Testing/VTKTestReadSeq.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: VTKTestReadSeq.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/01/19 13:50:11 $
   7   Version:   $Revision: 1.3 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "vtkGdcmReader.h"
  20 #include "vtkImageViewer.h"
  21 #include "vtkImageData.h"
  22 #include "vtkRegressionTestImage.h"
  23 #include "vtkImageClip.h"
  24 #include "vtkImageTranslateExtent.h"
  25 #include "vtkImageAppendComponents.h"
  26 #include "vtkImageShiftScale.h"
  27
  28 #include <iostream>
  29
  30 //Generated file:
  31 #include "gdcmDataSeqImages.h"
  32
  33 #ifndef vtkFloatingPointType
  34 #define vtkFloatingPointType float
  35 #endif
  36
  37 int VTKReadSeqTest(vtkTesting *t,vtkImageViewer *viewer,
  38                    std::string const & filename,
  39                    std::string const & referenceFileName,
  40                    bool show )
  41 {
  42    int retVal = 0;  //by default this is an error
  43
  44    // Set the reader
  45    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
  46
  47    char *newFileDcm = new char[filename.size()+1];
  48    int fileCount = 0;
  49    for(int i=0;i<9;i++)
  50    {
  51       fileCount = i;
  52       sprintf(newFileDcm,filename.c_str(),i);
  53
  54       // Test the existance of the file
  55       ifstream opened(newFileDcm,std::ios::in | std::ios::binary);
  56       if(opened)
  57       {
  58          reader->AddFileName(newFileDcm);
  59          opened.close();
  60       }
  61       else
  62          break;
  63    }
  64    delete[] newFileDcm;
  65    reader->Update();
  66
  67    if( show )
  68    {
  69       viewer->SetInput ( reader->GetOutput() );
  70       viewer->OffScreenRenderingOff();
  71
  72       vtkFloatingPointType *range = reader->GetOutput()->GetScalarRange();
  73       viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
  74       viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
  75
  76       int dim[3];
  77       reader->GetOutput()->GetDimensions( dim );
  78       viewer->SetSize(dim[0], dim[1]);
  79       viewer->SetZSlice( 0 );
  80       viewer->Render();
  81       viewer->SetInput(NULL);
  82    }
  83
  84    // make test
  85    int ret = 0;
  86    ostrstream str;
  87    char *newFilePng = new char[referenceFileName.size()+1];
  88    for(int j=0;j<fileCount;j++)
  89    {
  90       sprintf(newFilePng,referenceFileName.c_str(),j);
  91
  92       t->CleanArguments();
  93       t->AddArgument("-D");
  94       t->AddArgument( GDCM_DATA_ROOT );
  95       t->AddArgument("-V");
  96       t->AddArgument( newFilePng );
  97       t->AddArgument("-T");
  98       t->AddArgument( "." );
  99
 100       //----------------------------------------------------------------------
 101       // Transform the image to be RGB unsigned char, due to the requests in
 102       // vtkTesting processing
 103       // The pipeline is broken after each process to keep maximum of memory
 104       vtkImageData *image=reader->GetOutput();
 105       image->Update();
 106       image->Register(NULL);
 107
 108       // Get the middle slice in the image
 109       int *ext=image->GetExtent();
 110       vtkImageClip *clip=vtkImageClip::New();
 111       clip->SetInput(image);
 112       clip->SetOutputWholeExtent(ext[0],ext[1],ext[2],ext[3],j,j);
 113       clip->ClipDataOn();
 114       vtkImageTranslateExtent *translat=vtkImageTranslateExtent::New();
 115       translat->SetInput(clip->GetOutput());
 116       translat->SetTranslation(0,0,-j);
 117
 118       image->UnRegister(NULL);
 119       image=translat->GetOutput();
 120       image->Update();
 121       image->Register(NULL);
 122       translat->SetOutput(NULL);
 123       clip->Delete();
