Testing/TestDicomDir.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestDicomDir.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2007/03/23 15:03:01 $
   7   Version:   $Revision: 1.44 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmDocEntry.h"
  19 #include "gdcmDataEntry.h"
  20 #include "gdcmDicomDir.h"
  21 #include "gdcmDicomDirPatient.h"
  22 #include "gdcmDicomDirStudy.h"
  23 #include "gdcmDicomDirSerie.h"
  24 #include "gdcmDicomDirImage.h"
  25 #include "gdcmTS.h"
  26
  27 #include <iostream>
  28 #include <fstream>
  29
  30 #include <stdlib.h>
  31
  32 // check *all* the dicom elements (gdcm::DocEntry)
  33 // of this gdcm::DicomDirObject
  34 int CompareSQItem(gdcm::SQItem *pa1, gdcm::SQItem *pa2 )
  35 {
  36    gdcm::DocEntry *e1;
  37    gdcm::DocEntry *e2;
  38
  39    e2 = pa2->GetFirstEntry();
  40    while (!e2)
  41    {
  42       // locate the corresponding element in 'source' file
  43       e1 = pa1->GetDocEntry( e2->GetGroup(),e2->GetElement() );
  44
  45       // an element doesn't exist in origin file
  46       if (!e1)
  47       {
  48        std::cout << "DicomDir element " << std::hex
  49                  << e2->GetGroup() << "," <<e2->GetElement() << std::endl;
  50        return 1;
  51       }
  52       // skip SeqEntries (I don't want to deal with 'recursion pbs' here)
  53       if ( !dynamic_cast<gdcm::DataEntry *>(e1) ||
  54            !dynamic_cast<gdcm::DataEntry *>(e2) )
  55          continue;
  56
  57       // a value is read as GDCM_UNFOUND
  58       if ( ((gdcm::DataEntry *)e1)->GetString() == gdcm::GDCM_UNFOUND )
  59       {
  60          std::cout << "for gdcm source DicomDir : element (" << std::hex
  61                    << e1->GetGroup() << "," <<e1->GetElement()
  62                    << ") has values [" << gdcm::GDCM_UNFOUND << "]"
  63                    << std::endl;
  64          return 1;
  65       }
  66
  67       // values differ in source file and destination file
  68       if ( ((gdcm::DataEntry *)e1)->GetString() !=
  69            ((gdcm::DataEntry *)e2)->GetString() )
  70       {
  71
  72  /// \todo : check the value *written on disc*, not the value converted as a std::string
  73  ///         (this comparison doesn't make the difference between Ox(ff) and "255" ...)
  74
  75          // serious trouble : values differ in source and destination file
  76          std::cout << "for gdcm DicomDir element (" << std::hex
  77                    << e2->GetGroup() << "," <<e2->GetElement()
  78                    << ") values differ ["
  79                    << ((gdcm::DataEntry *)e1)->GetString() << "] != ["
  80                    << ((gdcm::DataEntry *)e2)->GetString() << "]"
  81                    << std::endl;
  82           return 1;
  83       }
  84    }
  85    return 0;
  86 }
  87
  88 int TestDicomDir(int argc, char *argv[])
  89 {
  90    gdcm::DicomDir *dicomdir;
  91
  92    gdcm::DicomDirPatient *pa1;
  93    gdcm::DicomDirStudy   *st1;
  94    gdcm::DicomDirSerie   *se1;
  95    gdcm::DicomDirImage   *im1;
  96
  97    gdcm::TSKey v;
  98
  99    std::string file;
 100    if (argc > 1)
 101       file = argv[1];
 102    else
 103    {
 104       file += GDCM_DATA_ROOT;
 105       file += "/DICOMDIR";
 106    }
 107
 108    dicomdir = gdcm::DicomDir::New();
 109    dicomdir->SetFileName(file);
 110    dicomdir->Load();
 111    if (argc > 2)
 112    {
 113       int level = atoi(argv[2]);
 114       dicomdir->SetPrintLevel(level);
 115    }
 116
 117    // Test if the DICOMDIR file is readable
 118    if( !dicomdir->IsReadable() )
 119    {
 120       std::cout<<"          DicomDir '"<<file
 121                <<"' is not readable"<<std::endl
 122                <<"          ...Failed"<<std::endl;
 123
 124       dicomdir->Delete();
 125       return 1;
 126    }
 127    else
 128    {
 129       std::cout<<"          DicomDir '"<<file
 130                <<"' is readable"<<std::endl;
 131    }
 132
 133    // Test if the gdcm::DicomDir contains any patient
 134    if( !dicomdir->GetFirstPatient() )
 135    {
 136       std::cout<<"          DicomDir '"<<file
 137                <<" has no patient"<<std::endl
 138                <<"          ...Failed"<<std::endl;
 139
 140       dicomdir->Delete();
 141       return 1;
 142    }
 143
 144    // step by step structure full exploitation
 145    std::cout << std::endl << std::endl
 146              << " = PATIENT/STUDY/SERIE/IMAGE List ============================"
 147              << std::endl<< std::endl;
 148
 149    pa1 = dicomdir->GetFirstPatient();
 150    while ( pa1 )
 151    {  // we process all the PATIENT of this gdcm::DicomDir
 152       std::cout << pa1->GetEntryString(0x0010, 0x0010) << std::endl; // Patient's Name
 153
 154       st1 = pa1->GetFirstStudy();
 155       while ( st1 )
 156       { // we process all the STUDY of this patient
 157          std::cout << "--- "<< st1->GetEntryString(0x0008, 0x1030) // Study Description
 158          << std::endl;
 159          std::cout << " Stud.ID:[" << st1->GetEntryString(0x0020, 0x0010) // Study ID
 160          << "]";
