appli/Dcm2VtkImageData/Dcm2VtkImageData.cxx

   1 /*
   2         # ---------------------------------------------------------------------
   3         #
   4         # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   5         #                        pour la Santé)
   6         # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7         # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   8         # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   9         #
  10         #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  11         #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  12         #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  13         #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  14         #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  15         #  or in the file LICENSE.txt.
  16         #
  17         #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  18         #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  19         #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  20         #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  21         #  liability.
  22         #
  23         #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  24         #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  25         # ------------------------------------------------------------------------
  26 */
  27 /*=========================================================================
  28
  29   Program:   creaBruker
  30   Module:    $RCSfile: Dcm2VtkImageData.cxx,v $
  31   Language:  C++
  32   Date:      $Date: 2012/11/15 13:31:39 $
  33   Version:   $Revision: 1.2 $
  34
  35      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  36      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  37      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  38
  39 =========================================================================*/
  40
  41 /**
  42  *
  43  */
  44
  45 #include "gdcmCommon.h"
  46 #include "gdcmDebug.h"
  47 #include "gdcmUtil.h"
  48 #include "gdcmDirList.h"
  49
  50 #include "gdcmArgMgr.h"
  51 #include "vtkGdcmReader.h"
  52
  53 // ===================================================================================================
  54
  55
  56 int main(int argc, char *argv[])
  57 {
  58    START_USAGE(usage)
  59    " \n Dcm2VtkImageData : \n                                                 ",
  60    " usage: Dcm2VtkImageData dirin=rootDirectoryName                          ",
  61    "                         nb=number of Slices                              ",
  62    "                   [debug] [verbose]                                      ",
  63    "                                                                          ",
  64    "  debug      : developper wants to run the program in 'debug mode'        ",
  65    FINISH_USAGE
  66
  67    // ------------ Initialize Arguments Manager ----------------
  68
  69    GDCM_NAME_SPACE::ArgMgr *am= new GDCM_NAME_SPACE::ArgMgr(argc, argv);
  70
  71    if (argc == 1 || am->ArgMgrDefined("usage") )
  72    {
  73       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
  74       delete am;
  75       return 1;
  76    }
  77
  78    const char *dirNamein;
  79    dirNamein  = am->ArgMgrGetString("dirin",".");
  80    int nb = am->ArgMgrGetInt("nb",1);
  81
  82    if (am->ArgMgrDefined("debug"))
  83       GDCM_NAME_SPACE::Debug::DebugOn();
  84
  85    bool verbose  = am->ArgMgrDefined("verbose");
  86
  87    /* if unused Param we give up */
  88    if ( am->ArgMgrPrintUnusedLabels() )
  89    {
  90       am->ArgMgrUsage(usage);
  91       delete am;
  92       return 1;
  93    }
  94
  95    delete am;  // we don't need Argument Manager any longer
  96
  97    // ----------- End Arguments Manager ---------
  98
  99 //2dseq_Slice_0.dcm
 100
 101    // ----- Begin Processing -----
 102    vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
 103    std::vector <vtkImageData *> output;
 104    char nomFich[1024]; // Hope it's enough !
 105
 106    for (int i = 0; i < nb; i++)
 107    {
 108       sprintf(nomFich, "%s%c2dseq_Slice_%d.dcm",
 109          dirNamein,
 110          GDCM_NAME_SPACE::GDCM_FILESEPARATOR,
 111          i);
 112       if (verbose)
 113          std::cout << "file to be processed : [" << nomFich << ")" << std::endl;
 114       reader->SetFileName(nomFich);
 115       reader->Update();
 116       output.push_back(reader->GetOutput());
 117    }
 118
 119    // Here you call the function that processes the vtkImageData vector
 120 }
 121
 122