 124       translat->Delete();
 125
 126       // Set an unsigned char image
 127       // Shift/Scale the image
 128       image->Update();
 129       double *rng=image->GetScalarRange();
 130       vtkImageShiftScale *iss=vtkImageShiftScale::New();
 131       iss->SetInput(image);
 132       iss->SetOutputScalarTypeToUnsignedChar();
 133       iss->SetShift(-rng[0]);
 134       iss->SetScale(255.0/(rng[1]-rng[0]));
 135       iss->ClampOverflowOn();
 136
 137       image->UnRegister(NULL);
 138       image=iss->GetOutput();
 139       image->Update();
 140       image->Register(NULL);
 141       iss->Delete();
 142
 143       // Set 3 components to the image
 144       if(image->GetNumberOfScalarComponents()==1)
 145       {
 146          vtkImageAppendComponents *x3=vtkImageAppendComponents::New();
 147          x3->AddInput(image);
 148          x3->AddInput(image);
 149          x3->AddInput(image);
 150
 151          image->UnRegister(NULL);
 152          image=x3->GetOutput();
 153          image->Update();
 154          image->Register(NULL);
 155          x3->SetOutput(NULL);
 156          x3->Delete();
 157       }
 158       // End of transform
 159       //----------------------------------------------------------------------
 160
 161       // make test
 162       retVal = t->RegressionTest(image,2.0,str);
 163       image->UnRegister(NULL);
 164
 165       if( retVal != vtkTesting::PASSED )
 166       {
 167          std::cerr << str.str();
 168       }
 169       str.rdbuf()->freeze(1);
 170
 171       if( retVal == vtkTesting::PASSED )
 172       {
 173          std::cerr << "       ...Slice " << j << ": OK" << std::endl;
 174       }
 175       else
 176       {
 177          std::cerr << "       ...Slice " << j << ": Failed" << std::endl;
 178          ret++;
 179       }
 180    }
 181
 182    delete[] newFilePng;
 183    reader->Delete();
 184
 185    return ret;
 186 }
 187
 188 int VTKTestReadSeq(int argc, char *argv[])
 189 {
 190    bool show = false;
 191    if( argc >= 2 )
 192    {
 193       if( std::string(argv[1]) == "-V" )
 194       {
 195          show = true;
 196       }
 197    }
 198
 199    int ret = 0;
 200    vtkTesting* t = vtkTesting::New();
 201    vtkImageViewer *viewer;
 202    if( show )
 203       viewer = vtkImageViewer::New();
 204    else
 205       viewer = NULL;
 206
 207    if( argc < 3+show )
 208    {
 209       std::cerr << "Usage: " << argv[0] << " [-V] image%d.dcm ref%d.png\n";
 210       std::cerr << "   -V : to view images to the screen... \n"
 211                 << "        this mode can generate errors in the test\n";
 212       std::cerr << "   %d : this will be replaced by a number at execution.\n"
 213                 << "        It will be from 0 to 9 only with a step of 1\n\n";
 214    }
 215    else
 216    {
 217       ret = VTKReadSeqTest(t,viewer,argv[1+show],argv[2+show],show);
 218       t->Delete();
 219       if( viewer )
 220          viewer->Delete();
 221
 222       return ret;
 223    }
 224
 225    // Test for all images
 226    int i = 0;
 227    while( gdcmDataSeqImages[i] != 0 )
 228    {
 229       std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
 230       filename += "/";  //doh!
 231       filename += gdcmDataSeqImages[i];
 232       std::cerr << "Filename: " << filename << std::endl;
 233
 234       //Extract name to find the png file matching:
 235       std::string pngfile = gdcmDataSeqImages[i++];
 236       std::string::size_type dot_pos = pngfile.rfind( "." );
 237       pngfile = pngfile.substr(0, dot_pos).append( ".png" );
 238       pngfile.insert( 0, "Baseline/");
 239
 240       ret += VTKReadSeqTest(t,viewer,filename,pngfile,show);
 241    }
 242    t->Delete();
 243    if( viewer )
 244       viewer->Delete();
 245
 246    return ret;
 247 }