Testing/TestCopyDicom.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestCopyDicom.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2004/11/18 17:06:54 $
   7   Version:   $Revision: 1.18 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
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  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmHeader.h"
  19 #include "gdcmFile.h"
  20 #include "gdcmDocument.h"
  21 #include "gdcmValEntry.h"
  22 #include "gdcmBinEntry.h"
  23
  24 //Generated file:
  25 #include "gdcmDataImages.h"
  26
  27 #ifndef _WIN32
  28 #include <unistd.h> //for access, unlink
  29 #else
  30 #include <io.h> //for _access on Win32
  31 #endif
  32
  33 // return true if the file exists
  34 bool FileExists(const char* filename)
  35 {
  36 #ifdef _MSC_VER
  37 # define access _access
  38 #endif
  39 #ifndef R_OK
  40 # define R_OK 04
  41 #endif
  42   if ( access(filename, R_OK) != 0 )
  43     {
  44     return false;
  45     }
  46   else
  47     {
  48     return true;
  49     }
  50 }
  51
  52 bool RemoveFile(const char* source)
  53 {
  54 #ifdef _MSC_VER
  55 #define _unlink unlink
  56 #endif
  57   return unlink(source) != 0 ? false : true;
  58 }
  59
  60 // Here we load a gdcmFile and then try to create from scratch a copy of it,
  61 // copying field by field the dicom image
  62
  63 int TestCopyDicom(int , char* [])
  64 {
  65    int i =0;
  66    int retVal = 0;  //by default this is an error
  67    while( gdcmDataImages[i] != 0 )
  68    {
  69       std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
  70       filename += "/";  //doh!
  71       filename += gdcmDataImages[i];
  72       std::cerr << "Filename: " << filename << std::endl;
  73
  74       std::string output = "../Testing/Temporary/output.dcm";
  75
  76       if( FileExists( output.c_str() ) )
  77       {
  78         // std::cerr << "Don't try to cheat, I am removing the file anyway" << std::endl;
  79          if( !RemoveFile( output.c_str() ) )
  80          {
  81             std::cerr << "Ouch, the file exist, but I cannot remove it" << std::endl;
  82             return 1;
  83          }
  84       }
  85
  86       gdcm::File *original = new gdcm::File( filename );
  87       gdcm::File *copy = new gdcm::File( output );
  88
  89       const gdcm::TagDocEntryHT & Ht = original->GetHeader()->GetTagHT();
  90
  91       size_t dataSize = original->GetImageDataSize();
  92       uint8_t* imageData = original->GetImageData();
  93       (void)dataSize;  // To use the variable and not have warnings at compil.
  94       (void)imageData; // To use the variable and not have warnings at compil.
  95
  96       //First of all copy the header field by field
  97
  98       // Warning :Accessor gdcmElementSet::GetEntry() should not exist
  99       // It was commented out by Mathieu, that was a *good* idea
 100       // (the user does NOT have to know the way we implemented the Header !)
 101       // Waiting for a 'clean' solution, I keep the method ...JPRx
 102
 103       gdcm::DocEntry* d;
 104
 105       for (gdcm::TagDocEntryHT::const_iterator tag = Ht.begin(); tag != Ht.end(); ++tag)
 106       {
 107          d = tag->second;
 108          if ( gdcm::BinEntry* b = dynamic_cast<gdcm::BinEntry*>(d) )
 109          {
 110             copy->GetHeader()->ReplaceOrCreateByNumber(
 111                                  b->GetBinArea(),
 112                                  b->GetLength(),
 113                                  b->GetGroup(),
 114                                  b->GetElement(),
 115                                  b->GetVR() );
 116          }
 117          else if ( gdcm::ValEntry* v = dynamic_cast<gdcm::ValEntry*>(d) )
 118          {
 119              copy->GetHeader()->ReplaceOrCreateByNumber(
 120                                  v->GetValue(),
 121                                  v->GetGroup(),
 122                                  v->GetElement(),
 123                                  v->GetVR() );
 124          }
 125          else
 126          {
 127           // We skip pb of SQ recursive exploration
 128           //std::cout << "Skipped Sequence "
 129           //          << "------------- " << d->GetVR() << " "<< std::hex
 130           //          << d->GetGroup() << " " << d->GetElement()
 131           //  << std::endl;
 132          }
 133       }
 134
 135       // Useless to set the image datas, because it's already made when
 136       // copying the corresponding BinEntry that contains the pixel datas
 137       //copy->SetImageData(imageData, dataSize);
 138       original->GetHeader()->SetImageDataSize(dataSize);
 139
 140       copy->WriteDcmExplVR( output );
 141
 142       delete original;
 143       delete copy;
 144
 145       copy = new gdcm::File( output );
 146
 147       //Is the file written still gdcm parsable ?
 148       if ( !copy->GetHeader()->IsReadable() )
 149       {
 150          retVal +=1;
 151          std::cout << output << " Failed" << std::endl;
 152       }
 153       i++;
 154    }
 155    return retVal;
 156 }
 157