Testing/VTKTestWrite.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: VTKTestWrite.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/09/08 14:40:15 $
   7   Version:   $Revision: 1.11 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "vtkGdcmReader.h"
  19 #include "vtkGdcmWriter.h"
  20 #include "vtkImageViewer.h"
  21 #include "vtkImageData.h"
  22 #include "vtkRegressionTestImage.h"
  23 #include "vtkImageClip.h"
  24 #include "vtkImageTranslateExtent.h"
  25 #include "vtkImageAppendComponents.h"
  26 #include "vtkImageShiftScale.h"
  27
  28 #include <iostream>
  29
  30 //Generated file:
  31 #include "gdcmDataImages.h"
  32
  33 #include "gdcmDebug.h"
  34
  35 #ifndef vtkFloatingPointType
  36 #define vtkFloatingPointType float
  37 #endif
  38
  39 int VTKWriteTest(vtkTesting *t,vtkImageViewer *viewer,
  40                  std::string const &filename,
  41                  std::string const &referenceFileName)
  42 {
  43    int retVal;
  44
  45    t->CleanArguments();
  46    t->AddArgument("-D");
  47    t->AddArgument( GDCM_DATA_ROOT );
  48    t->AddArgument("-V");
  49    t->AddArgument( referenceFileName.c_str() );
  50    t->AddArgument("-T");
  51    t->AddArgument( "." );
  52
  53    // Read the image
  54    vtkGdcmReader *origin = vtkGdcmReader::New();
  55    origin->SetFileName( filename.c_str() );
  56    origin->Update();
  57
  58    std::cout << "1 ...";
  59
  60    // Write the image
  61    vtkGdcmWriter *writer = vtkGdcmWriter::New();
  62    writer->SetFileName( "TestWrite.dcm" );
  63    writer->SetInput(origin->GetOutput());
  64    std::cout << "2' ...",
  65    writer->Write();
  66
  67    std::cout << "2'' ...";
  68    origin->Delete();
  69    writer->Delete();
  70
  71    // Read the written image
  72    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
  73    reader->SetFileName( "TestWrite.dcm" );
  74    reader->Update();
  75
  76    std::cout << "3 ...";
  77    double range[2];
  78    reader->GetOutput()->GetScalarRange(range);
  79    int dim[3];
  80    reader->GetOutput()->GetDimensions( dim );
  81
  82    // Show
  83    if( viewer )
  84    {
  85       viewer->SetInput ( reader->GetOutput() );
  86
  87       viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
  88       viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
  89
  90       viewer->SetSize(dim[0], dim[1]);
  91       if(dim[2] != 1)
  92       {
  93          //For multiframe dicom, take a snapshot of the center slice (+/- 1)
  94          viewer->SetZSlice( dim[2] / 2 );
  95       }
  96       else
  97       {
  98          viewer->SetZSlice( 0 );
  99       }
 100
 101       viewer->OffScreenRenderingOff();
 102       viewer->Render();
 103       viewer->SetInput(NULL);
 104    }
 105
 106    std::cout << std::endl;
 107    //----------------------------------------------------------------------
 108    // Transform the image to be RGB unsigned char, due to the requests in
 109    // vtkTesting processing
 110    // The pipeline is broken after each process to keep maximum of memory
 111    vtkImageData *image=reader->GetOutput();
 112    image->Update();
 113    image->Register(NULL);
 114    reader->Delete();
 115
 116    // Get the middle slice in the image
 117    if(dim[2] != 1)
 118    {
 119       int *ext=image->GetExtent();
 120       vtkImageClip *clip=vtkImageClip::New();
 121       clip->SetInput(image);
 122       clip->SetOutputWholeExtent(ext[0],ext[1],ext[2],ext[3],
 123                                  ext[4]+dim[2] / 2,ext[4]+dim[2] / 2);
 124       clip->ClipDataOn();
 125       vtkImageTranslateExtent *translat=vtkImageTranslateExtent::New();
 126       translat->SetInput(clip->GetOutput());
 127       translat->SetTranslation(0,0,-ext[4]-dim[2] / 2);
