Testing/TestAnonymize.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestAnonymize.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2008/09/15 15:49:21 $
   7   Version:   $Revision: 1.4 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "gdcmFileHelper.h"
  20 #include "gdcmGlobal.h"
  21 #include "gdcmDebug.h"
  22
  23 //Generated file:
  24 #include "gdcmDataImages.h"
  25
  26 #ifndef _WIN32
  27 #include <unistd.h> //for access, unlink
  28 #else
  29 #include <io.h> //for _access on Win32
  30 #endif
  31
  32
  33 bool FileExists(const char *filename);
  34 bool RemoveFile(const char *source);
  35
  36 // ---------------------------------------------------------
  37
  38 int Anonymize(std::string const &filename,
  39               std::string const &output )
  40 {
  41       std::cout << "   Testing: " << filename << std::endl;
  42
  43       if( FileExists( output.c_str() ) )
  44       {
  45          if( !RemoveFile( output.c_str() ) )
  46          {
  47             std::cout << "Ouch, the file exist, but I cannot remove it"
  48                       << std::endl;
  49             return 1;
  50          }
  51       }
  52
  53       //////////////// Step 1:
  54       std::cout << "      1...";
  55       std::cout << std::endl;
  56
  57       GDCM_NAME_SPACE::File *f;
  58       f = new GDCM_NAME_SPACE::File( );
  59       f->SetFileName( filename );
  60       f->Load();
  61
  62       std::cout << " ... Read !" << std::endl;
  63       // ============================================================
  64       //   Load the pixels in memory.
  65       //   Write a new file
  66       // ============================================================
  67
  68       // We need a GDCM_NAME_SPACE::FileHelper, since we want to load the pixels
  69       GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *fh = new GDCM_NAME_SPACE::FileHelper(f);
  70
  71       // --- Don't forget to load the Pixels ...
  72       // We shall not use them, but we have to load them
  73
  74       fh->GetImageData();
  75
  76       std::cout << " Image Data... Got ! " << std::endl;
  77
  78       // Institution name
  79       f->AddAnonymizeElement( 0x0008, 0x0080, "Xanadoo" );
  80       // Patient's name
  81       f->AddAnonymizeElement( 0x0010, 0x0010, "Fantomas" );
  82       // Patient's ID
  83       f->AddAnonymizeElement( 0x0010, 0x0020,"1515" );
  84       // Study Instance UID
  85       f->AddAnonymizeElement( 0x0020, 0x000d, "9.99.999.9999" );
  86       // Telephone
  87       f->AddAnonymizeElement( 0x0010, 0x2154, "3615" );
  88
  89       std::cout << " Anonymize list... Done ! " << std::endl;
  90
  91       f->AnonymizeFile();
  92
  93       std::cout << " Anonymize File... Done ! " << std::endl;
  94
  95       fh->WriteDcmExplVR(output);
  96       std::cout << " Anonymized File... Written ! " << std::endl;
  97
  98       f->ClearAnonymizeList();
  99       std::cout << " Anonymize list... Cleared ! " << std::endl;
 100
 101       delete f;
 102       delete fh;
 103
 104       // Read the file we just wrote
 105       f = new GDCM_NAME_SPACE::File( output );
 106
 107       std::cout << " Anonymized File... Re-Read ! " << std::endl;
 108
 109       std::string v;
 110       bool plouf = false;
 111
 112       // Compare and abort if different.
 113       v = f->GetEntryValue(0x0008, 0x0080);
 114       if ( v != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND )
 115          if (v.find("Xanadoo") >= v.length() )
 116             plouf = true;
 117
 118       v = f->GetEntryValue(0x0010, 0x0010);
 119       if ( v != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND )
 120          if (v.find("Fantomas") >= v.length() )
 121             plouf = true;
 122
 123       if ( v != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND )
 124          v = f->GetEntryValue(0x0010, 0x0020);
 125          if (v.find("1515") >= v.length() )
 126             plouf = true;
 127
 128        if ( v != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND )
 129          v = f->GetEntryValue(0x0010, 0x000d);
 130          if (v.find("9.99.999.9999") >= v.length() )
 131             plouf = true;
 132
 133       delete f;
 134
 135       if ( !plouf)
 136       {
 137          return 1;
 138       }
 139
 140
 141    // ============================================================
 142    //   Don't load the pixels in memory.
