appli/CTBronchi/MoriLabelling.h

   1 // =========================================================================
   2 // @author Leonardo Florez Valencia
   3 // @email florez-l@javeriana.edu.co
   4 // =========================================================================
   5 #ifndef __CTBronchi__MoriLabelling__h__
   6 #define __CTBronchi__MoriLabelling__h__
   7
   8 #include <fpa/Filters/BaseMarksInterface.h>
   9 #include <fpa/Filters/Image/SeedsFromLabelsInterface.h>
  10 #include <fpa/Filters/Image/DefaultTraits.h>
  11 #include <fpa/Filters/Image/RegionGrow.h>
  12 #include <fpa/Functors/RegionGrow/BinaryThreshold.h>
  13
  14 namespace CTBronchi
  15 {
  16   /**
  17    */
  18   template< class _TImage, class _TLabels >
  19   class MoriLabellingTraits
  20     : public fpa::Filters::Image::DefaultTraits< _TImage, _TLabels, typename _TLabels::PixelType >
  21   {
  22   public:
  23     typedef fpa::Filters::Image::DefaultTraits< _TImage, _TLabels, typename _TLabels::PixelType > Superclass;
  24     typedef typename Superclass::TInternalTraits  TInternalTraits;
  25     typedef typename Superclass::TMarksImage      TMarksImage;
  26     typedef typename Superclass::TFilterInterface TFilterInterface;
  27
  28     typedef fpa::Filters::BaseMarksInterface< TInternalTraits >  TMarksInterface;
  29     typedef fpa::Filters::Image::SeedsFromLabelsInterface< TInternalTraits > TSeedsInterface;
  30   };
  31
  32   /**
  33    */
  34   template< class _TImage, class _TLabels, class _TScalarImage >
  35   class MoriLabelling
  36     : public fpa::Filters::Image::RegionGrow< _TImage, _TLabels, typename _TLabels::PixelType, CTBronchi::MoriLabellingTraits< _TImage, _TLabels > >
  37   {
  38   public:
  39     typedef CTBronchi::MoriLabellingTraits< _TImage, _TLabels > TTraits;
  40     fpaTraitsMacro( typename TTraits );
  41
  42     typedef fpa::Filters::Image::RegionGrow< _TImage, _TLabels, TMark, TTraits > Superclass;
  43     typedef MoriLabelling Self;
  44     typedef itk::SmartPointer< Self > Pointer;
  45     typedef itk::SmartPointer< const Self > ConstPointer;
  46
  47     typedef fpa::Functors::RegionGrow::BinaryThreshold< TInputValue > TFunctor;
  48
  49   public:
  50     itkNewMacro( Self );
  51     itkTypeMacro( MoriLabelling, fpa::Filters::Image::RegionGrow );
  52
  53     itkGetConstMacro( VesselnessThreshold, double );
  54     itkSetMacro( VesselnessThreshold, double );
  55
  56     itkGetConstMacro( UpperThreshold, TInputValue );
  57     itkSetMacro( UpperThreshold, TInputValue );
  58
  59     ivqITKInputMacro( InputLabels, _TLabels );
  60     ivqITKInputMacro( InputVesselness, _TScalarImage );
  61
  62   protected:
  63     MoriLabelling( )
  64       : Superclass( ),
  65         m_VesselnessThreshold( 0.05 ),
  66         m_UpperThreshold( -650 )
  67       {
  68         ivqITKInputConfigureMacro( InputLabels, _TLabels );
  69         ivqITKInputConfigureMacro( InputVesselness, _TScalarImage );
  70         this->m_Functor = TFunctor::New( );
  71         this->SetPredicate( this->m_Functor );
  72       }
  73
  74     virtual ~MoriLabelling( )
  75       {
  76       }
  77
  78   private:
  79     // Purposely not implemented.
  80     MoriLabelling( const Self& other );
  81     Self& operator=( const Self& other );
  82
  83   protected:
  84     typename TFunctor::Pointer m_Functor;
  85     double m_VesselnessThreshold;
  86     TInputValue m_UpperThreshold;
  87   };
  88
  89 } // ecapseman
  90
  91 #endif // __CTBronchi__Functions__h__
  92
  93 // eof - $RCSfile$