Testing/TestReadWriteReadCompare.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestReadWriteReadCompare.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/01/20 16:16:59 $
   7   Version:   $Revision: 1.18 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmHeader.h"
  19 #include "gdcmFile.h"
  20
  21 //Generated file:
  22 #include "gdcmDataImages.h"
  23
  24 int CompareInternal(std::string const & filename, std::string const & output)
  25 {
  26    std::cout << "   Testing: " << filename << std::endl;
  27
  28    //////////////// Step 1 (see above description):
  29
  30    gdcm::Header *header = new gdcm::Header( filename );
  31    if( !header->IsReadable() )
  32    {
  33       std::cerr << "Test::TestReadWriteReadCompare: Image not gdcm compatible:"
  34                 << filename << std::endl;
  35       delete header;
  36       return 1;
  37    }
  38    std::cout << "           step 1...";
  39
  40    //////////////// Step 2:
  41
  42    gdcm::FileHelper*  file = new gdcm::FileHelper( header );
  43    int dataSize    = file->GetImageDataSize();
  44    uint8_t* imageData = file->GetImageData(); //EXTREMELY IMPORTANT
  45           // Sure, it is : It's up to the user to decide if he wants to
  46           // GetImageData or if he wants to GetImageDataRaw
  47           // (even if we do it by setting a flag, he will have to decide)
  48
  49    /// \todo Following line commented out because gdcmFile::SetImageData() is
  50    /// brain dead: it sets ImageDataSize to its argument and PixelRead to a.
  51    /// Later on, when writing gdcmFile::WriteBase()
  52    /// and because PixelRead == 1 we call
  53    ///    PixelElement->SetLength( ImageDataSizeRaw );
  54    /// where we use ImageDataSizeRAW instead of ImageDataSize !
  55    /// But when the original image made the transformation LUT -> RGB,
  56    /// ImageDataSizeRaw is the third of ImageDataSize, and there is no
  57    /// reason (since we called gdcmFile::SetImageData) to use the Raw image
  58    /// size... This "bug" in gdcmFile made that we had to black list
  59    /// images 8BitsUncompressedColor.dcm, OT-PAL-8-face.dcm and
  60    /// US-PAL-8-10x-echo.dcm...
  61    /// In conclusion fix gdcmFile, and then uncomment the following line.
  62
  63    // --> I did. ctest doesn't break. But ... is it enought to say it's OK ?
  64
  65    file->SetImageData(imageData, dataSize);
  66
  67    file->SetWriteModeToRGB();
  68    file->WriteDcmExplVR( output );
  69    std::cout << "2...";
  70
  71    //////////////// Step 3:
  72
  73    gdcm::FileHelper* reread = new gdcm::FileHelper( output );
  74    if( !reread->GetHeader()->IsReadable() )
  75    {
  76      std::cerr << "Failed" << std::endl
  77                << "Test::TestReadWriteReadCompare: Could not reread image "
  78                << "written:" << filename << std::endl;
  79      delete header;
  80      delete file;
  81      delete reread;
  82      return 1;
  83    }
  84    std::cout << "3...";
  85    // For the next step:
  86    int    dataSizeWritten = reread->GetImageDataSize();
  87    uint8_t* imageDataWritten = reread->GetImageData();
  88
  89    //////////////// Step 4:
  90    // Test the image size
  91    if (header->GetXSize() != reread->GetHeader()->GetXSize() ||
  92        header->GetYSize() != reread->GetHeader()->GetYSize() ||
  93        header->GetZSize() != reread->GetHeader()->GetZSize())
  94    {
  95       std::cout << "Failed" << std::endl
  96          << "        X Size differs: "
  97          << "X: " << header->GetXSize() << " # "
  98                   << reread->GetHeader()->GetXSize() << " | "
  99          << "Y: " << header->GetYSize() << " # "
 100                   << reread->GetHeader()->GetYSize() << " | "
 101          << "Z: " << header->GetZSize() << " # "
 102                   << reread->GetHeader()->GetZSize() << std::endl;
 103       delete header;
 104       delete file;
 105       delete reread;
 106       return 1;
 107    }
 108
 109    // Test the data size
 110    if (dataSize != dataSizeWritten)
 111    {
 112       std::cout << "Failed" << std::endl
 113          << "        Pixel areas lengths differ: "
 114          << dataSize << " # " << dataSizeWritten << std::endl;
 115       delete header;
 116       delete file;
 117       delete reread;
 118       return 1;
 119    }
 120
 121    // Test the data's content
 122    if (int res = memcmp(imageData, imageDataWritten, dataSize) !=0)
 123    {
 124       (void)res;
 125       std::cout << "Failed" << std::endl
 126          << "        Pixel differ (as expanded in memory)." << std::endl;
 127       delete header;
 128       delete file;
 129       delete reread;
 130       return 1;
 131    }
 132    std::cout << "4...OK." << std::endl ;
 133
 134    //////////////// Clean up:
 135    delete header;
 136    delete file;
 137    delete reread;
 138
 139    return 0;
 140 }
 141
 142 int TestReadWriteReadCompare(int argc, char* argv[])
 143 {
 144    int result = 0;
 145    if (argc == 3)
 146    {
 147       const std::string input = argv[1];
 148       const std::string output = argv[2];
 149       result += CompareInternal(input, output);
 150    }
 151    else if( argc > 3 || argc == 2 )
 152    {
 153       std::cerr << "Please read the manual" << std::endl;
 154    }
 155    else
 156    {
 157       std::cout<< "Test::TestReadWriteReadCompare: description " << std::endl;
 158       std::cout << "   For all images in gdcmData (and not blacklisted in "
 159                    "Test/CMakeLists.txt)" << std::endl;
 160       std::cout << "   apply the following multistep test: " << std::endl;
 161       std::cout << "   step 1: parse the image (as gdcmHeader) and call"
 162                 << " IsReadable(). " << std::endl;
 163       std::cout << "   step 2: write the corresponding image in DICOM V3 "
 164                 << "with explicit" << std::endl
 165                 << "           Value Representation in temporary file "
 166                 << "TestReadWriteReadCompare.dcm." << std::endl;
 167       std::cout << "   step 3: read the image written on step2 and call "
 168                 << " IsReadable(). " << std::endl;
 169       std::cout << "   step 4: compare (in memory with memcmp) that the two "
 170                 << "images " << std::endl
 171                 << "           match (as expanded by gdcm)." << std::endl;
 172
 173       int i = 0;
 174       while( gdcmDataImages[i] != 0 )
 175       {
 176          std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
 177          filename += "/";
 178          filename += gdcmDataImages[i++];
 179          result += CompareInternal(filename, "TestReadWriteReadCompare.dcm");
 180       }
 181    }
 182    return result;
 183 }