appli/examples/example_ImageAlgorithmRegionGrow_MultipleThresholds.cxx

   1 #include <iostream>
   2 #include <limits>
   3 #include <set>
   4 #include <string>
   5
   6 #include <itkImage.h>
   7 #include <itkImageFileReader.h>
   8 #include <itkImageToVTKImageFilter.h>
   9
  10 #include <vtkImageActor.h>
  11 #include <vtkProperty.h>
  12 #include <vtkRenderer.h>
  13 #include <vtkRenderWindow.h>
  14 #include <vtkRenderWindowInteractor.h>
  15 #include <vtkSmartPointer.h>
  16 #include <vtkSphereSource.h>
  17
  18 #include <fpa/Image/RegionGrowWithMultipleThresholds.h>
  19 #include <fpa/VTK/ImageMPR.h>
  20 #include <fpa/VTK/Image3DObserver.h>
  21
  22 // -------------------------------------------------------------------------
  23 const unsigned int Dim = 3;
  24 typedef short TPixel;
  25 typedef double TScalar;
  26 typedef itk::Image< TPixel, Dim >  TImage;
  27 typedef itk::ImageToVTKImageFilter< TImage > TVTKImage;
  28
  29 typedef itk::ImageFileReader< TImage >   TImageReader;
  30
  31 typedef
  32 fpa::Image::RegionGrowWithMultipleThresholds< TImage >
  33 TFrontAlgorithm;
  34 typedef
  35 fpa::VTK::Image3DObserver< TFrontAlgorithm, vtkRenderWindow >
  36 TObserver;
  37
  38 // -------------------------------------------------------------------------
  39 int main( int argc, char* argv[] )
  40 {
  41   if( argc < 5 )
  42   {
  43     std::cerr
  44       << "Usage: " << argv[ 0 ]
  45       << " input_image thr_0 thr_1 step" << std::endl;
  46     return( 1 );
  47
  48   } // fi
  49   std::string input_image_fn = argv[ 1 ];
  50   TPixel thr_0 = TPixel( std::atof( argv[ 2 ] ) );
  51   TPixel thr_1 = TPixel( std::atof( argv[ 3 ] ) );
  52   unsigned int step = std::atoi( argv[ 4 ] );
  53
  54   // Read image
  55   TImageReader::Pointer input_image_reader = TImageReader::New( );
  56   input_image_reader->SetFileName( input_image_fn );
  57   try
  58   {
  59     input_image_reader->Update( );
  60   }
  61   catch( itk::ExceptionObject& err )
  62   {
  63     std::cerr << "Error caught: " << err << std::endl;
  64     return( 1 );
  65
  66   } // yrt
  67   TImage::ConstPointer input_image = input_image_reader->GetOutput( );
  68   TImage::SpacingType spac = input_image->GetSpacing( );
  69   double min_spac = spac[ 0 ];
  70   for( unsigned int d = 1; d < Dim; d++ )
  71     min_spac = ( spac[ d ] < min_spac )? spac[ d ]: min_spac;
  72
  73   TVTKImage::Pointer vtk_image = TVTKImage::New( );
  74   vtk_image->SetInput( input_image );
  75   vtk_image->Update( );
  76
  77   fpa::VTK::ImageMPR view;
  78   view.SetBackground( 0.3, 0.2, 0.8 );
  79   view.SetSize( 800, 800 );
  80   view.SetImage( vtk_image->GetOutput( ) );
  81
  82   // Wait for a seed to be given
  83   while( view.GetNumberOfSeeds( ) == 0 )
  84     view.Start( );
  85
  86   // Convert seed
  87   double seed[ 3 ];
  88   view.GetSeed( 0, seed );
  89   TImage::PointType seed_pnt;
  90   seed_pnt[ 0 ] = seed[ 0 ];
  91   seed_pnt[ 1 ] = seed[ 1 ];
  92   seed_pnt[ 2 ] = seed[ 2 ];
  93   TImage::IndexType seed_idx;
  94   input_image->TransformPhysicalPointToIndex( seed_pnt, seed_idx );
  95
  96   // Configure observer
  97   TObserver::Pointer obs = TObserver::New( );
  98   obs->SetImage( input_image, view.GetWindow( ) );
  99
 100   // Configure algorithm
 101   TFrontAlgorithm::Pointer algorithm = TFrontAlgorithm::New( );
 102   algorithm->AddThresholds( thr_0, thr_1, step );
 103   algorithm->AddSeed( seed_idx, 0 );
 104   algorithm->AddObserver( itk::AnyEvent( ), obs );
 105   algorithm->ThrowEventsOn( );
 106   algorithm->SetInput( input_image );
 107   algorithm->SetNeighborhoodOrder( 1 );
 108   algorithm->SetDifferenceThreshold( double( 3 ) );
 109   algorithm->Update( );
 110
 111   // Let some interaction and close program
 112   view.Start( );
 113   return( 0 );
 114 }
 115
 116 // eof - $RCSfile$