Testing/TestCopyDicom.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestCopyDicom.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/02/09 15:31:15 $
   7   Version:   $Revision: 1.40 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "gdcmFileHelper.h"
  20 #include "gdcmValEntry.h"
  21 #include "gdcmBinEntry.h"
  22
  23 //Generated file:
  24 #include "gdcmDataImages.h"
  25
  26 // return true if the file exists
  27 bool FileExists(const char *filename);
  28 bool RemoveFile(const char *source);
  29
  30 int CopyDicom(std::string const &filename,
  31               std::string const &output )
  32 {
  33       std::cout << "   Testing: " << filename << std::endl;
  34       if( FileExists( output.c_str() ) )
  35       {
  36          if( !RemoveFile( output.c_str() ) )
  37          {
  38             std::cout << "Ouch, the file exist, but I cannot remove it" << std::endl;
  39             return 1;
  40          }
  41       }
  42
  43       //////////////// Step 1:
  44       std::cout << "      1...";
  45       gdcm::File *originalH = new gdcm::File( filename );
  46       gdcm::File *copyH     = new gdcm::File( );
  47
  48       //First of all copy the file, field by field
  49
  50       //////////////// Step 2:
  51       std::cout << "2...";
  52       gdcm::DocEntry *d=originalH->GetFirstEntry();
  53       while(d)
  54       {
  55          if ( gdcm::BinEntry *b = dynamic_cast<gdcm::BinEntry*>(d) )
  56          {
  57             copyH->InsertBinEntry( b->GetBinArea(),b->GetLength(),
  58                                    b->GetGroup(),b->GetElement(),
  59                                    b->GetVR() );
  60          }
  61          else if ( gdcm::ValEntry *v = dynamic_cast<gdcm::ValEntry*>(d) )
  62          {
  63              copyH->InsertValEntry( v->GetValue(),
  64                                     v->GetGroup(),v->GetElement(),
  65                                     v->GetVR() );
  66          }
  67          else
  68          {
  69           // We skip pb of SQ recursive exploration
  70          }
  71
  72          d=originalH->GetNextEntry();
  73       }
  74
  75       gdcm::FileHelper *original = new gdcm::FileHelper( originalH );
  76       gdcm::FileHelper *copy     = new gdcm::FileHelper( copyH );
  77
  78       size_t dataSize = original->GetImageDataSize();
  79       uint8_t *imageData = original->GetImageData();
  80
  81       // Useless to set the image data, because it's already made when
  82       // copying the corresponding BinEntry that contains the pixel data
  83       copy->SetImageData(imageData, dataSize);
  84
  85       //////////////// Step 3:
  86       std::cout << "3...";
  87       copy->SetWriteModeToRGB();
  88       if( !copy->WriteDcmExplVR(output) )
  89       {
  90          std::cout << " Failed" << std::endl
  91                    << "       " << output << " not written" << std::endl;
  92
  93          delete original;
  94          delete copy;
  95          delete originalH;
  96          delete copyH;
  97
  98          return 1;
  99       }
 100
 101       delete copy;
 102       delete copyH;
 103
 104       //////////////// Step 4:
 105       std::cout << "4...";
 106       copy = new gdcm::FileHelper( output );
 107
 108       //Is the file written still gdcm parsable ?
 109       if ( !copy->GetFile()->IsReadable() )
 110       {
 111          std::cout << " Failed" << std::endl
 112                    << "        " << output << " not readable" << std::endl;
 113
 114          delete original;
 115          delete originalH;
 116
 117          return 1;
 118       }
 119
 120       //////////////// Step 5:
 121       std::cout << "5...";
 122       size_t    dataSizeWritten = copy->GetImageDataSize();
 123       uint8_t *imageDataWritten = copy->GetImageData();
 124
 125       if (dataSize != dataSizeWritten)
 126       {
 127          std::cout << " Failed" << std::endl
 128                    << "        Pixel areas lengths differ: "
 129                    << dataSize << " # " << dataSizeWritten << std::endl;
 130
 131          delete original;
 132          delete copy;
 133          delete originalH;
 134
 135          return 1;
 136       }
 137
 138       if (int res = memcmp(imageData, imageDataWritten, dataSize) !=0)
 139       {
 140          (void)res;
 141          std::cout << " Failed" << std::endl
 142                    << "        Pixel differ (as expanded in memory)." << std::endl;
 143
 144          delete original;
 145          delete copy;
 146          delete originalH;
 147
 148          return 1;
 149       }
 150       std::cout << "OK." << std::endl ;
 151
 152       delete original;
 153       delete copy;
 154       delete originalH;
 155
 156       return 0;
 157 }
 158
 159 // Here we load a gdcmFile and then try to create from scratch a copy of it,
 160 // copying field by field the dicom image
 161
 162 int TestCopyDicom(int argc, char *argv[])
 163 {
 164    if ( argc == 3 )
 165    {
 166       // The test is specified a specific filename, use it instead of looping
 167       // over all images
 168       const std::string input = argv[1];
 169       const std::string reference = argv[2];
 170       return CopyDicom( input, reference );
 171    }
 172    else if ( argc > 3 || argc == 2 )
 173    {
 174       std::cout << "   Usage: " << argv[0]
 175                 << " (no arguments needed)." << std::endl;
 176       std::cout << "or   Usage: " << argv[0]
 177                 << " filename.dcm reference.dcm" << std::endl;
 178       return 1;
 179    }
 180    // else other cases:
 181
 182    std::cout << "   Description (Test::TestCopyDicom): "
 183              << std::endl;
 184    std::cout << "   For all images in gdcmData (and not blacklisted in "
 185                 "Test/CMakeLists.txt)"
 186              << std::endl;
 187    std::cout << "   apply the following to each filename.xxx: "
 188              << std::endl;
 189    std::cout << "   step 1: parse the image (as gdcmFile) and call"
 190              << " IsReadable(). After that, call GetImageData() and "
 191              << "GetImageDataSize() "
 192              << std::endl;
 193    std::cout << "   step 2: create a copy of the readed file and the new"
 194              << " pixel data are set to the copy"
 195              << std::endl;
 196    std::cout << "   step 3: write the copy of the image"
 197              << std::endl;
 198    std::cout << "   step 4: read the copy and call IsReadable()"
 199              << std::endl;
 200    std::cout << "   step 5: compare (in memory with memcmp) that the two "
 201              << "images " << std::endl
 202              << "           match (as expanded by gdcm)." << std::endl;
 203    std::cout << std::endl;
 204
 205    int i =0;
 206    int retVal = 0;  //by default this is an error
 207    while( gdcmDataImages[i] != 0 )
 208    {
 209       std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
 210       filename += "/";  //doh!
 211       filename += gdcmDataImages[i];
 212
 213       std::string output = "output.dcm";
 214
 215       if( CopyDicom( filename, output ) != 0 )
 216       {
 217          retVal++;
 218       }
 219
 220       i++;
 221    }
 222    return retVal;
 223 }
 224