]> Creatis software - gdcm.git/blob - Testing/VTKTestWrite.cxx
cosmetics
[gdcm.git] / Testing / VTKTestWrite.cxx
1 /*=========================================================================
2                                                                                 
3   Program:   gdcm
4   Module:    $RCSfile: VTKTestWrite.cxx,v $
5   Language:  C++
6   Date:      $Date: 2007/09/18 07:58:38 $
7   Version:   $Revision: 1.12 $
8
9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
12                                                                                 
13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
16                                                                                 
17 =========================================================================*/
18 #include "vtkGdcmReader.h"
19 #include "vtkGdcmWriter.h"
20 #include "vtkImageViewer.h"
21 #include "vtkImageData.h"
22 #include "vtkRegressionTestImage.h"
23 #include "vtkImageClip.h"
24 #include "vtkImageTranslateExtent.h"
25 #include "vtkImageAppendComponents.h"
26 #include "vtkImageShiftScale.h"
27
28 #include <iostream>
29 #include <sstream>
30
31 //Generated file:
32 #include "gdcmDataImages.h"
33
34 #include "gdcmDebug.h"
35
36 #ifndef vtkFloatingPointType
37 #define vtkFloatingPointType float
38 #endif
39
40 int VTKWriteTest(vtkTesting *t,vtkImageViewer *viewer,
41                  std::string const &filename, 
42                  std::string const &referenceFileName)
43 {
44    int retVal;
45
46    t->CleanArguments();
47    t->AddArgument("-D");
48    t->AddArgument( GDCM_DATA_ROOT );
49    t->AddArgument("-V");
50    t->AddArgument( referenceFileName.c_str() );
51    t->AddArgument("-T");
52    t->AddArgument( "." );
53
54    // Read the image   
55    vtkGdcmReader *origin = vtkGdcmReader::New();
56    origin->SetFileName( filename.c_str() );
57    origin->Update();
58   
59    std::cout << "1 ...";
60    
61    // Write the image
62    vtkGdcmWriter *writer = vtkGdcmWriter::New();
63    writer->SetFileName( "TestWrite.dcm" );
64    writer->SetInput(origin->GetOutput());
65    std::cout << "2' ...",
66    writer->Write();
67
68    std::cout << "2'' ...";
69    origin->Delete();
70    writer->Delete();
71
72    // Read the written image   
73    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
74    reader->SetFileName( "TestWrite.dcm" );
75    reader->Update();
76
77    std::cout << "3 ...";
78    double range[2];
79    reader->GetOutput()->GetScalarRange(range);
80    int dim[3];
81    reader->GetOutput()->GetDimensions( dim );
82
83    // Show
84    if( viewer )
85    {
86       viewer->SetInput ( reader->GetOutput() );
87
88       viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
89       viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
90
91       viewer->SetSize(dim[0], dim[1]);
92       if(dim[2] != 1)
93       {
94          //For multiframe dicom, take a snapshot of the center slice (+/- 1)
95          viewer->SetZSlice( dim[2] / 2 );
96       }
97       else
98       {
99          viewer->SetZSlice( 0 );
100       }
101
102       viewer->OffScreenRenderingOff();
103       viewer->Render();
104       viewer->SetInput(NULL);
105    }
106
107    std::cout << std::endl;
108    //----------------------------------------------------------------------
109    // Transform the image to be RGB unsigned char, due to the requests in
110    // vtkTesting processing
111    // The pipeline is broken after each process to keep maximum of memory
112    vtkImageData *image=reader->GetOutput();
113    image->Update();
114    image->Register(NULL);
115    reader->Delete();
116
117    // Get the middle slice in the image
118    if(dim[2] != 1)
119    {
120       int *ext=image->GetExtent();
121       vtkImageClip *clip=vtkImageClip::New();
122       clip->SetInput(image);
123       clip->SetOutputWholeExtent(ext[0],ext[1],ext[2],ext[3],
