appli/template_creaPatientsSystem/scripts/00200_InitialParameters.bbs

   1 # ----------------------------------
   2 # - BBTKGEditor v 1.4 BBS BlackBox Script
   3 # - /Users/davila/Creatis/C11/creatools_source/creaMiniTools/appli/template_creaPatientsSystem/scripts/00200_InitialParameters.bbs
   4 # ----------------------------------
   5
   6 # BBTK GEditor Script
   7 # ----------------------
   8
   9 include std
  10 include itkvtk
  11 include std
  12 include wx
  13 include creaVtk
  14 include vtk
  15 include creaMaracasVisu
  16 include creaMiniTools
  17
  18 author "Author ??"
  19 description "Description ??"
  20 category "<VOID>"
  21
  22 new std:ConcatStrings Box01
  23
  24 new std:ConcatStrings Box02
  25
  26 new wx:LayoutLine Box04
  27
  28 new creaVtk:OutputWindow Box05
  29
  30 new std:ConcatStrings Box06
  31   set Box06.In1 "<CORE>/davila/00100_OriginalImages/Test_01/<PATIENT>/Condition_01"
  32
  33 new wx:OutputText Box07
  34
  35 new std:ReplaceCleanString Box08
  36   set Box08.Search "<PATIENT>"
  37
  38 new std:ConcatStrings Box09
  39   set Box09.In2 "/results/"
  40
  41 new std:ConcatStrings Box10
  42
  43 new std:ReplaceCleanString Box11
  44   set Box11.Search "<CORE>"
  45
  46 new std:ConcatStrings Box12
  47   set Box12.In2 "/image.mha"
  48
  49 new vtk:MetaImageReader Box13
  50
  51 new creaMaracasVisu:ViewerNV Box14
  52
  53 new wx:LayoutSplit Box15
  54   set Box15.Orientation "H"
  55   set Box15.WinTitle "00200_InitialParameters.bbg"
  56
  57 new wx:Slider Box16
  58   set Box16.In "100"
  59   set Box16.ReactiveOnTrack "true"
  60   set Box16.Title "Threshold"
  61
  62 new creaVtk:ImageThreshold Box17
  63   set Box17.InValue "255"
  64   set Box17.OutValue "0"
  65   set Box17.Upper "10000"
  66
  67 new creaMaracasVisu:ColorLayerImageView Box18
  68   set Box18.TypeControlsInterface "2"
  69
  70 new wx:CommandButton Box19
  71   set Box19.Label "Save and Close"
  72
  73 new std:MultipleInputs Box20
  74
  75 new std:Exit Box22
  76
  77 new std:ConcatStrings Box23
  78   set Box23.In2 "/InitialParameters.txt"
  79
  80 new std:StringWriter Box24
  81
  82 new std:ConcatStrings Box25
  83   set Box25.In1 "Threshold  "
  84
  85 new std:ReadColumnsString Box26
  86   set Box26.Dimension "2"
  87
  88 new std:GetVectorStringElement Box27
  89   set Box27.ErrorValue "100"
  90   set Box27.I "0"
  91
  92 new std:ReplaceCleanString Box29
  93   set Box29.Replace "00200_InitialParameters"
  94   set Box29.Search "00100_OriginalImages"
  95
  96 new std:ConcatStrings Box30
  97   set Box30.In1 "mkdir -p    "
  98
  99 new std:ExecSystemCommand Box31
 100
 101 new creaMaracasVisu:ImageChangeInformation Box32
 102
 103 new vtk:ImageVtkProperties Box33
 104
 105 new std:GetVectorDoubleElement Box34
 106   set Box34.I "1"
 107
 108 new creaMiniTools:WriteStatePatientSystem Box35
 109   set Box35.State "Finish"
 110
 111 new std:ConcatStrings Box36
 112   set Box36.In2 "/Step02_InitialParameters.txt"
 113
 114 new std:MagicBox Box37
 115
 116
 117
 118
 119 connect Box06.Out Box08.In
 120
 121 connect Box02.Out Box08.Replace
 122
 123 connect Box01.Out Box09.In1
 124
 125 connect Box09.Out Box07.In
 126
 127
 128 connect Box08.Out Box11.In
 129
 130 connect Box10.Out Box11.Replace
 131
 132 connect Box11.Out Box09.In3
 133
 134 connect Box09.Out Box12.In1
 135
 136 connect Box12.Out Box13.In
 137
 138 connect Box14.Widget Box15.Widget2
 139
 140 connect Box04.Widget Box15.Widget1
 141
 142 connect Box16.Out Box17.Lower
 143
 144 connect Box17.Out Box18.In
 145
 146 connect Box14.wxVtkBaseView2 Box18.WxVtkBaseView
 147
 148 connect Box14.wxVtkBaseView3 Box18.WxVtkBaseView1
 149
 150 connect Box14.wxVtkBaseView4 Box18.WxVtkBaseView2
 151
 152 connect Box16.BoxChange Box18.BoxExecute
 153
 154 connect Box19.Widget Box04.Widget9
 155
 156 connect Box19.BoxChange Box20.BoxExecute
 157
 158 connect Box07.Widget Box04.Widget2
 159
 160 connect Box18.Widget Box04.Widget4
 161
 162 connect Box16.Widget Box04.Widget6
 163
 164 connect Box23.Out Box24.FileName
 165
 166 connect Box16.Out Box25.In2
 167
 168 connect Box25.Out Box24.In0
 169
 170 connect Box24.BoxChange Box20.In2
 171
 172 connect Box23.Out Box26.FileName
 173
 174 connect Box26.lstData2 Box27.In
 175
 176 connect Box27.Out Box16.In
 177
 178 connect Box09.Out Box29.In
 179
 180 connect Box29.Out Box23.In1
 181
 182 connect Box29.Out Box30.In2
 183
 184 connect Box30.Out Box31.In
 185
 186 connect Box31.BoxChange Box20.In1
 187
 188 connect Box22.BoxChange Box20.In9
 189
 190 connect Box32.Out Box17.In
 191
 192 connect Box32.Out Box14.In
 193
 194 connect Box13.Out Box32.In
 195
 196 connect Box32.Out Box33.In
 197
 198 connect Box33.MinMax Box34.In
 199
 200 connect Box34.Out Box16.Max
 201
 202 connect Box35.boxChange Box20.In4
 203
 204 connect Box29.Out Box36.In1
 205
 206
 207 connect Box37.Out Box35.User
 208
 209 connect Box36.Out Box35.Filename
 210
 211
 212
 213 # Complex input ports
 214 input BaseDir Box01.In1 " "
 215 input PatientID Box02.In1 " "
 216 input CoreID Box10.In1 " "
 217 input creaUser Box37.In " "
 218 exec Box05
 219 exec Box15