 143    //   Overwrite the file
 144    // ============================================================
 145
 146       // Read the file we just anonymize and check
 147
 148       f = new GDCM_NAME_SPACE::File( output );
 149
 150       // First, we set values to replace the ones we want to hide
 151
 152       // Patient's name
 153       f->AddAnonymizeElement(0x0010, 0x0010, "XXL");
 154       std::cout << " replace Patient's Name " << std::endl;
 155       // Patient's ID
 156       f->AddAnonymizeElement( 0x0010, 0x0020,"007" );
 157       std::cout << " replace Patient's ID " << std::endl;
 158       // Study Instance UID
 159       f->AddAnonymizeElement(0x0020, 0x000d, "6.66.666.6666" );
 160       std::cout << " replace Study ID " << std::endl;
 161
 162       // --------------------- we overwrite the file
 163
 164       // No need to load the pixels.
 165       // The GDCM_NAME_SPACE::File remains untouched in memory
 166
 167       std::cout <<"Let's AnonymizeNoLoad " << std::endl;;
 168       f->AnonymizeNoLoad();
 169
 170       std::cout <<"End AnonymizeNoLoad" << std::endl;
 171       // No need to write the File : modif were done on disc !
 172
 173       delete f;
 174       f = new GDCM_NAME_SPACE::File( output );
 175
 176       std::string val;
 177       plouf = false;
 178
 179       val = f->GetEntryValue(0x0010, 0x0010);
 180       if ( val != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND )
 181          if (val.find("XXL") >= v.length() )
 182             plouf = true;
 183
 184       if ( val != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND )
 185          val = f->GetEntryValue(0x0010, 0x0020);
 186          if (val.find("007") >= v.length() )
 187       plouf = true;
 188
 189       if ( val != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND )
 190          val = f->GetEntryValue(0x0010, 0x000d);
 191          if (val.find("6.66.666.6666") >= v.length() )
 192       plouf = true;
 193
 194       delete f;
 195
 196       if ( !plouf)
 197       {
 198          return 1;
 199       }
 200
 201       return 0; // no fail
 202 }
 203
 204 // Here we load a gdcmFile we anonymize it with and without loading the pixels,
 205
 206 int TestAnonymize(int argc, char *argv[])
 207 {
 208    //GDCM_NAME_SPACE::Debug::DebugOn();
 209
 210    if ( argc == 3 )
 211    {
 212       // The test is specified a specific filename, use it instead of looping
 213       // over all images
 214       const std::string input = argv[1];
 215       const std::string reference = argv[2];
 216       return Anonymize( input, reference );
 217    }
 218    else if ( argc > 3 || argc == 2 )
 219    {
 220       std::cout << "   Usage: " << argv[0]
 221                 << " (no arguments needed)." << std::endl;
 222       std::cout << "or   Usage: " << argv[0]
 223                 << " filename.dcm reference.dcm" << std::endl;
 224       return 1;
 225    }
 226    // else other cases:
 227
 228    std::cout << "   Description (Test::TestAnonymize): "
 229              << std::endl;
 230    std::cout << "   For all images in gdcmData (and not blacklisted in "
 231                 "Test/CMakeLists.txt)"
 232              << std::endl;
 233    std::cout << "   apply the following to each filename.xxx: "
 234              << std::endl;
 235    std::cout << "   - Create a new file "
 236              << std::endl;
 237    std::cout << "   - Anonymize the file (creates a new file) "
 238              << std::endl;
 239    std::cout << "   - Read this new file "
 240              << std::endl;
 241    std::cout << "   - Check if the written values are ok"
 242              << std::endl;
 243    std::cout << "   - AnonymizeNoLoad the new file (it s overwritten)"
 244              << std::endl;
 245    std::cout << "   - Check if the written values are ok"
 246              << std::endl;
 247    std::cout << std::endl;
 248
 249    int i =0;
 250    int retVal = 0;  //by default this is an error
 251    while( gdcmDataImages[i] != 0 )
 252    {
 253       std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
 254       filename += "/";  //doh!
 255       filename += gdcmDataImages[i];
 256
 257       std::string output = "output.dcm";
 258
 259       if( Anonymize( filename, output ) != 0 )
 260       {
 261          retVal++;
 262       }
 263       i++;
 264    }
 265    return retVal;
 266 }