Testing/TestWriteSimple.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestWriteSimple.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/10/18 08:35:46 $
   7   Version:   $Revision: 1.39 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 /**
  20  * Write a dicom file from nothing
  21  * The written image is 256x256, 8 bits, unsigned char
  22  * The image content is a horizontal grayscale from
  23  *
  24  */
  25 #include "gdcmFile.h"
  26 #include "gdcmFileHelper.h"
  27 #include "gdcmDebug.h"
  28
  29 #include <iostream>
  30 #include <sstream>
  31
  32 typedef struct
  33 {
  34    int sizeX;         // Size X of the image
  35    int sizeY;         // Size Y of the image
  36    int sizeZ;         // Size Z of the image
  37    int components;    // Number of components for a pixel
  38    int componentSize; // Component size (in bits : 8, 16)
  39    int componentUse ; // Component size (in bits)
  40    int sign;          // Sign of components
  41    char writeMode;    // Write mode
  42                       //  - 'a' : ACR
  43                       //  - 'e' : Explicit VR
  44                       //  - 'i' : Implicit VR
  45 } Image;
  46
  47 Image Images [] = {
  48    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'a'},
  49    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'e'},
  50    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'i'},
  51
  52    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'a'},
  53    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'e'},
  54    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'i'},
  55
  56    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  0, 'a'},
  57    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  0, 'e'},
  58    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  0, 'i'},
  59
  60    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'a'},
  61    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'e'},
  62    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'i'},
  63    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'a'},
  64    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'e'},
  65    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'i'},
  66
  67    {512, 256, 10, 1, 8, 8,  0, 'a'},
  68    {512, 256, 10, 1, 8, 8,  0, 'e'},
  69    {512, 256, 10, 1, 8, 8,  0, 'i'},
  70    {512, 256, 10, 3, 8, 8,  0, 'a'},
  71    {512, 256, 10, 3, 8, 8,  0, 'e'},
  72    {512, 256, 10, 3, 8, 8,  0, 'i'},
  73
  74    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  1, 'a'},
  75    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  1, 'e'},
  76    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  1, 'i'},
  77
  78    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  1, 'a'},
  79    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  1, 'e'},
  80    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  1, 'i'},
  81
  82    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  1, 'a'},
  83    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  1, 'e'},
  84    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  1, 'i'},
  85
  86    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 1, 'a'},
  87    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 1, 'e'},
  88    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 1, 'i'},
  89    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 1, 'a'},
  90    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 1, 'e'},
  91    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 1, 'i'},
  92
  93    {512, 256, 10, 1, 8, 8,  1, 'a'},
  94    {512, 256, 10, 1, 8, 8,  1, 'e'},
  95    {512, 256, 10, 1, 8, 8,  1, 'i'},
  96    {512, 256, 10, 3, 8, 8,  1, 'a'},
  97    {512, 256, 10, 3, 8, 8,  1, 'e'},
  98    {512, 256, 10, 3, 8, 8,  1, 'i'},
  99    {0,   0,   1,  1, 8, 8,  0, 'i'} // to find the end
 100 };
 101
 102 const unsigned int MAX_NUMBER_OF_DIFFERENCE = 10;
 103
 104 int WriteSimple(Image &img)
 105 {
 106    std::ostringstream fileName;
 107    fileName.str("");
 108    fileName << "TestWriteSimple";
 109
 110 // Step 1 : Create the header of the image
 111
 112    std::cout << "        1...";
 113    gdcm::File *fileToBuild = new gdcm::File();
 114    std::ostringstream str;