 128
 129       image->UnRegister(NULL);
 130       image=translat->GetOutput();
 131       image->Update();
 132       image->Register(NULL);
 133       translat->SetOutput(NULL);
 134       clip->Delete();
 135       translat->Delete();
 136    }
 137
 138    // Set an unsigned char image
 139    // Shift/Scale the image
 140    image->Update();
 141    vtkImageShiftScale *iss=vtkImageShiftScale::New();
 142    iss->SetInput(image);
 143    iss->SetOutputScalarTypeToUnsignedChar();
 144    iss->SetShift(-range[0]);
 145    iss->SetScale(255.0/(range[1]-range[0]));
 146    iss->ClampOverflowOn();
 147
 148    image->UnRegister(NULL);
 149    image=iss->GetOutput();
 150    image->Update();
 151    image->Register(NULL);
 152    iss->Delete();
 153
 154    // Set 3 components to the image
 155    if(image->GetNumberOfScalarComponents()==1)
 156    {
 157       vtkImageAppendComponents *x3=vtkImageAppendComponents::New();
 158       x3->AddInput(image);
 159       x3->AddInput(image);
 160       x3->AddInput(image);
 161
 162       image->UnRegister(NULL);
 163       image=x3->GetOutput();
 164       image->Update();
 165       image->Register(NULL);
 166       x3->SetOutput(NULL);
 167       x3->Delete();
 168    }
 169    // End of transform
 170    //----------------------------------------------------------------------
 171
 172    // make test
 173    ostrstream str;
 174    retVal = t->RegressionTest(image,0.0,str);
 175    image->UnRegister(NULL);
 176
 177    if( retVal != vtkTesting::PASSED )
 178    {
 179       std::cerr << str.str();
 180    }
 181    str.rdbuf()->freeze(1);
 182
 183    if( retVal == vtkTesting::PASSED )
 184    {
 185       std::cerr << "       ... OK" << std::endl;
 186       return 0;
 187    }
 188    else
 189    {
 190       std::cerr << "       ... Failed" << std::endl;
 191       return 1;
 192    }
 193 }
 194
 195 int VTKTestWrite(int argc, char *argv[])
 196 {
 197    bool show = false;
 198    if( argc >= 2 )
 199    {
 200       if( std::string(argv[1]) == "-V" )
 201       {
 202          show = true;
 203       }
 204    }
 205
 206 //   gdcm::Debug::DebugOn();
 207
 208    int ret = 0;
 209    vtkTesting *t = vtkTesting::New();
 210    vtkImageViewer *viewer;
 211    if( show )
 212       viewer = vtkImageViewer::New();
 213    else
 214       viewer = NULL;
 215
 216    if( argc < 3+show )
 217    {
 218       std::cerr << "Usage: " << argv[0] << " [-V] image.dcm ref.png\n";
 219       std::cerr << "   -V : to view images to the screen... \n"
 220                 << "        this mode can generate errors in the test\n\n";
 221    }
 222    else
 223    {
 224       ret = VTKWriteTest(t,viewer,argv[1+show],argv[2+show]);
 225       t->Delete();
 226       if( viewer )
 227          viewer->Delete();
 228
 229       return ret;
 230    }
 231
 232    // Test for all images
 233    int i = 0;
 234    while( gdcmDataImages[i] != 0 )
 235    {
 236       std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
 237       filename += "/";  //doh!
 238       filename += gdcmDataImages[i];
 239       std::cerr << "Filename: " << filename << std::endl;
 240
 241       //Extract name to find the png file matching:
 242       std::string pngfile = gdcmDataImages[i++];
 243       //pngfile.replace(pngfile.size()-3, 3, "png");
 244       //More robust approach:
 245       std::string::size_type dot_pos = pngfile.rfind( "." );
 246       pngfile = pngfile.substr(0, dot_pos).append( ".png" );
 247       pngfile.insert( 0, "Baseline/");
 248       //std::cerr << "PNG file: " << pngfile << std::endl;
 249
 250       ret += VTKWriteTest(t,viewer,filename,pngfile);
 251    }
 252    t->Delete();
 253    if( viewer )
 254       viewer->Delete();
 255
 256    return ret;
 257 }