Testing/VTKTestReadSeq.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: VTKTestReadSeq.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/01/19 14:45:40 $
   7   Version:   $Revision: 1.4 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "vtkGdcmReader.h"
  20 #include "vtkImageViewer.h"
  21 #include "vtkImageData.h"
  22 #include "vtkRegressionTestImage.h"
  23 #include "vtkImageClip.h"
  24 #include "vtkImageTranslateExtent.h"
  25 #include "vtkImageAppendComponents.h"
  26 #include "vtkImageShiftScale.h"
  27
  28 #include <iostream>
  29
  30 //Generated file:
  31 #include "gdcmDataSeqImages.h"
  32
  33 #ifndef vtkFloatingPointType
  34 #define vtkFloatingPointType float
  35 #endif
  36
  37 int VTKReadSeqTest(vtkTesting *t,vtkImageViewer *viewer,
  38                    std::string const & filename,
  39                    std::string const & referenceFileName,
  40                    bool show )
  41 {
  42    int retVal = 0;  //by default this is an error
  43
  44    // Set the reader
  45    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
  46
  47    char *newFileDcm = new char[filename.size()+1];
  48    int fileCount = 0;
  49    for(int i=0;i<9;i++)
  50    {
  51       fileCount = i;
  52       sprintf(newFileDcm,filename.c_str(),i);
  53
  54       // Test the existance of the file
  55       ifstream opened(newFileDcm,std::ios::in | std::ios::binary);
  56       if(opened)
  57       {
  58          reader->AddFileName(newFileDcm);
  59          opened.close();
  60       }
  61       else
  62          break;
  63    }
  64    delete[] newFileDcm;
  65    reader->Update();
  66
  67    double *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
  68
  69    // Show
  70    if( show )
  71    {
  72       viewer->SetInput ( reader->GetOutput() );
  73       viewer->OffScreenRenderingOff();
  74
  75       viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
  76       viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
  77
  78       int dim[3];
  79       reader->GetOutput()->GetDimensions( dim );
  80       viewer->SetSize(dim[0], dim[1]);
  81       viewer->SetZSlice( 0 );
  82       viewer->Render();
  83       viewer->SetInput(NULL);
  84    }
  85
  86    // make test
  87    int ret = 0;
  88    ostrstream str;
  89    char *newFilePng = new char[referenceFileName.size()+1];
  90    for(int j=0;j<fileCount;j++)
  91    {
  92       sprintf(newFilePng,referenceFileName.c_str(),j);
  93
  94       t->CleanArguments();
  95       t->AddArgument("-D");
  96       t->AddArgument( GDCM_DATA_ROOT );
  97       t->AddArgument("-V");
  98       t->AddArgument( newFilePng );
  99       t->AddArgument("-T");
 100       t->AddArgument( "." );
 101
 102       //----------------------------------------------------------------------
 103       // Transform the image to be RGB unsigned char, due to the requests in
 104       // vtkTesting processing
 105       // The pipeline is broken after each process to keep maximum of memory
 106       vtkImageData *image=reader->GetOutput();
 107       image->Update();
 108       image->Register(NULL);
 109
 110       // Get the middle slice in the image
 111       int *ext=image->GetExtent();
 112       vtkImageClip *clip=vtkImageClip::New();
 113       clip->SetInput(image);
 114       clip->SetOutputWholeExtent(ext[0],ext[1],ext[2],ext[3],j,j);
 115       clip->ClipDataOn();
 116       vtkImageTranslateExtent *translat=vtkImageTranslateExtent::New();
 117       translat->SetInput(clip->GetOutput());
 118       translat->SetTranslation(0,0,-j);
 119
 120       image->UnRegister(NULL);
 121       image=translat->GetOutput();
 122       image->Update();
 123       image->Register(NULL);
 124       translat->SetOutput(NULL);
 125       clip->Delete();
