Testing/TestDicomDir.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestDicomDir.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/02/03 10:00:06 $
   7   Version:   $Revision: 1.38 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmDocEntry.h"
  19 #include "gdcmValEntry.h"
  20 #include "gdcmDicomDir.h"
  21 #include "gdcmDicomDirPatient.h"
  22 #include "gdcmDicomDirStudy.h"
  23 #include "gdcmDicomDirSerie.h"
  24 #include "gdcmDicomDirImage.h"
  25 #include "gdcmTS.h"
  26
  27 #include <iostream>
  28 #include <fstream>
  29
  30 // check *all* the dicom elements (gdcm::DocEntry)
  31 // of this gdcm::DicomDirObject
  32 int CompareSQItem(gdcm::SQItem *pa1, gdcm::SQItem *pa2 )
  33 {
  34    gdcm::DocEntry *e1;
  35    gdcm::DocEntry *e2;
  36
  37    e2 = pa2->GetFirstEntry();
  38    while (!e2)
  39    {
  40       // locate the corresponding element in 'source' file
  41       e1 = pa1->GetDocEntry( e2->GetGroup(),e2->GetElement() );
  42
  43       // an element doesn't exist in origin file
  44       if (!e1)
  45       {
  46        std::cout << "DicomDir element " << std::hex
  47                  << e2->GetGroup() << "," <<e2->GetElement() << std::endl;
  48        return 1;
  49       }
  50       // skip SeqEntries (I don't want to deal with 'recursion pbs' here)
  51       if ( !dynamic_cast<gdcm::ValEntry*>(e1) ||
  52            !dynamic_cast<gdcm::ValEntry*>(e2) )
  53          continue;
  54
  55       // a value is read as GDCM_UNFOUND
  56       if ( ((gdcm::ValEntry*)e1)->GetValue() == gdcm::GDCM_UNFOUND )
  57       {
  58          std::cout << "for gdcm source DicomDir : element (" << std::hex
  59                    << e1->GetGroup() << "," <<e1->GetElement()
  60                    << ") has values [" << gdcm::GDCM_UNFOUND << "]"
  61                    << std::endl;
  62          return 1;
  63       }
  64
  65       // values differ in source file and destination file
  66       if ( ((gdcm::ValEntry*)e1)->GetValue() !=
  67            ((gdcm::ValEntry*)e2)->GetValue() )
  68       {
  69
  70          // serious trouble : values differ in source and destination file
  71          std::cout << "for gdcm DicomDir element (" << std::hex
  72                    << e2->GetGroup() << "," <<e2->GetElement()
  73                    << ") values differ ["
  74                    << ((gdcm::ValEntry*)e1)->GetValue() << "] != ["
  75                    << ((gdcm::ValEntry*)e2)->GetValue() << "]"
  76                    << std::endl;
  77           return 1;
  78       }
  79    }
  80    return 0;
  81 }
  82
  83 int TestDicomDir(int argc, char *argv[])
  84 {
  85    gdcm::DicomDir *dicomdir;
  86
  87    gdcm::DicomDirPatient *pa1;
  88    gdcm::DicomDirStudy   *st1;
  89    gdcm::DicomDirSerie   *se1;
  90    gdcm::DicomDirImage   *im1;
  91
  92    gdcm::TSKey v;
  93
  94    std::string file;
  95    if (argc > 1)
  96       file = argv[1];
  97    else
  98    {
  99       file += GDCM_DATA_ROOT;
 100       file += "/DICOMDIR";
 101    }
 102
 103    dicomdir = new gdcm::DicomDir(file);
 104    if (argc > 2)
 105    {
 106       int level = atoi(argv[2]);
 107       dicomdir->SetPrintLevel(level);
 108    }
 109
 110    // Test if the DicomDir is readable
 111    if( !dicomdir->IsReadable() )
 112    {
 113       std::cout<<"          DicomDir '"<<file
 114                <<"' is not readable"<<std::endl
 115                <<"          ...Failed"<<std::endl;
 116
 117       delete dicomdir;
 118       return 1;
 119    }
 120    else
 121    {
 122       std::cout<<"          DicomDir '"<<file
 123                <<"' is readable"<<std::endl;
 124    }
 125
 126    // Test if the DicomDir contains any patient
 127    if( !dicomdir->GetFirstPatient() )
 128    {
 129       std::cout<<"          DicomDir '"<<file
 130                <<" has no patient"<<std::endl
 131                <<"          ...Failed"<<std::endl;
 132
 133       delete dicomdir;
 134       return 1;
 135    }
 136
 137    // step by step structure full exploitation
 138    std::cout << std::endl << std::endl
 139              << " = PATIENT/STUDY/SERIE/IMAGE List ============================"
 140              << std::endl<< std::endl;
 141
 142    pa1 = dicomdir->GetFirstPatient();
 143    while ( pa1 )
 144    {  // we process all the PATIENT of this DICOMDIR
 145       std::cout << pa1->GetEntryValue(0x0010, 0x0010) << std::endl; // Patient's Name
 146
 147       st1 = pa1->GetFirstStudy();
 148       while ( st1 )
 149       { // we process all the STUDY of this patient
 150          std::cout << "--- "<< st1->GetEntryValue(0x0008, 0x1030) // Study Description
 151          << std::endl;
 152          std::cout << " Stud.ID:[" << st1->GetEntryValue(0x0020, 0x0010) // Study ID
 153          << "]";
 154
 155          se1 = st1->GetFirstSerie();
 156          while ( se1 )
 157          { // we process all the SERIES of this study
