Testing/TestWriteSimple.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestWriteSimple.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/02/05 03:12:28 $
   7   Version:   $Revision: 1.19 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 /**
  20  * Write a dicom file from nothing
  21  * The written image is 256x256, 8 bits, unsigned char
  22  * The image content is a horizontal grayscale from
  23  *
  24  */
  25 #include "gdcmFile.h"
  26 #include "gdcmFileHelper.h"
  27 #include "gdcmDebug.h"
  28
  29 #include <iostream>
  30 #include <sstream>
  31
  32 typedef struct
  33 {
  34    int sizeX;         // Size X of the image
  35    int sizeY;         // Size Y of the image
  36    int sizeZ;         // Size Z of the image
  37    int components;    // Number of components for a pixel
  38    int componentSize; // Component size (in bits : 8, 16)
  39    int componentUse ; // Component size (in bits)
  40    int sign;          // Sign of components
  41    char writeMode;    // Write mode
  42                       //  - 'a' : ACR
  43                       //  - 'e' : Explicit VR
  44                       //  - 'i' : Implicit VR
  45 } Image;
  46
  47 Image Images [] = {
  48    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'a'},
  49    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'e'},
  50    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'i'},
  51
  52    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'a'},
  53    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'e'},
  54    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'i'},
  55
  56    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  0, 'a'},
  57    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  0, 'e'},
  58    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  0, 'i'},
  59
  60    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'a'},
  61    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'e'},
  62    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'i'},
  63    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'a'},
  64    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'e'},
  65    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'i'},
  66    {0,   0,   1, 1, 8,  8,  0, 'i'} // to find the end
  67 };
  68
  69 int WriteSimple(Image &img)
  70 {
  71    std::string fileName = "TestWriteSimple.dcm";
  72
  73 // Step 1 : Create the header of the image
  74    std::cout << "        1...";
  75    gdcm::File *fileToBuild = new gdcm::File();
  76    std::ostringstream str;
  77
  78    // Set the image size
  79    str.str("");
  80    str << img.sizeX;
  81    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0011); // Columns
  82
  83    str.str("");
  84    str << img.sizeY;
  85    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0010); // Rows
  86
  87    if(img.sizeZ>1)
  88    {
  89       str.str("");
  90       str << img.sizeZ;
  91       fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0008); // Number of Frames
  92    }
  93
  94    // Set the pixel type
  95    str.str("");
  96    str << img.componentSize;
  97    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0100); // Bits Allocated
  98
  99    /******************************************/
 100    /******************************************/
 101    // Super duper kludge !!
 102    if( img.componentSize == 16 )
 103      {
 104      // I guess by design user should know that...
 105      fileToBuild->InsertBinEntry(0,0, 0x7fe0, 0x0010, "OW");
 106      }
 107    /******************************************/
 108    /******************************************/
 109
 110
 111    str.str("");
 112    str << img.componentUse;
 113    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0101); // Bits Stored
 114
 115    str.str("");
 116    str << img.componentSize - 1;
 117    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0102); // High Bit
 118
 119    // Set the pixel representation
 120    str.str("");
 121    str << img.sign;
 122    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0103); // Pixel Representation
 123
 124    // Set the samples per pixel
 125    str.str("");
 126    str << img.components;
 127    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0002); // Samples per Pixel
 128
 129    if( !fileToBuild->IsReadable() )
 130    {
 131       std::cout << "Failed\n"
 132                 << "        Prepared image isn't readable\n";
 133
 134       delete fileToBuild;
 135       return 1;
 136    }
 137
 138 // Step 2 : Create the output image
 139    std::cout << "2...";
 140    if( img.componentSize%8 > 0 )
 141    {
 142       img.componentSize += 8-img.componentSize%8;
 143    }
 144    size_t size = img.sizeX * img.sizeY * img.sizeZ
 145                * img.components * img.componentSize / 8;
 146    unsigned char *imageData = new unsigned char[size];