 126       translat->Delete();
 127
 128       // Set an unsigned char image
 129       // Shift/Scale the image
 130       image->Update();
 131       vtkImageShiftScale *iss=vtkImageShiftScale::New();
 132       iss->SetInput(image);
 133       iss->SetOutputScalarTypeToUnsignedChar();
 134       iss->SetShift(-range[0]);
 135       iss->SetScale(255.0/(range[1]-range[0]));
 136       iss->ClampOverflowOn();
 137
 138       image->UnRegister(NULL);
 139       image=iss->GetOutput();
 140       image->Update();
 141       image->Register(NULL);
 142       iss->Delete();
 143
 144       // Set 3 components to the image
 145       if(image->GetNumberOfScalarComponents()==1)
 146       {
 147          vtkImageAppendComponents *x3=vtkImageAppendComponents::New();
 148          x3->AddInput(image);
 149          x3->AddInput(image);
 150          x3->AddInput(image);
 151
 152          image->UnRegister(NULL);
 153          image=x3->GetOutput();
 154          image->Update();
 155          image->Register(NULL);
 156          x3->SetOutput(NULL);
 157          x3->Delete();
 158       }
 159       // End of transform
 160       //----------------------------------------------------------------------
 161
 162       // make test
 163       retVal = t->RegressionTest(image,2.0,str);
 164       image->UnRegister(NULL);
 165
 166       if( retVal != vtkTesting::PASSED )
 167       {
 168          std::cerr << str.str();
 169       }
 170       str.rdbuf()->freeze(1);
 171
 172       if( retVal == vtkTesting::PASSED )
 173       {
 174          std::cerr << "       ...Slice " << j << ": OK" << std::endl;
 175       }
 176       else
 177       {
 178          std::cerr << "       ...Slice " << j << ": Failed" << std::endl;
 179          ret++;
 180       }
 181    }
 182
 183    delete[] newFilePng;
 184    reader->Delete();
 185
 186    return ret;
 187 }
 188
 189 int VTKTestReadSeq(int argc, char *argv[])
 190 {
 191    bool show = false;
 192    if( argc >= 2 )
 193    {
 194       if( std::string(argv[1]) == "-V" )
 195       {
 196          show = true;
 197       }
 198    }
 199
 200    int ret = 0;
 201    vtkTesting* t = vtkTesting::New();
 202    vtkImageViewer *viewer;
 203    if( show )
 204       viewer = vtkImageViewer::New();
 205    else
 206       viewer = NULL;
 207
 208    if( argc < 3+show )
 209    {
 210       std::cerr << "Usage: " << argv[0] << " [-V] image%d.dcm ref%d.png\n";
 211       std::cerr << "   -V : to view images to the screen... \n"
 212                 << "        this mode can generate errors in the test\n";
 213       std::cerr << "   %d : this will be replaced by a number at execution.\n"
 214                 << "        It will be from 0 to 9 only with a step of 1\n\n";
 215    }
 216    else
 217    {
 218       ret = VTKReadSeqTest(t,viewer,argv[1+show],argv[2+show],show);
 219       t->Delete();
 220       if( viewer )
 221          viewer->Delete();
 222
 223       return ret;
 224    }
 225
 226    // Test for all images
 227    int i = 0;
 228    while( gdcmDataSeqImages[i] != 0 )
 229    {
 230       std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
 231       filename += "/";  //doh!
 232       filename += gdcmDataSeqImages[i];
 233       std::cerr << "Filename: " << filename << std::endl;
 234
 235       //Extract name to find the png file matching:
 236       std::string pngfile = gdcmDataSeqImages[i++];
 237       std::string::size_type dot_pos = pngfile.rfind( "." );
 238       pngfile = pngfile.substr(0, dot_pos).append( ".png" );
 239       pngfile.insert( 0, "Baseline/");
 240
 241       ret += VTKReadSeqTest(t,viewer,filename,pngfile,show);
 242    }
 243    t->Delete();
 244    if( viewer )
 245       viewer->Delete();
 246
 247    return ret;
 248 }