 161
 162          se1 = st1->GetFirstSerie();
 163          while ( se1 )
 164          { // we process all the SERIES of this study
 165             std::cout << "--- --- "<< se1->GetEntryString(0x0008, 0x103e) << std::endl;      // Serie Description
 166             std::cout << " Ser.nb:["         <<  se1->GetEntryString(0x0020, 0x0011);        // Series number
 167             std::cout << "] Mod.:["          <<  se1->GetEntryString(0x0008, 0x0060) << "]"; // Modality
 168
 169             im1 = se1->GetFirstImage();
 170             while ( im1 ) { // we process all the IMAGE of this serie
 171                std::cout << "--- --- --- "<< im1->GetEntryString(0x0004, 0x1500) << std::endl; // File name
 172                im1 = se1->GetNextImage();
 173             }
 174             se1 = st1->GetNextSerie();
 175          }
 176          st1 = pa1->GetNextStudy();
 177       }
 178       pa1 = dicomdir->GetNextPatient();
 179    }
 180
 181    std::cout << std::endl << std::endl
 182              << " = DICOMDIR full content ===================================="
 183              << std::endl<< std::endl;
 184   // dicomdir->Print();
 185
 186    // ------------------------- second stage ---------------------------
 187
 188    // Write on disc what we read
 189    dicomdir->Write("NewDICOMDIR");
 190
 191    std::cout << std::endl << std::endl
 192              << "NewDICOMDIR written on disc ================================="
 193              << std::endl<< std::endl;
 194   // Read what we wrote
 195    gdcm::DicomDir *d2 = gdcm::DicomDir::New();
 196    d2->SetFileName("NewDICOMDIR");
 197    d2->Load();
 198    if (!d2->IsReadable())
 199    {
 200       std::cout << std::endl << std::endl
 201                 << "Read NewDicomDir from disc failed ========================"
 202                 << std::endl<< std::endl;
 203       return 1;
 204    }
 205    std::cout << std::endl << std::endl
 206              << "NewDICOMDIR successfully read from disc ================================="
 207              << std::endl<< std::endl;
 208
 209    gdcm::DicomDirPatient *pa2;
 210    gdcm::DicomDirStudy   *st2;
 211    gdcm::DicomDirSerie   *se2;
 212    gdcm::DicomDirImage   *im2;
 213
 214    pa1 = dicomdir->GetFirstPatient();
 215    pa2 = d2->GetFirstPatient();
 216
 217    if (!d2)
 218    {
 219       std::cout << "NewDICOMDIR contains no Patient ?!?" << std::endl;
 220       dicomdir->Delete();
 221       d2->Delete();
 222       return 1;
 223    }
 224
 225    while ( pa1 && pa2 )
 226    {  // we process all the PATIENT of this DICOMDIR
 227
 228       if ( CompareSQItem(pa2,pa1) == 1 )
 229       {
 230          dicomdir->Delete();
 231          d2->Delete();
 232          return 1;
 233       }
 234
 235       // just to allow human reader to be sure ...
 236       std::cout << pa2->GetEntryString(0x0010, 0x0010)
 237                 << std::endl; // Patient's Name
 238
 239       st1 = pa1->GetFirstStudy();
 240       st2 = pa2->GetFirstStudy();
 241
 242       while ( st1 && st2 )
 243       {
 244          if ( CompareSQItem(st2,st1) == 1 )
 245          {
 246             dicomdir->Delete();
 247             d2->Delete();
 248             return 1;
 249          }
 250
 251          // just to allow human reader to be sure ...
 252          std::cout << "--- "<< st2->GetEntryString(0x0008, 0x1030);
 253          // << std::endl;    // Study Description
 254          std::cout << " Stud.ID:["
 255                    << st2->GetEntryString(0x0020, 0x0010)
 256                    << "]" << std::endl; // Study ID
 257
 258          se1 = st1->GetFirstSerie();
 259          se2 = st2->GetFirstSerie();
 260
 261          while ( se1 && se2 )
 262          { // we process all the SERIE of this study
 263             if ( CompareSQItem(se2,se1) == 1 )
 264               return 1;
 265
 266             std::cout << "--- --- " << se2->GetEntryString(0x0008, 0x103e);      // Serie Description
 267             std::cout << " Ser.nb:["<< se2->GetEntryString(0x0020, 0x0011);        // Series number
 268             std::cout << "] Mod.:[" << se2->GetEntryString(0x0008, 0x0060) << "]" << std::endl; // Modality
 269             im1 = se1->GetFirstImage();
 270             im2 = se2->GetFirstImage();
 271
 272             while ( im1 && im2 ) // we process all the IMAGE of this serie
 273             {
 274                if ( CompareSQItem(im2,im1) == 1 )
 275                {
 276                   dicomdir->Delete();
 277                   d2->Delete();
 278                   return 1;
 279                }
 280
 281                im1 = se1->GetNextImage();
 282                im2 = se2->GetNextImage();
 283             }
 284             se1 = st1->GetNextSerie();
 285             se2 = st2->GetNextSerie();
 286          }
 287          st1 = pa1->GetNextStudy();
 288          st2 = pa2->GetNextStudy();
 289       }
 290       pa1 = dicomdir->GetNextPatient();
 291       pa2 = dicomdir->GetNextPatient();
 292    }
 293
 294    std::cout << std::flush;
 295    dicomdir->Delete();
 296    d2->Delete();
 297
 298    return 0;
 299 }