124                                  ext[4]+dim[2] / 2,ext[4]+dim[2] / 2);
125       clip->ClipDataOn();
126       vtkImageTranslateExtent *translat=vtkImageTranslateExtent::New();
127       translat->SetInput(clip->GetOutput());
128       translat->SetTranslation(0,0,-ext[4]-dim[2] / 2);
129
130       image->UnRegister(NULL);
131       image=translat->GetOutput();
132       image->Update();
133       image->Register(NULL);
134       translat->SetOutput(NULL);
135       clip->Delete();
136       translat->Delete();
137    }
138
139    // Set an unsigned char image
140    // Shift/Scale the image 
141    image->Update();
142    vtkImageShiftScale *iss=vtkImageShiftScale::New();
143    iss->SetInput(image);
144    iss->SetOutputScalarTypeToUnsignedChar();
145    iss->SetShift(-range[0]);
146    iss->SetScale(255.0/(range[1]-range[0]));
147    iss->ClampOverflowOn();
148
149    image->UnRegister(NULL);
150    image=iss->GetOutput();
151    image->Update();
152    image->Register(NULL);
153    iss->Delete();
154
155    // Set 3 components to the image
156    if(image->GetNumberOfScalarComponents()==1)
157    {
158       vtkImageAppendComponents *x3=vtkImageAppendComponents::New();
159       x3->AddInput(image);
160       x3->AddInput(image);
161       x3->AddInput(image);
162
163       image->UnRegister(NULL);
164       image=x3->GetOutput();
165       image->Update();
166       image->Register(NULL);
167       x3->SetOutput(NULL);
168       x3->Delete();
169    }
170    // End of transform
171    //----------------------------------------------------------------------
172
173    // make test
174    std::ostringstream str;
175    retVal = t->RegressionTest(image,0.0,str);
176    image->UnRegister(NULL);
177
178    if( retVal != vtkTesting::PASSED )
179    {
180       std::cerr << str.str();
181    }
182
183    if( retVal == vtkTesting::PASSED )
184    {
185       std::cerr << "       ... OK" << std::endl;
186       return 0;
187    }
188    else
189    {
190       std::cerr << "       ... Failed" << std::endl;
191       return 1;
192    }
193 }
194
195 int VTKTestWrite(int argc, char *argv[])
196 {
197    bool show = false;
198    if( argc >= 2 )
199    {
200       if( std::string(argv[1]) == "-V" )
201       {
202          show = true;
203       }
204    }
205
206 //   gdcm::Debug::DebugOn();
207
208    int ret = 0;
209    vtkTesting *t = vtkTesting::New();
210    vtkImageViewer *viewer;
211    if( show )
212       viewer = vtkImageViewer::New();
213    else
214       viewer = NULL;
215
216    if( argc < 3+show )
217    {
218       std::cerr << "Usage: " << argv[0] << " [-V] image.dcm ref.png\n";
219       std::cerr << "   -V : to view images to the screen... \n"
220                 << "        this mode can generate errors in the test\n\n";
221    }
222    else
223    {
224       ret = VTKWriteTest(t,viewer,argv[1+show],argv[2+show]);
225       t->Delete();
226       if( viewer )
227          viewer->Delete();
228
229       return ret;
230    }
231
232    // Test for all images
233    int i = 0;
234    while( gdcmDataImages[i] != 0 )
235    {
236       std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
237       filename += "/";  //doh!
238       filename += gdcmDataImages[i];
239       std::cerr << "Filename: " << filename << std::endl;
240
241       //Extract name to find the png file matching:
242       std::string pngfile = gdcmDataImages[i++];
243       //pngfile.replace(pngfile.size()-3, 3, "png");
244       //More robust approach:
245       std::string::size_type dot_pos = pngfile.rfind( "." );
246       pngfile = pngfile.substr(0, dot_pos).append( ".png" );
247       pngfile.insert( 0, "Baseline/");
248       //std::cerr << "PNG file: " << pngfile << std::endl;
249
250       ret += VTKWriteTest(t,viewer,filename,pngfile);
251    }
252    t->Delete();
253    if( viewer )
254       viewer->Delete();
255
256    return ret;
257 }