Testing/TestWriteSimple.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestWriteSimple.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/09/06 11:16:04 $
   7   Version:   $Revision: 1.37 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 /**
  20  * Write a dicom file from nothing
  21  * The written image is 256x256, 8 bits, unsigned char
  22  * The image content is a horizontal grayscale from
  23  *
  24  */
  25 #include "gdcmFile.h"
  26 #include "gdcmFileHelper.h"
  27 #include "gdcmDebug.h"
  28
  29 #include <iostream>
  30 #include <sstream>
  31
  32 typedef struct
  33 {
  34    int sizeX;         // Size X of the image
  35    int sizeY;         // Size Y of the image
  36    int sizeZ;         // Size Z of the image
  37    int components;    // Number of components for a pixel
  38    int componentSize; // Component size (in bits : 8, 16)
  39    int componentUse ; // Component size (in bits)
  40    int sign;          // Sign of components
  41    char writeMode;    // Write mode
  42                       //  - 'a' : ACR
  43                       //  - 'e' : Explicit VR
  44                       //  - 'i' : Implicit VR
  45 } Image;
  46
  47 Image Images [] = {
  48    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'a'},
  49    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'e'},
  50    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'i'},
  51
  52    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'a'},
  53    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'e'},
  54    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  0, 'i'},
  55
  56    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  0, 'a'},
  57    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  0, 'e'},
  58    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  0, 'i'},
  59
  60    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'a'},
  61    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'e'},
  62    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'i'},
  63    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'a'},
  64    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'e'},
  65    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 0, 'i'},
  66
  67    {512, 256, 10, 1, 8, 8,  0, 'a'},
  68    {512, 256, 10, 1, 8, 8,  0, 'e'},
  69    {512, 256, 10, 1, 8, 8,  0, 'i'},
  70    {512, 256, 10, 3, 8, 8,  0, 'a'},
  71    {512, 256, 10, 3, 8, 8,  0, 'e'},
  72    {512, 256, 10, 3, 8, 8,  0, 'i'},
  73
  74    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  1, 'a'},
  75    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  1, 'e'},
  76    {256, 256, 1, 1, 8,  8,  1, 'i'},
  77
  78    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  1, 'a'},
  79    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  1, 'e'},
  80    {512, 256, 1, 1, 8,  8,  1, 'i'},
  81
  82    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  1, 'a'},
  83    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  1, 'e'},
  84    {256, 512, 1, 1, 8,  8,  1, 'i'},
  85
  86    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 1, 'a'},
  87    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 1, 'e'},
  88    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 1, 'i'},
  89    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 1, 'a'},
  90    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 1, 'e'},
  91    {256, 512, 1, 1, 16, 16, 1, 'i'},
  92
  93    {512, 256, 10, 1, 8, 8,  1, 'a'},
  94    {512, 256, 10, 1, 8, 8,  1, 'e'},
  95    {512, 256, 10, 1, 8, 8,  1, 'i'},
  96    {512, 256, 10, 3, 8, 8,  1, 'a'},
  97    {512, 256, 10, 3, 8, 8,  1, 'e'},
  98    {512, 256, 10, 3, 8, 8,  1, 'i'},
  99    {0,   0,   1,  1, 8, 8,  0, 'i'} // to find the end
 100 };
 101
 102 int WriteSimple(Image &img)
 103 {
 104    std::ostringstream fileName;
 105    fileName.str("");
 106    fileName << "TestWriteSimple";
 107
 108 // Step 1 : Create the header of the image
 109
 110    std::cout << "        1...";
 111    gdcm::File *fileToBuild = new gdcm::File();
 112    std::ostringstream str;
 113
 114    // Set the image size
 115    str.str("");
 116    str << img.sizeX;
