Testing/TestReadWriteReadCompare.cxx

   1 #include "gdcmHeader.h"
   2 #include "gdcmFile.h"
   3
   4 //Generated file:
   5 #include "gdcmDataImages.h"
   6
   7 int CompareInternal(std::string const & filename, std::string const & output)
   8 {
   9    std::cout << "   Testing: " << filename << std::endl;
  10
  11    //////////////// Step 1 (see above description):
  12
  13    gdcm::Header *header = new gdcm::Header( filename );
  14    if( !header->IsReadable() )
  15    {
  16       std::cerr << "Test::TestReadWriteReadCompare: Image not gdcm compatible:"
  17                 << filename << std::endl;
  18       delete header;
  19       return 1;
  20    }
  21    std::cout << "           step 1 ...";
  22
  23    //////////////// Step 2:
  24
  25    gdcm::File*  file = new gdcm::File( header );
  26    int dataSize    = file->GetImageDataSize();
  27    uint8_t* imageData = file->GetImageData(); //EXTREMELY IMPORTANT
  28           // Sure, it is : It's up to the user to decide if he wants to
  29           // GetImageData or if he wants to GetImageDataRaw
  30           // (even if we do it by setting a flag, he will have to decide)
  31
  32    /// \todo Following line commented out because gdcmFile::SetImageData() is
  33    /// brain dead: it sets ImageDataSize to its argument and PixelRead to a.
  34    /// Later on, when writing gdcmFile::WriteBase()
  35    /// and because PixelRead == 1 we call
  36    ///    PixelElement->SetLength( ImageDataSizeRaw );
  37    /// where we use ImageDataSizeRAW instead of ImageDataSize !
  38    /// But when the original image made the transformation LUT -> RGB,
  39    /// ImageDataSizeRaw is the third of ImageDataSize, and there is no
  40    /// reason (since we called gdcmFile::SetImageData) to use the Raw image
  41    /// size... This "bug" in gdcmFile made that we had to black list
  42    /// images 8BitsUncompressedColor.dcm, OT-PAL-8-face.dcm and
  43    /// US-PAL-8-10x-echo.dcm...
  44    /// In conclusion fix gdcmFile, and then uncomment the following line.
  45
  46    // --> I did. ctest doesn't break. But ... is it enought to say it's OK ?
  47
  48    file->SetImageData(imageData, dataSize);
  49
  50    file->WriteDcmExplVR( output );
  51    std::cout << "2...";
  52
  53    //////////////// Step 3:
  54
  55    gdcm::File* reread = new gdcm::File( output );
  56    if( !reread->GetHeader()->IsReadable() )
  57    {
  58      std::cerr << "Test::TestReadWriteReadCompare: Could not reread image "
  59                << "written:" << filename << std::endl;
  60      delete header;
  61      delete file;
  62      delete reread;
  63      return 1;
  64    }
  65    std::cout << "3...";
  66    // For the next step:
  67    int    dataSizeWritten = reread->GetImageDataSize();
  68    void* imageDataWritten = reread->GetImageData();
  69
  70    //////////////// Step 4:
  71
  72    if (dataSize != dataSizeWritten)
  73    {
  74       std::cout << std::endl
  75          << "        Pixel areas lengths differ: "
  76          << dataSize << " # " << dataSizeWritten << std::endl;
  77       delete[] (char*)imageData;
  78       delete[] (char*)imageDataWritten;
  79       delete header;
  80       delete file;
  81       delete reread;
  82       return 1;
  83    }
  84
  85    if (int res = memcmp(imageData, imageDataWritten, dataSize) !=0)
  86    {
  87       (void)res;
  88       std::cout << std::endl
  89          << "        Pixel differ (as expanded in memory)." << std::endl;
  90       delete[] (char*)imageData;
  91       delete[] (char*)imageDataWritten;
  92       delete header;
  93       delete file;
  94       delete reread;
  95       return 1;
  96    }
  97    std::cout << "4...OK." << std::endl ;
  98
  99    //////////////// Clean up:
 100    delete[] (char*)imageData;
 101    delete[] (char*)imageDataWritten;
 102    delete header;
 103    delete file;
 104    delete reread;
 105
 106    return 0;
 107 }
 108
 109 int TestReadWriteReadCompare(int argc, char* argv[])
 110 {
 111    int result = 0;
 112    if (argc == 3)
 113    {
 114       const std::string input = argv[1];
 115       const std::string output = argv[2];
 116       result += CompareInternal(input, output);
 117    }
 118    else if( argc > 3 || argc == 2 )
 119    {
 120       std::cerr << "Please read the manual" << std::endl;
 121    }
 122    else
 123    {
 124       std::cout<< "Test::TestReadWriteReadCompare: description " << std::endl;
 125       std::cout << "   For all images in gdcmData (and not blacklisted in "
 126                    "Test/CMakeLists.txt)" << std::endl;
 127       std::cout << "   apply the following multistep test: " << std::endl;
 128       std::cout << "   step 1: parse the image (as gdcmHeader) and call"
 129                 << " IsReadable(). " << std::endl;
 130       std::cout << "   step 2: write the corresponding image in DICOM V3 "
 131                 << "with explicit" << std::endl
 132                 << "           Value Representation in temporary file "
 133                 << "TestReadWriteReadCompare.dcm." << std::endl;
 134       std::cout << "   step 3: read the image written on step2 and call "
 135                 << " IsReadable(). " << std::endl;
 136       std::cout << "   step 4: compare (in memory with memcmp) that the two "
 137                 << "images " << std::endl
 138                 << "           match (as expanded by gdcm)." << std::endl;
 139
 140       int i = 0;
 141       while( gdcmDataImages[i] != 0 )
 142       {
 143          std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
 144          filename += "/";
 145          filename += gdcmDataImages[i++];
 146          result += CompareInternal(filename, "TestReadWriteReadCompare.dcm");
 147       }
 148    }
 149    return result;
 150 }