appli/template_creaPatientsSystem/scripts/00600_PushData.bbs

   1 # ----------------------------------
   2 # - BBTKGEditor v 1.4 BBS BlackBox Script
   3 # - /Users/davila/Creatis/C11/creatools_source/creaMiniTools/appli/template_creaPatientsSystem/scripts/00600_PushData.bbs
   4 # ----------------------------------
   5
   6 # BBTK GEditor Script
   7 # ----------------------
   8
   9 include std
  10 include itkvtk
  11 include wx
  12 include creaVtk
  13 include std
  14 include creaMiniTools
  15
  16 author "Author ??"
  17 description "Description ??"
  18 category "<VOID>"
  19
  20 new wx:CommandButton Box01
  21   set Box01.Label "7. Push and Exit"
  22
  23 new wx:OutputText Box03
  24   set Box03.Title "Core"
  25
  26 new creaVtk:OutputWindow Box05
  27
  28 new wx:LayoutCenter Box06
  29   set Box06.WinTitle "With Proxy"
  30
  31 new wx:LayoutLine Box07
  32   set Box07.WinDialog "true"
  33   set Box07.WinHeight "500"
  34   set Box07.WinTitle "00600_PushData.bbs"
  35   set Box07.WinWidth "800"
  36
  37 new std:ExecSystemCommand Box08
  38
  39 new std:Exit Box09
  40
  41 new std:MagicBox Box11
  42
  43 new wx:LayoutLine Box12
  44
  45 new wx:InputText Box13
  46   set Box13.Title "Proxy User"
  47
  48 new wx:InputTextPassword Box14
  49   set Box14.Title "Proxy Passwword"
  50
  51 new wx:LayoutTab Box15
  52
  53 new wx:CommandButton Box17
  54   set Box17.Label "7. Push and Exit"
  55
  56 new wx:OutputText Box18
  57
  58 new wx:LayoutCenter Box19
  59
  60 new wx:LayoutLine Box26
  61   set Box26.WinTitle "No Proxy"
  62
  63 new std:ConcatStrings Box27
  64   set Box27.In1 " set https_proxy=https://"
  65   set Box27.In3 ":"
  66   set Box27.In5 "@proxy2-hcl.chu-lyon.fr:80"
  67   set Box27.In6 "&&  "
  68
  69 new std:ConcatStrings Box30
  70   set Box30.In1 "export  GIRDER_API_KEY=DJn22j9xJUMjcHeWLanPXRrHTqRpXd20UXtKaB9S  &&  "
  71   set Box30.In5 "  girder-client  "
  72   set Box30.In7 "--api-url https://myriad.creatis.insa-lyon.fr:443/api/v1  "
  73
  74 new std:ConcatStrings Box32
  75   set Box32.In1 " upload "
  76   set Box32.In2 "XXXXX"
  77   set Box32.In3 "   "
  78   set Box32.In5 "   --reuse  "
  79
  80 new std:MagicBox Box35
  81
  82 new std:ReplaceString Box36
  83   set Box36.Replace "6187823d34933039d3c8edba"
  84   set Box36.Search "Study_B"
  85
  86 new std:ReplaceString Box37
  87   set Box37.Replace "618e3d0b34933039d3c8ee34"
  88   set Box37.Search "Study_A"
  89
  90 new std:ReplaceString Box39
  91   set Box39.Replace "6187824a34933039d3c8edbb"
  92   set Box39.Search "Study_C"
  93
  94 new std:MagicBox Box40
  95
  96 new std:ReplaceString Box45
  97   set Box45.Replace " "
  98   set Box45.Search "/"
  99
 100 new std:ReplaceString Box46
 101   set Box46.Replace " "
 102   set Box46.Search "\"
 103
 104 new std:ConcatStrings Box48
 105   set Box48.In2 "/Step06_PushDB.txt"
 106
 107 new std:ConcatStrings Box53
 108   set Box53.In1 "/<CORE>/davila/<ALGO>/Test_01/<PATIENT>/Condition_01"
 109
 110 new std:ReplaceString Box54
 111   set Box54.Search "<CORE>"
 112
 113 new std:ReplaceString Box55
 114   set Box55.Search "<PATIENT>"
 115
 116 new std:ConcatStrings Box56
 117   set Box56.In2 "/results/"
 118
 119 new wx:OutputText Box58
 120   set Box58.Title "Patient"
 121
 122 new wx:OutputText Box59
 123   set Box59.Title "Core"
 124
 125 new wx:OutputText Box60
 126   set Box60.Title "Patient"
 127
 128 new std:ReplaceString Box61
 129   set Box61.Search "/"
 130
 131 new std:ReplaceString Box62
 132   set Box62.Search "/"
 133
 134 new std:MultipleInputs Box63
 135
 136 new std:ConcatStrings Box67
 137   set Box67.In2 "/.tmp/"
 138
 139 new std:ExecSystemCommand Box69
 140
 141 new std:Configuration Box74
 142
 143 new std:StringSelect Box76
 144   set Box76.In0 "  "
 145
 146 new std:MultipleInputs Box77
 147
 148 new std:ReplaceString Box78
 149   set Box78.Replace "00300_Filter"
 150   set Box78.Search "<ALGO>"
 151
 152 new std:ReplaceString Box79
 153   set Box79.Replace "00100_OriginalImages"
 154   set Box79.Search "<ALGO>"
 155
 156 new std:ReplaceString Box80