 117    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0011); // Columns
 118    str.str("");
 119    str << img.sizeY;
 120    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0010); // Rows
 121
 122    if(img.sizeZ>1)
 123    {
 124       str.str("");
 125       str << img.sizeZ;
 126       fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0008); // Number of Frames
 127    }
 128
 129    fileName << "-" << img.sizeX << "-" << img.sizeY << "-" << img.sizeZ;
 130
 131    // Set the pixel type
 132    str.str("");
 133    str << img.componentSize;
 134    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0100); // Bits Allocated
 135
 136    str.str("");
 137    str << img.componentUse;
 138    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0101); // Bits Stored
 139
 140    str.str("");
 141    str << ( img.componentSize - 1 );
 142    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0102); // High Bit
 143
 144    // Set the pixel representation
 145    str.str("");
 146    str << img.sign;
 147    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0103); // Pixel Representation
 148
 149    fileName << "-" << img.componentSize;
 150    if(img.sign == 0)
 151       fileName << "U";
 152    else
 153       fileName << "S";
 154
 155    switch (img.writeMode)
 156    {
 157       case 'a' :
 158          fileName << ".ACR";  break;
 159       case 'e' :
 160          fileName << ".EXPL"; break;
 161       case 'i' :
 162          fileName << ".IMPL"; break;
 163    }
 164
 165    std::cout << "[" << fileName.str() << "]...";
 166
 167    // Set the samples per pixel
 168    str.str("");
 169    str << img.components;
 170    fileToBuild->InsertValEntry(str.str(),0x0028,0x0002); // Samples per Pixel
 171
 172 // Step 2 : Create the output image
 173    std::cout << "2...";
 174    if( img.componentSize%8 > 0 )
 175    {
 176       img.componentSize += 8-img.componentSize%8;
 177    }
 178    size_t size = img.sizeX * img.sizeY * img.sizeZ
 179                * img.components * img.componentSize / 8;
 180    unsigned char *imageData = new unsigned char[size];
 181
 182    // FIXME : find a better heuristic to create the image
 183    unsigned char *tmp = imageData;
 184    for(int k=0;k<img.sizeZ;k++)
 185    {
 186       for(int j=0;j<img.sizeY;j++)
 187       {
 188          for(int i=0;i<img.sizeX;i++)
 189          {
 190             for(int c=0;c<img.components;c++)
 191             {
 192                *tmp = (unsigned char)(j%256);
 193                if( img.componentSize>8 )
 194                {
 195                   *(tmp+1) = (unsigned char)(j/256);
 196                }
 197                tmp += img.componentSize/8;
 198             }
 199          }
 200       }
 201    }
 202
 203 // Step 3 : Create the file of the image
 204    std::cout << "3...";
 205    gdcm::FileHelper *fileH = new gdcm::FileHelper(fileToBuild);
 206    fileH->SetImageData(imageData,size);
 207
 208 // Step 4 : Set the writting mode and write the image
 209    std::cout << "4...";
 210
 211    fileH->SetWriteModeToRaw();
 212    switch (img.writeMode)
 213    {
 214       case 'a' : // Write an ACR file
 215          fileH->SetWriteTypeToAcr();
 216          break;
 217
 218       case 'e' : // Write a DICOM Explicit VR file
 219          fileH->SetWriteTypeToDcmExplVR();
 220          break;
 221
 222       case 'i' : // Write a DICOM Implicit VR file
 223          fileH->SetWriteTypeToDcmImplVR();
 224          break;
 225
 226       default :
 227          std::cout << "Failed for [" << fileName.str() << "]\n"
 228                    << "        Write mode '"<<img.writeMode<<"' is undefined\n";
 229
 230          delete fileH;
 231          delete fileToBuild;
 232          delete[] imageData;
 233          return 1;
 234    }
 235
 236    if( !fileH->Write(fileName.str()) )
 237    {
 238       std::cout << "Failed for [" << fileName.str() << "]\n"
 239                 << "           File in unwrittable\n";
 240
 241       delete fileH;
 242       delete fileToBuild;
 243       delete[] imageData;
 244       return 1;
 245    }
 246
 247 // Step 5 : Read the written image
 248    std::cout << "5...";
 249    // old form.
