Testing/VTKTestWrite.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: VTKTestWrite.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/01/25 15:45:49 $
   7   Version:   $Revision: 1.7 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFileHelper.h"
  19 #include "vtkGdcmReader.h"
  20 #include "vtkGdcmWriter.h"
  21 #include "vtkImageViewer.h"
  22 #include "vtkImageData.h"
  23 #include "vtkRegressionTestImage.h"
  24 #include "vtkImageClip.h"
  25 #include "vtkImageTranslateExtent.h"
  26 #include "vtkImageAppendComponents.h"
  27 #include "vtkImageShiftScale.h"
  28
  29 #include <iostream>
  30
  31 //Generated file:
  32 #include "gdcmDataImages.h"
  33
  34 #ifndef vtkFloatingPointType
  35 #define vtkFloatingPointType float
  36 #endif
  37
  38 int VTKWriteTest(vtkTesting *t,vtkImageViewer *viewer,
  39                  std::string const & filename,
  40                  std::string const & referenceFileName)
  41 {
  42    int retVal = 0;  //by default this is an error
  43
  44    t->CleanArguments();
  45    t->AddArgument("-D");
  46    t->AddArgument( GDCM_DATA_ROOT );
  47    t->AddArgument("-V");
  48    t->AddArgument( referenceFileName.c_str() );
  49    t->AddArgument("-T");
  50    t->AddArgument( "." );
  51
  52    // Read the image
  53    vtkGdcmReader *origin = vtkGdcmReader::New();
  54    origin->SetFileName( filename.c_str() );
  55    origin->Update();
  56
  57    // Write the image
  58    vtkGdcmWriter *writer = vtkGdcmWriter::New();
  59    writer->SetFileName( "TestWrite.dcm" );
  60    writer->SetInput(origin->GetOutput());
  61    writer->Write();
  62
  63    origin->Delete();
  64    writer->Delete();
  65
  66    // Read the written image
  67    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
  68    reader->SetFileName( "TestWrite.dcm" );
  69    reader->Update();
  70
  71    double range[2];
  72    reader->GetOutput()->GetScalarRange(range);
  73    int dim[3];
  74    reader->GetOutput()->GetDimensions( dim );
  75
  76    // Show
  77    if( viewer )
  78    {
  79       viewer->SetInput ( reader->GetOutput() );
  80
  81       viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
  82       viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
  83
  84       viewer->SetSize(dim[0], dim[1]);
  85       if(dim[2] != 1)
  86       {
  87          //For multifame dicom, take a snapshot of the center slice (+/- 1)
  88          viewer->SetZSlice( dim[2] / 2 );
  89       }
  90       else
  91       {
  92          viewer->SetZSlice( 0 );
  93       }
  94
  95       viewer->OffScreenRenderingOff();
  96       viewer->Render();
  97       viewer->SetInput(NULL);
  98    }
  99
 100    //----------------------------------------------------------------------
 101    // Transform the image to be RGB unsigned char, due to the requests in
 102    // vtkTesting processing
 103    // The pipeline is broken after each process to keep maximum of memory
 104    vtkImageData *image=reader->GetOutput();
 105    image->Update();
 106    image->Register(NULL);
 107    reader->Delete();
 108
 109    // Get the middle slice in the image
 110    if(dim[2] != 1)
 111    {
 112       int *ext=image->GetExtent();
 113       vtkImageClip *clip=vtkImageClip::New();
 114       clip->SetInput(image);
 115       clip->SetOutputWholeExtent(ext[0],ext[1],ext[2],ext[3],
 116                                  ext[4]+dim[2] / 2,ext[4]+dim[2] / 2);
 117       clip->ClipDataOn();
 118       vtkImageTranslateExtent *translat=vtkImageTranslateExtent::New();
 119       translat->SetInput(clip->GetOutput());
 120       translat->SetTranslation(0,0,-ext[4]-dim[2] / 2);
 121
 122       image->UnRegister(NULL);
