bbtk/bbs/appli/exampleGaussianSmooth.bbs

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Sant�)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 # Previous Authors : Laurent Guigues, Jean-Pierre Roux
   7 # CreaTools website : www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/creatools_accueil
   8 #
   9 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
  10 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  11 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  12 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  13 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  14 #  or in the file LICENSE.txt.
  15 #
  16 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  17 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  18 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  19 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  20 #  liability.
  21 #
  22 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  23 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  24 # ------------------------------------------------------------------------ */
  25
  26 description "creaMaracasVisu::ImageGaussianSmooth box example. "
  27 category "example"
  28 author "eduardo.davila@creatis.insa-lyon.fr"
  29
  30 include std
  31 include vtk
  32 include wx
  33 include itk
  34 include itkvtk
  35 include wxvtk
  36
  37 new MetaImageReader reader
  38 include  std/boxes/bbPrependPackageDataPath.bbs
  39 new PrependPackageDataPath prependDatapath
  40   set prependDatapath.In "vtk/hola.mhd"
  41   connect prependDatapath.Out reader.In
  42
  43 #---------------------------------------------------------------------
  44
  45 new Slider slider
  46
  47 #---------------------------------------------------------------------
  48
  49 new Viewer2D viewer2DImageOriginal
  50   connect reader.Out                    viewer2DImageOriginal.In
  51   connect slider.Out                    viewer2DImageOriginal.Slice
  52   connect slider.BoxChange      viewer2DImageOriginal.BoxExecute
  53
  54 #---------------------------------------------------------------------
  55
  56 new BinaryThresholdImageFilter threshold
  57   set threshold.LowerThreshold 2000
  58   set threshold.UpperThreshold 5000
  59   set threshold.InsideValue 255
  60   set threshold.OutsideValue 0
  61   connect reader.Out threshold.In
  62
  63 new Viewer2D viewer2DImageSegmented
  64   connect threshold.Out         viewer2DImageSegmented.In
  65   connect slider.Out                    viewer2DImageSegmented.Slice
  66   connect slider.BoxChange      viewer2DImageSegmented.BoxExecute
  67
  68 #---------------------------------------------------------------------
  69
  70 new ImageGaussianSmooth smooth
  71   connect threshold.Out smooth.In
  72   set smooth.StdDevX  1
  73   set smooth.StdDevY  1
  74   set smooth.StdDevZ  1
  75
  76 new Viewer2D viewer2DImageSmooth
  77   connect smooth.Out            viewer2DImageSmooth.In
  78   connect slider.Out                    viewer2DImageSmooth.Slice
  79   connect slider.BoxChange      viewer2DImageSmooth.BoxExecute
  80
  81 #---------------------------------------------------------------------
  82
  83 new LayoutLine upLayout
  84   set upLayout.Orientation H
  85   connect viewer2DImageOriginal.Widget                  upLayout.Widget1
  86   connect viewer2DImageSegmented.Widget         upLayout.Widget2
  87   connect viewer2DImageSmooth.Widget            upLayout.Widget3
  88
  89
  90 #---------------------------------------------------------------------
  91
  92 new Viewer3D  viewernvImagethreshold3D
  93 #  set viewernvImagethreshold3D.nTypeView "5"
  94
  95 new IsoSurfaceExtractor  isoextractorthreshold
  96   connect threshold.Out isoextractorthreshold.In
  97   set isoextractorthreshold.Opacity 1
  98   set isoextractorthreshold.Isovalue 128
  99   connect viewernvImagethreshold3D.Renderer             isoextractorthreshold.Renderer
 100
 101
 102 #---------------------------------------------------------------------
 103 new Viewer3D  viewernvImageSmooth3D
 104 #  set viewernvImageSmooth3D.nTypeView "5"
 105
 106 new IsoSurfaceExtractor  isoextractorsmooth
 107   connect smooth.Out isoextractorsmooth.In
 108   set isoextractorsmooth.Opacity 1
 109   set isoextractorsmooth.Isovalue 128
 110   connect viewernvImageSmooth3D.Renderer                isoextractorsmooth.Renderer
 111
 112
 113 #---------------------------------------------------------------------
 114
 115 new LayoutLine downLayout
 116  set downLayout.Orientation H
 117   connect viewernvImagethreshold3D.Widget               downLayout.Widget1
 118   connect viewernvImageSmooth3D.Widget          downLayout.Widget2
 119
 120 #---------------------------------------------------------------------
 121 new LayoutSplit splitUp
 122   connect slider.Widget         splitUp.Widget1
 123   connect upLayout.Widget               splitUp.Widget2
 124
 125 new LayoutSplit mainSplit
 126   connect splitUp.Widget                mainSplit.Widget1
 127   connect downLayout.Widget     mainSplit.Widget2
 128
 129 #---------------------------------------------------------------------
 130
 131 exec isoextractorthreshold
 132 exec isoextractorsmooth
 133 exec mainSplit