Testing/TestReadWriteReadCompare.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestReadWriteReadCompare.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2004/11/16 04:28:20 $
   7   Version:   $Revision: 1.13 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmHeader.h"
  19 #include "gdcmFile.h"
  20
  21 //Generated file:
  22 #include "gdcmDataImages.h"
  23
  24 int CompareInternal(std::string const & filename, std::string const & output)
  25 {
  26    std::cout << "   Testing: " << filename << std::endl;
  27
  28    //////////////// Step 1 (see above description):
  29
  30    gdcm::Header *header = new gdcm::Header( filename );
  31    if( !header->IsReadable() )
  32    {
  33       std::cerr << "Test::TestReadWriteReadCompare: Image not gdcm compatible:"
  34                 << filename << std::endl;
  35       delete header;
  36       return 1;
  37    }
  38    std::cout << "           step 1 ...";
  39
  40    //////////////// Step 2:
  41
  42    gdcm::File*  file = new gdcm::File( header );
  43    int dataSize    = file->GetImageDataSize();
  44    uint8_t* imageData = file->GetImageData(); //EXTREMELY IMPORTANT
  45           // Sure, it is : It's up to the user to decide if he wants to
  46           // GetImageData or if he wants to GetImageDataRaw
  47           // (even if we do it by setting a flag, he will have to decide)
  48
  49    /// \todo Following line commented out because gdcmFile::SetImageData() is
  50    /// brain dead: it sets ImageDataSize to its argument and PixelRead to a.
  51    /// Later on, when writing gdcmFile::WriteBase()
  52    /// and because PixelRead == 1 we call
  53    ///    PixelElement->SetLength( ImageDataSizeRaw );
  54    /// where we use ImageDataSizeRAW instead of ImageDataSize !
  55    /// But when the original image made the transformation LUT -> RGB,
  56    /// ImageDataSizeRaw is the third of ImageDataSize, and there is no
  57    /// reason (since we called gdcmFile::SetImageData) to use the Raw image
  58    /// size... This "bug" in gdcmFile made that we had to black list
  59    /// images 8BitsUncompressedColor.dcm, OT-PAL-8-face.dcm and
  60    /// US-PAL-8-10x-echo.dcm...
  61    /// In conclusion fix gdcmFile, and then uncomment the following line.
  62
  63    // --> I did. ctest doesn't break. But ... is it enought to say it's OK ?
  64
  65    file->SetImageData(imageData, dataSize);
  66
  67    file->WriteDcmExplVR( output );
  68    std::cout << "2...";
  69
  70    //////////////// Step 3:
  71
  72    gdcm::File* reread = new gdcm::File( output );
  73    if( !reread->GetHeader()->IsReadable() )
  74    {
  75      std::cerr << "Test::TestReadWriteReadCompare: Could not reread image "
  76                << "written:" << filename << std::endl;
  77      delete header;
  78      delete file;
  79      delete reread;
  80      return 1;
  81    }
  82    std::cout << "3...";
  83    // For the next step:
  84    int    dataSizeWritten = reread->GetImageDataSize();
  85    uint8_t* imageDataWritten = reread->GetImageData();
  86
  87    //////////////// Step 4:
  88
  89    if (dataSize != dataSizeWritten)
  90    {
  91       std::cout << std::endl
  92          << "        Pixel areas lengths differ: "
  93          << dataSize << " # " << dataSizeWritten << std::endl;
  94       delete header;
  95       delete file;
  96       delete reread;
  97       return 1;
  98    }
  99
 100    if (int res = memcmp(imageData, imageDataWritten, dataSize) !=0)
 101    {
 102       (void)res;
 103       std::cout << std::endl
 104          << "        Pixel differ (as expanded in memory)." << std::endl;
 105       delete header;
 106       delete file;
 107       delete reread;
 108       return 1;
 109    }
 110    std::cout << "4...OK." << std::endl ;
 111
 112    //////////////// Clean up:
 113    delete header;
 114    delete file;
 115    delete reread;
 116
 117    return 0;
 118 }
 119
 120 int TestReadWriteReadCompare(int argc, char* argv[])
 121 {
 122    int result = 0;
 123    if (argc == 3)
 124    {
 125       const std::string input = argv[1];
 126       const std::string output = argv[2];
 127       result += CompareInternal(input, output);
 128    }
 129    else if( argc > 3 || argc == 2 )
 130    {
 131       std::cerr << "Please read the manual" << std::endl;
 132    }
 133    else
 134    {
 135       std::cout<< "Test::TestReadWriteReadCompare: description " << std::endl;
 136       std::cout << "   For all images in gdcmData (and not blacklisted in "
 137                    "Test/CMakeLists.txt)" << std::endl;
 138       std::cout << "   apply the following multistep test: " << std::endl;
 139       std::cout << "   step 1: parse the image (as gdcmHeader) and call"
 140                 << " IsReadable(). " << std::endl;
 141       std::cout << "   step 2: write the corresponding image in DICOM V3 "
 142                 << "with explicit" << std::endl
 143                 << "           Value Representation in temporary file "
 144                 << "TestReadWriteReadCompare.dcm." << std::endl;
 145       std::cout << "   step 3: read the image written on step2 and call "
 146                 << " IsReadable(). " << std::endl;
 147       std::cout << "   step 4: compare (in memory with memcmp) that the two "
 148                 << "images " << std::endl
 149                 << "           match (as expanded by gdcm)." << std::endl;
 150
 151       int i = 0;
 152       while( gdcmDataImages[i] != 0 )
 153       {
 154          std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
 155          filename += "/";
 156          filename += gdcmDataImages[i++];
 157          result += CompareInternal(filename, "TestReadWriteReadCompare.dcm");
 158       }
 159    }
 160    return result;
 161 }