 123       image=translat->GetOutput();
 124       image->Update();
 125       image->Register(NULL);
 126       translat->SetOutput(NULL);
 127       clip->Delete();
 128       translat->Delete();
 129    }
 130
 131    // Set an unsigned char image
 132    // Shift/Scale the image
 133    image->Update();
 134    vtkImageShiftScale *iss=vtkImageShiftScale::New();
 135    iss->SetInput(image);
 136    iss->SetOutputScalarTypeToUnsignedChar();
 137    iss->SetShift(-range[0]);
 138    iss->SetScale(255.0/(range[1]-range[0]));
 139    iss->ClampOverflowOn();
 140
 141    image->UnRegister(NULL);
 142    image=iss->GetOutput();
 143    image->Update();
 144    image->Register(NULL);
 145    iss->Delete();
 146
 147    // Set 3 components to the image
 148    if(image->GetNumberOfScalarComponents()==1)
 149    {
 150       vtkImageAppendComponents *x3=vtkImageAppendComponents::New();
 151       x3->AddInput(image);
 152       x3->AddInput(image);
 153       x3->AddInput(image);
 154
 155       image->UnRegister(NULL);
 156       image=x3->GetOutput();
 157       image->Update();
 158       image->Register(NULL);
 159       x3->SetOutput(NULL);
 160       x3->Delete();
 161    }
 162    // End of transform
 163    //----------------------------------------------------------------------
 164
 165    // make test
 166    ostrstream str;
 167    retVal = t->RegressionTest(image,0.0,str);
 168    image->UnRegister(NULL);
 169
 170    if( retVal != vtkTesting::PASSED )
 171    {
 172       std::cerr << str.str();
 173    }
 174    str.rdbuf()->freeze(1);
 175
 176    if( retVal == vtkTesting::PASSED )
 177    {
 178       std::cerr << "       ... OK" << std::endl;
 179       return 0;
 180    }
 181    else
 182    {
 183       std::cerr << "       ... Failed" << std::endl;
 184       return 1;
 185    }
 186 }
 187
 188 int VTKTestWrite(int argc, char *argv[])
 189 {
 190    bool show = false;
 191    if( argc >= 2 )
 192    {
 193       if( std::string(argv[1]) == "-V" )
 194       {
 195          show = true;
 196       }
 197    }
 198
 199    int ret = 0;
 200    vtkTesting* t = vtkTesting::New();
 201    vtkImageViewer *viewer;
 202    if( show )
 203       viewer = vtkImageViewer::New();
 204    else
 205       viewer = NULL;
 206
 207    if( argc < 3+show )
 208    {
 209       std::cerr << "Usage: " << argv[0] << " [-V] image.dcm ref.png\n";
 210       std::cerr << "   -V : to view images to the screen... \n"
 211                 << "        this mode can generate errors in the test\n\n";
 212    }
 213    else
 214    {
 215       ret = VTKWriteTest(t,viewer,argv[1+show],argv[2+show]);
 216       t->Delete();
 217       if( viewer )
 218          viewer->Delete();
 219
 220       return ret;
 221    }
 222
 223    // Test for all images
 224    int i = 0;
 225    while( gdcmDataImages[i] != 0 )
 226    {
 227       std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
 228       filename += "/";  //doh!
 229       filename += gdcmDataImages[i];
 230       std::cerr << "Filename: " << filename << std::endl;
 231
 232       //Extract name to find the png file matching:
 233       std::string pngfile = gdcmDataImages[i++];
 234       //pngfile.replace(pngfile.size()-3, 3, "png");
 235       //More robust approach:
 236       std::string::size_type dot_pos = pngfile.rfind( "." );
 237       pngfile = pngfile.substr(0, dot_pos).append( ".png" );
 238       pngfile.insert( 0, "Baseline/");
 239       //std::cerr << "PNG file: " << pngfile << std::endl;
 240
 241       ret += VTKWriteTest(t,viewer,filename,pngfile);
 242    }
 243    t->Delete();
 244    if( viewer )
 245       viewer->Delete();
 246
 247    return ret;
 248 }