 115
 116    // Set the image size
 117    str.str("");
 118    str << img.sizeX;
 119    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0011); // Columns
 120    str.str("");
 121    str << img.sizeY;
 122    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0010); // Rows
 123
 124    if(img.sizeZ>1)
 125    {
 126       str.str("");
 127       str << img.sizeZ;
 128       fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0008); // Number of Frames
 129    }
 130
 131    fileName << "-" << img.sizeX << "-" << img.sizeY << "-" << img.sizeZ;
 132
 133    // Set the pixel type
 134    str.str("");
 135    str << img.componentSize;
 136    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0100); // Bits Allocated
 137
 138    str.str("");
 139    str << img.componentUse;
 140    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0101); // Bits Stored
 141
 142    str.str("");
 143    str << ( img.componentSize - 1 );
 144    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0102); // High Bit
 145
 146    // Set the pixel representation
 147    str.str("");
 148    str << img.sign;
 149    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0103); // Pixel Representation
 150
 151    fileName << "-" << img.componentSize;
 152    if(img.sign == 0)
 153       fileName << "U";
 154    else
 155       fileName << "S";
 156
 157    switch (img.writeMode)
 158    {
 159       case 'a' :
 160          fileName << ".ACR";  break;
 161       case 'e' :
 162          fileName << ".EXPL"; break;
 163       case 'i' :
 164          fileName << ".IMPL"; break;
 165    }
 166
 167    std::cout << "[" << fileName.str() << "]...";
 168
 169    // Set the samples per pixel
 170    str.str("");
 171    str << img.components;
 172    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0002); // Samples per Pixel
 173
 174 // Step 2 : Create the output image
 175    std::cout << "2...";
 176    if( img.componentSize%8 > 0 )
 177    {
 178       img.componentSize += 8-img.componentSize%8;
 179    }
 180    size_t size = img.sizeX * img.sizeY * img.sizeZ
 181                * img.components * img.componentSize / 8;
 182    unsigned char *imageData = new unsigned char[size];
 183
 184    // FIXME : find a better heuristic to create the image
 185    unsigned char *tmp = imageData;
 186    for(int k=0;k<img.sizeZ;k++)
 187    {
 188       for(int j=0;j<img.sizeY;j++)
 189       {
 190          for(int i=0;i<img.sizeX;i++)
 191          {
 192             for(int c=0;c<img.components;c++)
 193             {
 194                *tmp = (unsigned char)(j%256);
 195                if( img.componentSize>8 )
 196                {
 197                   *(tmp+1) = (unsigned char)(j/256);
 198                }
 199                tmp += img.componentSize/8;
 200             }
 201          }
 202       }
 203    }
 204
 205 // Step 3 : Create the file of the image
 206    std::cout << "3...";
 207    gdcm::FileHelper *fileH = new gdcm::FileHelper(fileToBuild);
 208    fileH->SetImageData(imageData,size);
 209
 210 // Step 4 : Set the writting mode and write the image
 211    std::cout << "4...";
 212
 213    fileH->SetWriteModeToRaw();
 214    switch (img.writeMode)
 215    {
 216       case 'a' : // Write an ACR file
 217          fileH->SetWriteTypeToAcr();
 218          break;
 219
 220       case 'e' : // Write a DICOM Explicit VR file
 221          fileH->SetWriteTypeToDcmExplVR();
 222          break;
 223
 224       case 'i' : // Write a DICOM Implicit VR file
 225          fileH->SetWriteTypeToDcmImplVR();
 226          break;
 227
 228       default :
 229          std::cout << "Failed for [" << fileName.str() << "]\n"
 230                    << "        Write mode '"<<img.writeMode<<"' is undefined\n";
 231
 232          delete fileH;
 233          delete fileToBuild;
 234          delete[] imageData;
 235          return 1;
 236    }
 237
 238    if( !fileH->Write(fileName.str()) )
 239    {
 240       std::cout << "Failed for [" << fileName.str() << "]\n"
 241                 << "           File is unwrittable\n";
 242
 243       delete fileH;
 244       delete fileToBuild;
 245       delete[] imageData;
 246       return 1;
 247    }
 248
 249 // Step 5 : Read the written image
 250    std::cout << "5...";
 251    // old form.
