
 107     ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_DCM} ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR}
 108     ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_NEMA} ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_IMA})
 109   #SET(GDCM_DATA_IMAGES_GLOB  ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB_ACR})
 110 ENDIF(${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION} GREATER 1.9)
 111
 112 # Black list of images known to break lots of readers (efilm, xmedcon ...):
 113 SET(BLACK_LIST
 114   # serial killer (also segfaults vtkgdcmViewer, but NOT PrintFile)
 115   "gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm"
 116
 117   # Mathieu: temporarily remove as it kills my gnome session (but not kde)
 118   # JPR: also breaks TestReadWriteReadCompare : Pixel differ (as expanded
 119   #      in memory)
 120   "KODAK-12-MONO1-Odd_Terminated_Sequence.dcm"
 121   )
 122
 123 IF(APPLE)
 124   SET(BLACK_LIST ${BLACK_LIST}
 125     "SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr"  # This image contains a wrong length
 126     # Which led us to read pass the end of the file. This seg fault on MacOSX
 127     )
 128 ENDIF(APPLE)
 129
 130 # This is a GLOB expression, change it into a list separated with a comma and \n
 131 SET(GDCM_DATA_IMAGES)
 132 FOREACH(filename ${GDCM_DATA_IMAGES_GLOB})
 133   GET_FILENAME_COMPONENT(filename_temp ${filename} NAME)
 134   STRING(REGEX MATCH ${filename_temp} bad_dicom ${BLACK_LIST})
 135   IF(NOT bad_dicom)
 136     SET(GDCM_DATA_IMAGES "${GDCM_DATA_IMAGES}\n\"${filename_temp}\",")
 137   ENDIF(NOT bad_dicom)
 138 ENDFOREACH(filename)
 139
 140 # Populate GDCM_DATA_IMAGES:
 141 FILE(WRITE "${GDCM_BINARY_DIR}/gdcmDataImages.h"
 142   "const char * const gdcmDataImages[] = { ${GDCM_DATA_IMAGES}\n0 };\n"
 143   )