bbtk/src/bbcreaMaracasVisuContourExtractDataBox.cxx

   1 //=====
   2 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
   3 //=====
   4 #include "bbcreaMaracasVisuContourExtractDataBox.h"
   5 #include "bbcreaMaracasVisuPackage.h"
   6
   7 #include "ContourExtractData.h"
   8
   9
  10
  11
  12 namespace bbcreaMaracasVisu
  13 {
  14
  15 BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(creaMaracasVisu,ContourExtractDataBox)
  16 BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(ContourExtractDataBox,bbtk::AtomicBlackBox);
  17 //=====
  18 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
  19 //=====
  20 void ContourExtractDataBox::Process()
  21 {
  22
  23 // THE MAIN PROCESSING METHOD BODY
  24 //   Here we simply set the input 'In' value to the output 'Out'
  25 //   And print out the output value
  26 // INPUT/OUTPUT ACCESSORS ARE OF THE FORM :
  27 //    void bbSet{Input|Output}NAME(const TYPE&)
  28 //    const TYPE& bbGet{Input|Output}NAME() const
  29 //    Where :
  30 //    * NAME is the name of the input/output
  31 //      (the one provided in the attribute 'name' of the tag 'input')
  32 //    * TYPE is the C++ type of the input/output
  33 //      (the one provided in the attribute 'type' of the tag 'input')
  34     //    bbSetOutputOut( bbGetInputIn() );
  35     //    std::cout << "Output value = " <<bbGetOutputOut() << std::endl;
  36
  37         ContourExtractData *contourextractdata = new ContourExtractData(true);
  38         contourextractdata->SetImage( bbGetInputReferenceImage() );
  39         if (bbGetInputRange().size()==2)
  40         {
  41             contourextractdata->SetScalarRange( bbGetInputRange()[0] , bbGetInputRange()[1] );
  42         } // if Range
  43
  44      //   _contourextractdata ->SetTypeOperation( typeContourGroup % 3 );
  45         contourextractdata->InitVolumeStatistics();
  46         std::vector<manualBaseModel*> lstManConMod;
  47         lstManConMod.push_back( bbGetInputManualBaseModel() );
  48         contourextractdata->SetLstManualContourModel( lstManConMod );
  49
  50         contourextractdata->ResetImageResult( bbGetInputZ() );
  51     //    for ( z=minZ ; z<=maxZ ; z++ )
  52     //    {
  53             contourextractdata->SetZtoBeAnalys( bbGetInputZ() );
  54             contourextractdata->CalculateImageResult();
  55     //    } // for
  56
  57
  58         std::vector<double> LstValue;
  59         std::vector<double> LstValuePosX;
  60         std::vector<double> LstValuePosY;
  61         std::vector<double> LstValuePosZ;
  62         int numberOfPixels=0;
  63         LstValue.clear();
  64         LstValuePosX.clear();
  65         LstValuePosY.clear();
  66         LstValuePosZ.clear();
  67
  68         contourextractdata->GetValuesInsideCrown(  &numberOfPixels,
  69                                                     &LstValue,
  70                                                     &LstValuePosX,
  71                                                     &LstValuePosY,
  72                                                     &LstValuePosZ);
  73
  74     //    int grayRangeMin;
  75     //    int grayRangeMax;
  76
  77         int        resultSize;
  78         int        resultGrayRangeCount;
  79         double    resultMin;
  80         double    resultMax;
  81         double    resultAverage;
  82         double    resultStandarDeviation;
  83
  84     //    resultSize=numberOfPixels;
  85
  86     if (bbGetInputRange().size()==2)
  87     {
  88         // Statistics of each slice.
  89         contourextractdata->Statistics( &LstValue,
  90                                        bbGetInputRange()[0],
  91                                        bbGetInputRange()[1],
  92                                        &resultGrayRangeCount,
  93                                        &resultSize,
  94                                        &resultMin,
  95                                        &resultMax,
  96                                        &resultAverage,
  97                                        &resultStandarDeviation);
  98         bbSetOutputResultGrayRangeCount( (double)resultGrayRangeCount );
  99         bbSetOutputResultSize( (double)resultSize );
 100         bbSetOutputResultMin( resultMin );
 101         bbSetOutputResultMax( resultMax );
 102         bbSetOutputResultAverage( resultAverage );
 103         bbSetOutputResultStandarDeviation( resultStandarDeviation );
 104     } // if Range
 105
 106     vtkImageData *imageValues   = contourextractdata->GetVtkImageValueResult();
 107     vtkImageData *imageMask     = contourextractdata->GetVtkImageMaskResult();
 108     bbSetOutputValues( imageValues );
 109     bbSetOutputMask( imageMask );
 110     bbSetOutputNumberOfPixels( (double)numberOfPixels );
 111     bbSetOutputLstValue( LstValue );
 112     bbSetOutputLstValuePosX( LstValuePosX );
 113     bbSetOutputLstValuePosX( LstValuePosY );
 114     bbSetOutputLstValuePosX( LstValuePosZ );
 115
 116     //    int        vol_rCountRange;
 117     //    int        vol_rsize;
 118     //    double    vol_minValue;
 119     //    double    vol_maxValue;
 120     //    double    vol_average;
 121     //    double    vol_standardeviation;
 122
 123     //        _contourextractdata->GetVolumeStatistics(&vol_rCountRange, &vol_rsize,
 124     //                                                 &vol_minValue, &vol_maxValue,
 125     //                                                 &vol_average, &vol_standardeviation);
 126 }
 127
 128 //=====
 129 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 130 //=====
 131 void ContourExtractDataBox::bbUserSetDefaultValues()
 132 {
 133 //  SET HERE THE DEFAULT INPUT/OUTPUT VALUES OF YOUR BOX
 134 //    Here we initialize the input 'In' to 0
 135     bbSetInputManualBaseModel(NULL);
 136     bbSetInputReferenceImage(NULL);
 137     bbSetInputZ(0);
 138     std::vector<double> rangeMinMax;
 139     rangeMinMax.push_back(-10000);
 140     rangeMinMax.push_back(10000);
 141     bbSetInputRange(rangeMinMax);
 142     bbSetOutputMask(NULL);
 143     bbSetOutputValues(NULL);
 144
 145     bbSetOutputResultGrayRangeCount( -1 );
 146     bbSetOutputResultSize( -1 );
 147     bbSetOutputResultMin( -1 );
 148     bbSetOutputResultMax( -1 );
 149     bbSetOutputResultAverage( -1 );
 150     bbSetOutputResultStandarDeviation( -1 );
 151
 152 }
 153
 154 //=====
 155 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 156 //=====
 157 void ContourExtractDataBox::bbUserInitializeProcessing()
 158 {
 159 //  THE INITIALIZATION METHOD BODY :
 160 //    Here does nothing
 161 //    but this is where you should allocate the internal/output pointers
 162 //    if any
 163 }
 164
 165 //=====
 166 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 167 //=====
 168 void ContourExtractDataBox::bbUserFinalizeProcessing()
 169 {
 170 //  THE FINALIZATION METHOD BODY :
 171 //    Here does nothing
 172 //    but this is where you should desallocate the internal/output pointers
 173 //    if any
 174 }
 175
 176 }// EO namespace bbcreaMaracasVisu
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 178