Testing/TestCopyDicom.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestCopyDicom.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2007/10/30 09:13:45 $
   7   Version:   $Revision: 1.44 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "gdcmFileHelper.h"
  20 #include "gdcmDataEntry.h"
  21
  22 //Generated file:
  23 #include "gdcmDataImages.h"
  24
  25 // return true if the file exists
  26 bool FileExists(const char *filename);
  27 bool RemoveFile(const char *source);
  28
  29 int CopyDicom(std::string const &filename,
  30               std::string const &output )
  31 {
  32       std::cout << "   Testing: " << filename << std::endl;
  33       if( FileExists( output.c_str() ) )
  34       {
  35          if( !RemoveFile( output.c_str() ) )
  36          {
  37             std::cout << "Ouch, the file exist, but I cannot remove it" << std::endl;
  38             return 1;
  39          }
  40       }
  41
  42       //////////////// Step 1:
  43       std::cout << "      1...";
  44       GDCM_NAME_SPACE::File *originalH = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
  45       GDCM_NAME_SPACE::File *copyH     = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
  46
  47
  48       originalH->SetFileName( filename );
  49       originalH->Load( );
  50       //First of all copy the file, field by field
  51
  52       //////////////// Step 2:
  53       std::cout << "2...";
  54       GDCM_NAME_SPACE::DocEntry *d=originalH->GetFirstEntry();
  55       while(d)
  56       {
  57          if ( GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *de = dynamic_cast<GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *>(d) )
  58          {
  59             copyH->InsertEntryBinArea( de->GetBinArea(),de->GetLength(),
  60                                        de->GetGroup(),de->GetElement(),
  61                                        de->GetVR() );
  62          }
  63          else
  64          {
  65           // We skip pb of SQ recursive exploration
  66          }
  67
  68          d=originalH->GetNextEntry();
  69       }
  70       GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *original = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New(originalH);
  71       GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *copy     = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New(copyH);
  72
  73       size_t dataSize = original->GetImageDataSize();
  74       uint8_t *imageData = original->GetImageData();
  75
  76       // Useless to set the image data, because it's already made when
  77       // copying the corresponding DataEntry that contains the pixel data
  78
  79       // --> FIXME : Why do we let the following line?
  80       //             to avoid compile time warnings?
  81       copy->SetImageData(imageData, dataSize);
  82
  83       //////////////// Step 3:
  84       std::cout << "3...";
  85       copy->SetWriteModeToRGB();
  86       if( !copy->WriteDcmExplVR(output) )
  87       {
  88          std::cout << " Failed" << std::endl
  89                    << "       " << output << " not written" << std::endl;
  90
  91          original->Delete();
  92          copy->Delete();
  93          originalH->Delete();
  94          copyH->Delete();
  95
  96          return 1;
  97       }
  98
  99       copy->Delete();
 100       copyH->Delete();
 101
 102       //////////////// Step 4:
 103       std::cout << "4...";
 104 //      copy = new GDCM_NAME_SPACE::FileHelper( output );
 105       copy = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New(output);  // ???
 106       //Is the file written still gdcm parsable ?
 107       if ( !copy->GetFile()->IsReadable() )
 108       {
 109          std::cout << " Failed" << std::endl
 110                    << "        " << output << " not readable" << std::endl;
 111
 112          original->Delete();
 113          originalH->Delete();
 114
 115          return 1;
 116       }
 117
 118       //////////////// Step 5:
 119       std::cout << "5...";
 120       size_t    dataSizeWritten = copy->GetImageDataSize();
 121       uint8_t *imageDataWritten = copy->GetImageData();
 122
 123       if (dataSize != dataSizeWritten)
 124       {
 125          std::cout << " Failed" << std::endl
 126                    << "        Pixel areas lengths differ: "
 127                    << dataSize << " # " << dataSizeWritten << std::endl;
 128
 129          original->Delete();
 130          copy->Delete();
 131          originalH->Delete();
 132
 133          return 1;
 134       }
 135
 136       if (int res = memcmp(imageData, imageDataWritten, dataSize) !=0)
 137       {
 138          (void)res;
 139          std::cout << " Failed" << std::endl
 140                    << "        Pixel differ (as expanded in memory)." << std::endl;
 141
 142          original->Delete();
 143          copy->Delete();
 144          originalH->Delete();
 145
 146          return 1;
 147       }
 148       std::cout << "OK." << std::endl ;
 149
 150       original->Delete();
 151       copy->Delete();
 152       originalH->Delete();
 153
 154       return 0;
 155 }
 156
 157 // Here we load a gdcmFile and then try to create from scratch a copy of it,
 158 // copying field by field the dicom image
 159
 160 int TestCopyDicom(int argc, char *argv[])
 161 {
 162    if ( argc == 3 )
 163    {
 164       // The test is specified a specific filename, use it instead of looping
 165       // over all images
 166       const std::string input = argv[1];
 167       const std::string reference = argv[2];
 168       return CopyDicom( input, reference );
 169    }
 170    else if ( argc > 3 || argc == 2 )
 171    {
 172       std::cout << "   Usage: " << argv[0]
 173                 << " (no arguments needed)." << std::endl;
 174       std::cout << "or   Usage: " << argv[0]
 175                 << " filename.dcm reference.dcm" << std::endl;
 176       return 1;
 177    }
 178    // else other cases:
 179
 180    std::cout << "   Description (Test::TestCopyDicom): "
 181              << std::endl;
 182    std::cout << "   For all images in gdcmData (and not blacklisted in "
 183                 "Test/CMakeLists.txt)"
 184              << std::endl;
 185    std::cout << "   apply the following to each filename.xxx: "
 186              << std::endl;
 187    std::cout << "   step 1: parse the image (as gdcmFile) and call"
 188              << " IsReadable(). After that, call GetImageData() and "
 189              << "GetImageDataSize() "
 190              << std::endl;
 191    std::cout << "   step 2: create a copy of the readed file and the new"
 192              << " pixel data are set to the copy"
 193              << std::endl;
 194    std::cout << "   step 3: write the copy of the image"
 195              << std::endl;
 196    std::cout << "   step 4: read the copy and call IsReadable()"
 197              << std::endl;
 198    std::cout << "   step 5: compare (in memory with memcmp) that the two "
 199              << "images " << std::endl
 200              << "           match (as expanded by gdcm)." << std::endl;
 201    std::cout << std::endl;
 202
 203    int i =0;
 204    int retVal = 0;  //by default this is an error
 205    while( gdcmDataImages[i] != 0 )
 206    {
 207       std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
 208       filename += "/";  //doh!
 209       filename += gdcmDataImages[i];
 210
 211       std::string output = "output.dcm";
 212
 213       if( CopyDicom( filename, output ) != 0 )
 214       {
 215          retVal++;
 216       }
 217
 218       i++;
 219    }
 220    return retVal;
 221 }
 222