Testing/VTKTestWriteSeq.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: VTKTestWriteSeq.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/02/13 12:06:29 $
   7   Version:   $Revision: 1.2 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "vtkGdcmReader.h"
  19 #include "vtkGdcmWriter.h"
  20 #include "vtkImageViewer.h"
  21 #include "vtkImageData.h"
  22 #include "vtkRegressionTestImage.h"
  23 #include "vtkImageClip.h"
  24 #include "vtkImageTranslateExtent.h"
  25 #include "vtkImageAppendComponents.h"
  26 #include "vtkImageShiftScale.h"
  27
  28 #include <iostream>
  29
  30 //Generated file:
  31 #include "gdcmDataSeqImages.h"
  32 #include "gdcmDebug.h"
  33
  34 #ifndef vtkFloatingPointType
  35 #define vtkFloatingPointType float
  36 #endif
  37
  38 int VTKWriteSeqTest(vtkTesting *t, vtkImageViewer *viewer,
  39                    std::string const &filename,
  40                    std::string const &referenceFileName)
  41 {
  42    int retVal = 0;  //by default this is an error
  43
  44    // Set the reader
  45    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
  46
  47    char *newFileDcm = new char[filename.size()+1];
  48    int fileCount = 0;
  49    for(int i=0;i<9;i++)
  50    {
  51       fileCount = i;
  52       sprintf(newFileDcm,filename.c_str(),i);
  53
  54       // Test the existance of the file
  55       ifstream opened(newFileDcm,std::ios::in | std::ios::binary);
  56       if(opened)
  57       {
  58          reader->AddFileName(newFileDcm);
  59          opened.close();
  60       }
  61       else
  62          break;
  63    }
  64    delete[] newFileDcm;
  65    reader->Update();
  66
  67    // Write the image
  68    vtkGdcmWriter *writer = vtkGdcmWriter::New();
  69    writer->SetFilePattern("%s%02d.dcm");
  70    writer->SetFilePrefix("TestWrite");
  71    writer->SetFileDimensionality(2);
  72    writer->SetInput(reader->GetOutput());
  73    writer->Write();
  74
  75    reader->Delete();
  76    writer->Delete();
  77
  78    // Reread the image
  79    reader = vtkGdcmReader::New();
  80    reader->SetFilePattern("%s%02d.dcm");
  81    reader->SetFilePrefix("TestWrite");
  82    reader->SetFileNameSliceOffset(0);
  83    reader->SetFileNameSliceSpacing(1);
  84    reader->SetDataExtent(0,0,0,0,0,fileCount-1);
  85    reader->Update();
  86
  87    double range[2];
  88    reader->GetOutput()->GetScalarRange(range);
  89
  90    // Show
  91    if( viewer )
  92    {
  93       viewer->SetInput ( reader->GetOutput() );
  94       viewer->OffScreenRenderingOff();
  95
  96       viewer->SetColorWindow (range[1] - range[0]);
  97       viewer->SetColorLevel (0.5 * (range[1] + range[0]));
  98
  99       int dim[3];
 100       reader->GetOutput()->GetDimensions( dim );
 101       viewer->SetSize(dim[0], dim[1]);
 102       viewer->SetZSlice( 0 );
 103       viewer->Render();
 104       viewer->SetInput(NULL);
 105    }
 106
 107    // make test
 108    int ret = 0;
 109    ostrstream str;
 110    char *newFilePng = new char[referenceFileName.size()+1];
 111    for(int j=0;j<fileCount;j++)
 112    {
 113       sprintf(newFilePng,referenceFileName.c_str(),j);
 114
 115       t->CleanArguments();
 116       t->AddArgument("-D");
 117       t->AddArgument( GDCM_DATA_ROOT );
 118       t->AddArgument("-V");
 119       t->AddArgument( newFilePng );
 120       t->AddArgument("-T");
 121       t->AddArgument( "." );
 122
 123       //----------------------------------------------------------------------
 124       // Transform the image to be RGB unsigned char, due to the requests in
 125       // vtkTesting processing
 126       // The pipeline is broken after each process to keep maximum of memory
 127       vtkImageData *image=reader->GetOutput();
 128       image->Update();
 129       image->Register(NULL);
 130
 131       // Get the middle slice in the image
 132       int *ext=image->GetExtent();
 133       vtkImageClip *clip=vtkImageClip::New();
 134       clip->SetInput(image);
 135       clip->SetOutputWholeExtent(ext[0],ext[1],ext[2],ext[3],j,j);
 136       clip->ClipDataOn();