 147
 148    // FIXME : find a best heuristic to create the image
 149    unsigned char *tmp = imageData;
 150    for(int k=0;k<img.sizeZ;k++)
 151    {
 152       for(int j=0;j<img.sizeY;j++)
 153       {
 154          for(int i=0;i<img.sizeX;i++)
 155          {
 156             for(int c=0;c<img.components;c++)
 157             {
 158                *tmp = j%256;
 159                if( img.componentSize>8 )
 160                {
 161                   *(tmp+1) = j/256;
 162                }
 163                tmp += img.componentSize * img.components/8;
 164             }
 165          }
 166       }
 167    }
 168
 169 // Step 3 : Create the file of the image
 170    std::cout << "3...";
 171    gdcm::FileHelper *file = new gdcm::FileHelper(fileToBuild);
 172    file->SetImageData(imageData,size);
 173
 174 // Step 4 : Set the writting mode and write the image
 175    std::cout << "4...";
 176
 177    file->SetWriteModeToRaw();
 178    switch (img.writeMode)
 179    {
 180       case 'a' : // Write an ACR file
 181          file->SetWriteTypeToAcr();
 182          break;
 183
 184       case 'e' : // Write a DICOM Explicit VR file
 185          file->SetWriteTypeToDcmExplVR();
 186          break;
 187
 188       case 'i' : // Write a DICOM Implicit VR file
 189          file->SetWriteTypeToDcmImplVR();
 190          break;
 191
 192       default :
 193          std::cout << "Failed\n"
 194                    << "        Write mode '"<<img.writeMode<<"' is undefined\n";
 195
 196          delete file;
 197          delete fileToBuild;
 198          delete[] imageData;
 199          return 1;
 200    }
 201
 202    if( !file->Write(fileName) )
 203    {
 204       std::cout << "Failed\n"
 205                 << "File in unwrittable\n";
 206
 207       delete file;
 208       delete fileToBuild;
 209       delete[] imageData;
 210       return 1;
 211    }
 212
 213 // Step 5 : Read the written image
 214    std::cout << "5...";
 215    gdcm::FileHelper *reread = new gdcm::FileHelper( fileName );
 216    if( !reread->GetFile()->IsReadable() )
 217    {
 218      std::cerr << "Failed" << std::endl
 219                << "Test::TestReadWriteReadCompare: Could not reread image "
 220                << "written:" << fileName << std::endl;
 221      delete fileToBuild;
 222      delete file;
 223      delete reread;
 224      return 1;
 225    }
 226
 227 // Step 6 : Compare to the written image
 228    std::cout << "6...";
 229    size_t dataSizeWritten = reread->GetImageDataSize();
 230    uint8_t *imageDataWritten = reread->GetImageData();
 231
 232    // Test the image size
 233    if (fileToBuild->GetXSize() != reread->GetFile()->GetXSize() ||
 234        fileToBuild->GetYSize() != reread->GetFile()->GetYSize() ||
 235        fileToBuild->GetZSize() != reread->GetFile()->GetZSize())
 236    {
 237       std::cout << "Failed" << std::endl
 238          << "        X Size differs: "
 239          << "X: " << fileToBuild->GetXSize() << " # "
 240                   << reread->GetFile()->GetXSize() << " | "
 241          << "Y: " << fileToBuild->GetYSize() << " # "
 242                   << reread->GetFile()->GetYSize() << " | "
 243          << "Z: " << fileToBuild->GetZSize() << " # "
 244                   << reread->GetFile()->GetZSize() << std::endl;
 245       delete fileToBuild;
 246       delete file;
 247       delete reread;
 248       delete[] imageData;
 249
 250       return 1;
 251    }
 252
 253    // Test the data size
 254    if (size != dataSizeWritten)
 255    {
 256       std::cout << "Failed" << std::endl
 257          << "        Pixel areas lengths differ: "
 258          << size << " # " << dataSizeWritten << std::endl;
 259       delete fileToBuild;
 260       delete file;
 261       delete reread;
 262       delete[] imageData;
 263
 264       return 1;
 265    }
 266
 267    // Test the data's content
 268    if (int res = memcmp(imageData, imageDataWritten, size) !=0)
 269    {
 270       (void)res;
 271       std::cout << "Failed" << std::endl
 272                 << "        Pixel differ (as expanded in memory)." << std::endl;
 273       delete fileToBuild;
 274       delete file;
 275       delete reread;
 276       delete[] imageData;
 277
 278       return 1;
 279    }
 280
 281    std::cout << "OK" << std::endl;
 282
 283    delete fileToBuild;
 284    delete file;
 285    delete reread;
 286    delete[] imageData;
 287
 288    return 0;
 289 }
 290
 291 int TestWriteSimple(int argc, char *argv[])
 292 {
 293    if (argc < 1)
 294    {
 295       std::cerr << "usage: \n"
 296                 << argv[0] << " (without parameters) " << std::endl
 297                 << std::endl;
 298       return 1;
 299    }
 300
 301    int ret=0;
 302    int i=0;
 303    while( Images[i].sizeX>0 && Images[i].sizeY>0 )
 304    {
 305       ret += WriteSimple(Images[i]);
 306       i++;
 307    }
 308
 309    return ret;
 310 }