bbtk_creaVtk_PKG/src/bbcreaVtkMeshDeformation.cxx

   1 //=====
   2 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
   3 //=====
   4 #include "bbcreaVtkMeshDeformation.h"
   5 #include "bbcreaVtkPackage.h"
   6 namespace bbcreaVtk
   7 {
   8
   9 BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(creaVtk,MeshDeformation)
  10 BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(MeshDeformation,bbtk::AtomicBlackBox);
  11 //=====
  12 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
  13 //=====
  14 void MeshDeformation::Process()
  15 {
  16
  17 // THE MAIN PROCESSING METHOD BODY
  18 //   Here we simply set the input 'In' value to the output 'Out'
  19 //   And print out the output value
  20 // INPUT/OUTPUT ACCESSORS ARE OF THE FORM :
  21 //    void bbSet{Input|Output}NAME(const TYPE&)
  22 //    const TYPE& bbGet{Input|Output}NAME() const
  23 //    Where :
  24 //    * NAME is the name of the input/output
  25 //      (the one provided in the attribute 'name' of the tag 'input')
  26 //    * TYPE is the C++ type of the input/output
  27 //      (the one provided in the attribute 'type' of the tag 'input')
  28 //    bbSetOutputOut( bbGetInputIn() );
  29 //    std::cout << "Output value = " <<bbGetOutputOut() << std::endl;
  30
  31     double s = bbGetInputS();
  32     bool ok=true;
  33     if (bbGetInputDirection().size()==3)
  34     {
  35         ok = !( (bbGetInputDirection()[0]==0) && (bbGetInputDirection()[1]==0) && (bbGetInputDirection()[2]==0) );
  36     }
  37     if ( (bbGetInputIn()!=NULL) && (ok==true))
  38     {
  39         vtkPoints* points=bbGetInputIn()->GetPoints();
  40         long    i,size=points->GetNumberOfPoints();
  41         double  p[3];  // point
  42         double  pb[3]; // point base
  43         double  np[3]; // new point
  44         double  sx,sy,sz;
  45         sx = s*2;
  46         sy = sx;
  47         sz = sy;
  48
  49         points->GetPoint( bbGetInputEdgeId() , pb );
  50
  51         if (EdgeIdBack!=bbGetInputEdgeId() )
  52         {
  53             voiIdPoints.clear();
  54             EdgeIdBack = bbGetInputEdgeId();
  55             for ( i=0 ; i<size ; i++)
  56             {
  57                 points->GetPoint(i,p);
  58
  59                 if ( (p[0]>(pb[0]-sx)) && (p[0]<(pb[0]+sx)) &&
  60                      (p[1]>(pb[1]-sy)) && (p[1]<(pb[1]+sy)) &&
  61                      (p[2]>(pb[2]-sz)) && (p[2]<(pb[2]+sz)) )
  62                 {
  63                     voiIdPoints.push_back( i );
  64                 } // if
  65             } // for i
  66         } // back
  67         double displcement_x = 0;
  68         double displcement_y = 0;
  69         double displcement_z = 0;
  70         if (bbGetInputDirection().size()==3)
  71         {
  72             displcement_x = bbGetInputDirection()[0];
  73             displcement_y = bbGetInputDirection()[1];
  74             displcement_z = bbGetInputDirection()[2];
  75         }
  76         size=voiIdPoints.size();
  77         for (i=0;i<size;i++)
  78         {
  79             points->GetPoint( voiIdPoints[i] , p );
  80             double x = p[0] - pb[0]; //distance between a point and seed point
  81             double y = p[1] - pb[1];
  82             double z = p[2] - pb[2];
  83             double distance = std::sqrt(std::pow(x, 2) + std::pow(y, 2) + std::pow(z, 2));
  84
  85 //        https://en.wikipedia.org/wiki/Generalized_normal_distribution
  86 // with Gama function
  87
  88             double weight = exp(-distance * 1. / s);
  89             if (weight > 0.0001)
  90             {
  91                 np[0] = p[0] + weight*displcement_x;
  92                 np[1] = p[1] + weight*displcement_y;
  93                 np[2] = p[2] + weight*displcement_z;
  94                 points->SetPoint( voiIdPoints[i] , np );
  95             } // if
  96         } // for
  97         points->Modified();
  98         bbGetInputIn()->Modified();
  99     } // In != NULL
 100 }
 101 //=====
 102 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 103 //=====
 104 void MeshDeformation::bbUserSetDefaultValues()
 105 {
 106
 107 //  SET HERE THE DEFAULT INPUT/OUTPUT VALUES OF YOUR BOX
 108 //    Here we initialize the input 'In' to 0
 109    bbSetInputIn(NULL);
 110     std::vector<double> direction;
 111     direction.push_back(1);
 112     direction.push_back(0);
 113     direction.push_back(0);
 114     bbSetInputDirection(direction);
 115     EdgeIdBack=-1;
 116     bbSetInputEdgeId(EdgeIdBack);
 117     bbSetInputS(10);
 118 }
 119 //=====
 120 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 121 //=====
 122 void MeshDeformation::bbUserInitializeProcessing()
 123 {
 124
 125 //  THE INITIALIZATION METHOD BODY :
 126 //    Here does nothing
 127 //    but this is where you should allocate the internal/output pointers
 128 //    if any
 129
 130
 131 }
 132 //=====
 133 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 134 //=====
 135 void MeshDeformation::bbUserFinalizeProcessing()
 136 {
 137
 138 //  THE FINALIZATION METHOD BODY :
 139 //    Here does nothing
 140 //    but this is where you should desallocate the internal/output pointers
 141 //    if any
 142
 143 }
 144 }
 145 // EO namespace bbcreaVtk
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