 158             std::cout << "--- --- "<< se1->GetEntryValue(0x0008, 0x103e) << std::endl;      // Serie Description
 159             std::cout << " Ser.nb:["         <<  se1->GetEntryValue(0x0020, 0x0011);        // Series number
 160             std::cout << "] Mod.:["          <<  se1->GetEntryValue(0x0008, 0x0060) << "]"; // Modality
 161
 162             im1 = se1->GetFirstImage();
 163             while ( im1 ) { // we process all the IMAGE of this serie
 164                std::cout << "--- --- --- "<< im1->GetEntryValue(0x0004, 0x1500) << std::endl; // File name
 165                im1 = se1->GetNextImage();
 166             }
 167             se1 = st1->GetNextSerie();
 168          }
 169          st1 = pa1->GetNextStudy();
 170       }
 171       pa1 = dicomdir->GetNextPatient();
 172    }
 173
 174    std::cout << std::endl << std::endl
 175              << " = DICOMDIR full content ===================================="
 176              << std::endl<< std::endl;
 177   // dicomdir->Print();
 178
 179    // ------------------------- second stage ---------------------------
 180
 181    // Write on disc what we read
 182    dicomdir->WriteDicomDir("NewDICOMDIR");
 183
 184    std::cout << std::endl << std::endl
 185              << "NewDICOMDIR written on disc ================================="
 186              << std::endl<< std::endl;
 187   // Read what we wrote
 188    gdcm::DicomDir *d2 = new gdcm::DicomDir("NewDICOMDIR");
 189    if (!d2)
 190    {
 191       std::cout << std::endl << std::endl
 192                 << "Read NewDicomDir from disc failed ========================"
 193                 << std::endl<< std::endl;
 194       return 1;
 195    }
 196    std::cout << std::endl << std::endl
 197              << "NewDICOMDIR successfully read from disc ================================="
 198              << std::endl<< std::endl;
 199
 200    gdcm::DicomDirPatient *pa2;
 201    gdcm::DicomDirStudy   *st2;
 202    gdcm::DicomDirSerie   *se2;
 203    gdcm::DicomDirImage   *im2;
 204
 205    pa1 = dicomdir->GetFirstPatient();
 206    pa2 = d2->GetFirstPatient();
 207
 208    if (!d2)
 209    {
 210       std::cout << "NewDICOMDIR contains no Patient ?!?" << std::endl;
 211       delete dicomdir;
 212       delete d2;
 213       return 1;
 214    }
 215
 216    while ( pa1 && pa2 )
 217    {  // we process all the PATIENT of this DICOMDIR
 218
 219       if ( CompareSQItem(pa2,pa1) == 1 )
 220       {
 221          delete dicomdir;
 222          delete d2;
 223          return 1;
 224       }
 225
 226       // just to allow human reader to be sure ...
 227       std::cout << pa2->GetEntryValue(0x0010, 0x0010)
 228                 << std::endl; // Patient's Name
 229
 230       st1 = pa1->GetFirstStudy();
 231       st2 = pa2->GetFirstStudy();
 232
 233       while ( st1 && st2 )
 234       {
 235          if ( CompareSQItem(st2,st1) == 1 )
 236          {
 237             delete dicomdir;
 238             delete d2;
 239             return 1;
 240          }
 241
 242          // just to allow human reader to be sure ...
 243          std::cout << "--- "<< st2->GetEntryValue(0x0008, 0x1030);
 244          // << std::endl;    // Study Description
 245          std::cout << " Stud.ID:["
 246                    << st2->GetEntryValue(0x0020, 0x0010)
 247                    << "]" << std::endl; // Study ID
 248
 249          se1 = st1->GetFirstSerie();
 250          se2 = st2->GetFirstSerie();
 251
 252          while ( se1 && se2 )
 253          { // we process all the SERIE of this study
 254             if ( CompareSQItem(se2,se1) == 1 )
 255               return 1;
 256             std::cout << "--- --- " << se2->GetEntryValue(0x0008, 0x103e);      // Serie Description
 257             std::cout << " Ser.nb:["<< se2->GetEntryValue(0x0020, 0x0011);        // Series number
 258             std::cout << "] Mod.:[" << se2->GetEntryValue(0x0008, 0x0060) << "]" << std::endl; // Modality
 259             im1 = se1->GetFirstImage();
 260             im2 = se2->GetFirstImage();
 261
 262             while ( im1 && im2 ) // we process all the IMAGE of this serie
 263             {
 264                if ( CompareSQItem(im2,im1) == 1 )
 265                {
 266                   delete dicomdir;
 267                   delete d2;
 268                   return 1;
 269                }
 270
 271                im1 = se1->GetNextImage();
 272                im2 = se2->GetNextImage();
 273             }
 274             se1 = st1->GetNextSerie();
 275             se2 = st2->GetNextSerie();
 276          }
 277          st1 = pa1->GetNextStudy();
 278          st2 = pa2->GetNextStudy();
 279       }
 280       pa1 = dicomdir->GetNextPatient();
 281       pa2 = dicomdir->GetNextPatient();
 282    }
 283
 284    std::cout << std::flush;
 285    delete dicomdir;
 286    delete d2;
 287
 288    return 0;
 289 }