 137       vtkImageTranslateExtent *translat=vtkImageTranslateExtent::New();
 138       translat->SetInput(clip->GetOutput());
 139       translat->SetTranslation(0,0,-j);
 140
 141       image->UnRegister(NULL);
 142       image=translat->GetOutput();
 143       image->Update();
 144       image->Register(NULL);
 145       translat->SetOutput(NULL);
 146       clip->Delete();
 147       translat->Delete();
 148
 149       // Set an unsigned char image
 150       // Shift/Scale the image
 151       image->Update();
 152       vtkImageShiftScale *iss=vtkImageShiftScale::New();
 153       iss->SetInput(image);
 154       iss->SetOutputScalarTypeToUnsignedChar();
 155       iss->SetShift(-range[0]);
 156       iss->SetScale(255.0/(range[1]-range[0]));
 157       iss->ClampOverflowOn();
 158
 159       image->UnRegister(NULL);
 160       image=iss->GetOutput();
 161       image->Update();
 162       image->Register(NULL);
 163       iss->Delete();
 164
 165       // Set 3 components to the image
 166       if(image->GetNumberOfScalarComponents()==1)
 167       {
 168          vtkImageAppendComponents *x3=vtkImageAppendComponents::New();
 169          x3->AddInput(image);
 170          x3->AddInput(image);
 171          x3->AddInput(image);
 172
 173          image->UnRegister(NULL);
 174          image=x3->GetOutput();
 175          image->Update();
 176          image->Register(NULL);
 177          x3->SetOutput(NULL);
 178          x3->Delete();
 179       }
 180       // End of transform
 181       //----------------------------------------------------------------------
 182
 183       // make test
 184       retVal = t->RegressionTest(image,2.0,str);
 185       image->UnRegister(NULL);
 186
 187       if( retVal != vtkTesting::PASSED )
 188       {
 189          std::cerr << str.str();
 190       }
 191       str.rdbuf()->freeze(1);
 192
 193       if( retVal == vtkTesting::PASSED )
 194       {
 195          std::cerr << "       ...Slice " << j << ": OK" << std::endl;
 196       }
 197       else
 198       {
 199          std::cerr << "       ...Slice " << j << ": Failed" << std::endl;
 200          ret++;
 201       }
 202    }
 203
 204    delete[] newFilePng;
 205    reader->Delete();
 206
 207    return ret;
 208 }
 209
 210 int VTKTestWriteSeq(int argc, char *argv[])
 211 {
 212    bool show = false;
 213    if( argc >= 2 )
 214    {
 215       if( std::string(argv[1]) == "-V" )
 216       {
 217          show = true;
 218       }
 219    }
 220
 221    gdcm::Debug::DebugOn();
 222
 223    int ret = 0;
 224    vtkTesting *t = vtkTesting::New();
 225    vtkImageViewer *viewer;
 226    if( show )
 227       viewer = vtkImageViewer::New();
 228    else
 229       viewer = NULL;
 230
 231    if( argc < 3+show )
 232    {
 233       std::cerr << "Usage: " << argv[0] << " [-V] image%d.dcm ref%d.png\n";
 234       std::cerr << "   -V : to view images to the screen... \n"
 235                 << "        this mode can generate errors in the test\n";
 236       std::cerr << "   %d : this will be replaced by a number at execution.\n"
 237                 << "        It will be from 0 to 9 only with a step of 1\n\n";
 238    }
 239    else
 240    {
 241       ret = VTKWriteSeqTest(t,viewer,argv[1+show],argv[2+show]);
 242       t->Delete();
 243       if( viewer )
 244          viewer->Delete();
 245
 246       return ret;
 247    }
 248
 249    // Test for all images
 250    int i = 0;
 251    while( gdcmDataSeqImages[i] != 0 )
 252    {
 253       std::string filename = GDCM_DATA_ROOT;
 254       filename += "/";  //doh!
 255       filename += gdcmDataSeqImages[i];
 256       std::cerr << "Filename: " << filename << std::endl;
 257
 258       //Extract name to find the png file matching:
 259       std::string pngfile = gdcmDataSeqImages[i++];
 260       std::string::size_type dot_pos = pngfile.rfind( "." );
 261       pngfile = pngfile.substr(0, dot_pos).append( ".png" );
 262       pngfile.insert( 0, "Baseline/");
 263
 264       ret += VTKWriteSeqTest(t,viewer,filename,pngfile);
 265    }
 266    t->Delete();
 267    if( viewer )
 268       viewer->Delete();
 269
 270    return ret;
 271 }