 250    //gdcm::FileHelper *reread = new gdcm::FileHelper( fileName.str() );
 251    // Better use :
 252    gdcm::FileHelper *reread = new gdcm::FileHelper( );
 253    reread->SetFileName( fileName.str() );
 254    reread->SetLoadMode(0); // Load everything
 255                            // Other possible values are
 256                            //              gdcm::LD_ALL,
 257                            //              gdcm::LD_NOSEQ,
 258                            //              gdcm::LD_NOSHADOW,
 259                            //              gdcm::LD_NOSEQ|gdcm::LD_NOSHADOW,
 260                            //              gdcm::LD_NOSHADOWSEQ
 261    reread->Load();
 262
 263    if( !reread->GetFile()->IsReadable() )
 264    {
 265       std::cerr << "Failed" << std::endl
 266                 << "Could not read written image : " << fileName.str() << std::endl;
 267       delete fileToBuild;
 268       delete fileH;
 269       delete reread;
 270       delete[] imageData;
 271       return 1;
 272    }
 273
 274 // Step 6 : Compare to the written image
 275    std::cout << "6...";
 276    size_t dataSizeWritten = reread->GetImageDataSize();
 277    uint8_t *imageDataWritten = reread->GetImageData();
 278
 279    // Test the image write mode
 280    if (reread->GetFile()->GetFileType() != fileH->GetWriteType())
 281    {
 282       std::cout << "Failed" << std::endl
 283          << "        File type differ: "
 284          << fileH->GetWriteType() << " # "
 285          << reread->GetFile()->GetFileType() << std::endl;
 286       delete fileToBuild;
 287       delete fileH;
 288       delete reread;
 289       delete[] imageData;
 290
 291       return 1;
 292    }
 293
 294    // Test the image size
 295    if (fileToBuild->GetXSize() != reread->GetFile()->GetXSize() ||
 296        fileToBuild->GetYSize() != reread->GetFile()->GetYSize() ||
 297        fileToBuild->GetZSize() != reread->GetFile()->GetZSize())
 298    {
 299       std::cout << "Failed for [" << fileName.str() << "]" << std::endl
 300          << "        X Size differs: "
 301          << "X: " << fileToBuild->GetXSize() << " # "
 302                   << reread->GetFile()->GetXSize() << " | "
 303          << "Y: " << fileToBuild->GetYSize() << " # "
 304                   << reread->GetFile()->GetYSize() << " | "
 305          << "Z: " << fileToBuild->GetZSize() << " # "
 306                   << reread->GetFile()->GetZSize() << std::endl;
 307       delete fileToBuild;
 308       delete fileH;
 309       delete reread;
 310       delete[] imageData;
 311
 312       return 1;
 313    }
 314
 315    // Test the data size
 316    if (size != dataSizeWritten)
 317    {
 318       std::cout << "Failed" << std::endl
 319          << "        Pixel areas lengths differ: "
 320          << size << " # " << dataSizeWritten << std::endl;
 321       delete fileToBuild;
 322       delete fileH;
 323       delete reread;
 324       delete[] imageData;
 325
 326       return 1;
 327    }
 328
 329    // Test the data's content
 330    if ( memcmp(imageData, imageDataWritten, size) !=0 )
 331    {
 332       std::cout << "Failed" << std::endl
 333                 << "        Pixel differ (as expanded in memory)." << std::endl;
 334       delete fileToBuild;
 335       delete fileH;
 336       delete reread;
 337       delete[] imageData;
 338
 339       return 1;
 340    }
 341
 342    std::cout << "OK" << std::endl;
 343
 344    delete fileToBuild;
 345    delete fileH;
 346    delete reread;
 347    delete[] imageData;
 348
 349    return 0;
 350 }
 351
 352 int TestWriteSimple(int argc, char *argv[])
 353 {
 354    if (argc < 1)
 355    {
 356       std::cerr << "usage: \n"
 357                 << argv[0] << " (without parameters) " << std::endl
 358                 << std::endl;
 359       return 1;
 360    }
 361
 362    gdcm::Debug::DebugOn();
 363
 364    int ret=0;
 365    int i=0;
 366    while( Images[i].sizeX>0 && Images[i].sizeY>0 )
 367    {
 368       std::cout << "Test n :" << i;
 369       ret += WriteSimple(Images[i] );
 370       i++;
 371    }
 372
 373    return ret;
 374 }