 157   set Box80.Replace "00200_InitialParameters"
 158   set Box80.Search "<ALGO>"
 159
 160 new std:ConcatStrings Box91
 161   set Box91.In2 "/results/"
 162
 163 new std:ConcatStrings Box92
 164   set Box92.In2 "/results/"
 165
 166 new std:ConcatStrings Box93
 167   set Box93.In3 "/*"
 168
 169 new std:StringSelect Box94
 170   set Box94.In0 "rm -rf "
 171   set Box94.In1 "del "
 172   set Box94.In2 "rm -rf "
 173
 174 new std:ConcatStrings Box95
 175   set Box95.In2 "  "
 176
 177 new std:ExecSystemCommand Box97
 178
 179 new std:StringSelect Box98
 180   set Box98.In0 "source 00610_CreateTmp.sh"
 181   set Box98.In1 "00610_CreateTmp.bat"
 182   set Box98.In2 "source 00610_CreateTmp.sh"
 183
 184 new std:ConcatStrings Box99
 185   set Box99.In2 "  "
 186   set Box99.In4 "  "
 187   set Box99.In6 "  "
 188
 189 new std:ConcatStrings Box88
 190
 191 new creaMiniTools:WriteStatePatientSystem Box89
 192   set Box89.State "Finish"
 193
 194
 195 connect Box12.Widget Box06.Widget2
 196
 197 connect Box15.Widget Box07.Widget1
 198
 199 connect Box18.Widget Box26.Widget1
 200
 201 connect Box14.Out Box27.In4
 202
 203 connect Box13.Out Box27.In2
 204
 205 connect Box30.Out Box08.In
 206
 207 connect Box32.Out Box30.In8
 208
 209 connect Box37.Out Box36.In
 210
 211 connect Box36.Out Box39.In
 212
 213 connect Box46.Out Box45.In
 214
 215 connect Box45.Out Box37.In
 216
 217 connect Box40.Out Box46.In
 218
 219
 220
 221
 222 connect Box40.Out Box54.Replace
 223
 224 connect Box53.Out Box54.In
 225
 226 connect Box54.Out Box55.In
 227
 228 connect Box11.Out Box56.In1
 229
 230 connect Box01.Widget Box12.Widget8
 231
 232 connect Box14.Widget Box12.Widget6
 233
 234 connect Box13.Widget Box12.Widget4
 235
 236 connect Box03.Widget Box12.Widget1
 237
 238 connect Box58.Widget Box12.Widget2
 239
 240 connect Box19.Widget Box26.Widget8
 241
 242 connect Box60.Widget Box26.Widget5
 243
 244 connect Box59.Widget Box26.Widget3
 245
 246 connect Box40.Out Box61.In
 247
 248 connect Box61.Out Box03.In
 249
 250 connect Box61.Out Box59.In
 251
 252 connect Box35.Out Box62.In
 253
 254 connect Box62.Out Box60.In
 255
 256 connect Box62.Out Box58.In
 257
 258 connect Box39.Out Box32.In2
 259
 260 connect Box08.BoxChange Box63.In3
 261
 262 connect Box09.BoxChange Box63.In9
 263
 264 connect Box11.Out Box67.In1
 265
 266 connect Box17.Widget Box19.Widget2
 267
 268 connect Box69.BoxChange Box63.In8
 269
 270 connect Box35.Out Box55.Replace
 271
 272 connect Box15.Selection Box76.In
 273
 274 connect Box27.Out Box76.In1
 275
 276 connect Box76.Out Box30.In2
 277
 278 connect Box26.Widget Box15.Widget1
 279
 280 connect Box06.Widget Box15.Widget2
 281
 282 connect Box01.BoxChange Box77.In1
 283
 284 connect Box17.BoxChange Box77.In2
 285
 286 connect Box77.BoxChange Box63.BoxExecute
 287
 288 connect Box55.Out Box78.In
 289
 290 connect Box55.Out Box79.In
 291
 292 connect Box55.Out Box80.In
 293
 294 connect Box78.Out Box56.In3
 295
 296 connect Box56.Out Box48.In1
 297
 298 connect Box56.Out Box18.In
 299
 300 connect Box11.Out Box92.In1
 301
 302 connect Box11.Out Box91.In1
 303
 304 connect Box79.Out Box92.In3
 305
 306 connect Box80.Out Box91.In3
 307
 308 connect Box93.Out Box32.In4
 309
 310 connect Box67.Out Box93.In1
 311
 312 connect Box40.Out Box93.In2
 313
 314 connect Box74.SystemType Box94.In
 315
 316 connect Box94.Out Box95.In1
 317
 318 connect Box67.Out Box95.In3
 319
 320 connect Box40.Out Box95.In4
 321
 322 connect Box95.Out Box69.In
 323
 324 connect Box97.BoxChange Box63.In2
 325
 326 connect Box74.SystemType Box98.In
 327
 328 connect Box98.Out Box99.In1
 329
 330 connect Box11.Out Box99.In3
 331
 332 connect Box40.Out Box99.In5
 333
 334 connect Box35.Out Box99.In7
 335
 336 connect Box99.Out Box97.In
 337
 338
 339 connect Box88.Out Box89.User
 340
 341 connect Box48.Out Box89.Filename
 342
 343 connect Box89.boxChange Box63.In4
 344
 345
 346
 347 # Complex input ports
 348 input BaseDir Box11.In " "
 349 input CoreID Box40.In " "
 350 input PatientID Box35.In " "
 351 input creaUser Box88.In1 " "
 352 exec Box05
 353 exec Box07