 252    //gdcm::FileHelper *reread = new gdcm::FileHelper( fileName.str() );
 253    // Better use :
 254    gdcm::FileHelper *reread = new gdcm::FileHelper( );
 255    reread->SetFileName( fileName.str() );
 256    reread->SetLoadMode(0); // Load everything
 257                            // Other possible values are
 258                            //              gdcm::LD_ALL,
 259                            //              gdcm::LD_NOSEQ,
 260                            //              gdcm::LD_NOSHADOW,
 261                            //              gdcm::LD_NOSEQ|gdcm::LD_NOSHADOW,
 262                            //              gdcm::LD_NOSHADOWSEQ
 263    reread->Load();
 264
 265    if( !reread->GetFile()->IsReadable() )
 266    {
 267       std::cerr << "Failed" << std::endl
 268                 << "Could not read written image : " << fileName.str() << std::endl;
 269       delete fileToBuild;
 270       delete fileH;
 271       delete reread;
 272       delete[] imageData;
 273       return 1;
 274    }
 275
 276 // Step 6 : Compare to the written image
 277    std::cout << "6...";
 278    size_t dataSizeWritten = reread->GetImageDataSize();
 279    uint8_t *imageDataWritten = reread->GetImageData();
 280
 281    // Test the image write mode
 282    if (reread->GetFile()->GetFileType() != fileH->GetWriteType())
 283    {
 284       std::cout << "Failed" << std::endl
 285          << "        File type differ: "
 286          << fileH->GetWriteType() << " # "
 287          << reread->GetFile()->GetFileType() << std::endl;
 288       delete fileToBuild;
 289       delete fileH;
 290       delete reread;
 291       delete[] imageData;
 292
 293       return 1;
 294    }
 295
 296    // Test the image size
 297    if (fileToBuild->GetXSize() != reread->GetFile()->GetXSize() ||
 298        fileToBuild->GetYSize() != reread->GetFile()->GetYSize() ||
 299        fileToBuild->GetZSize() != reread->GetFile()->GetZSize())
 300    {
 301       std::cout << "Failed for [" << fileName.str() << "]" << std::endl
 302          << "        X Size differs: "
 303          << "X: " << fileToBuild->GetXSize() << " # "
 304                   << reread->GetFile()->GetXSize() << " | "
 305          << "Y: " << fileToBuild->GetYSize() << " # "
 306                   << reread->GetFile()->GetYSize() << " | "
 307          << "Z: " << fileToBuild->GetZSize() << " # "
 308                   << reread->GetFile()->GetZSize() << std::endl;
 309       delete fileToBuild;
 310       delete fileH;
 311       delete reread;
 312       delete[] imageData;
 313
 314       return 1;
 315    }
 316
 317    // Test the data size
 318    if (size != dataSizeWritten)
 319    {
 320       std::cout << "Failed" << std::endl
 321          << "        Pixel areas lengths differ: "
 322          << size << " # " << dataSizeWritten << std::endl;
 323       delete fileToBuild;
 324       delete fileH;
 325       delete reread;
 326       delete[] imageData;
 327
 328       return 1;
 329    }
 330
 331    // Test the data's content
 332    if ( memcmp(imageData, imageDataWritten, size) !=0 )
 333    {
 334       std::cout << "Failed" << std::endl
 335                 << "        Pixel differ (as expanded in memory)." << std::endl;
 336       std::cout << "        list of the first " << MAX_NUMBER_OF_DIFFERENCE
 337                   << " pixels differing (pos : test - ref) :"
 338                   << std::endl;
 339       int i;
 340       unsigned int j;
 341       for(i=0, j=0;i<dataSizeWritten && j<MAX_NUMBER_OF_DIFFERENCE;i++)
 342       {
 343          if(imageDataWritten[i]!=imageData[i])
 344             {
 345             std::cout << std::hex << "(" << i << " : "
 346                         << std::hex << (int)(imageDataWritten[i]) << " - "
 347                         << std::hex << (int)(imageData[i]) << ") "
 348                         << std::dec;
 349             ++j;
 350             }
 351       }
 352       std::cout << std::endl;
 353       delete fileToBuild;
 354       delete fileH;
 355       delete reread;
 356       delete[] imageData;
 357
 358       return 1;
 359    }
 360
 361    std::cout << "OK" << std::endl;
 362
 363    delete fileToBuild;
 364    delete fileH;
 365    delete reread;
 366    delete[] imageData;
 367
 368    return 0;
 369 }
 370
 371 int TestWriteSimple(int argc, char *argv[])
 372 {
 373    if (argc < 1)
 374    {
 375       std::cerr << "usage: \n"
 376                 << argv[0] << " (without parameters) " << std::endl
 377                 << std::endl;
 378       return 1;
 379    }
 380
 381    //gdcm::Debug::DebugOn();
 382
 383    int ret=0;
 384    int i=0;
 385    while( Images[i].sizeX>0 && Images[i].sizeY>0 )
 386    {
 387       std::cout << "Test n :" << i;
 388       ret += WriteSimple(Images[i] );
 389       i++;
 390    }
 391
 392    return ret;
 393 }