bbtk_creaVtk_PKG/src/bbcreaVtkNIFTIImageReader.cxx

   1 //=====
   2 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
   3 //=====
   4 #include "bbcreaVtkNIFTIImageReader.h"
   5 #include "bbcreaVtkPackage.h"
   6
   7 #include <vtkNIFTIImageReader.h>
   8 #include <vtkStringArray.h>
   9
  10 namespace bbcreaVtk
  11 {
  12
  13 BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(creaVtk,NIFTIImageReader)
  14 BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(NIFTIImageReader,bbtk::AtomicBlackBox);
  15 //=====
  16 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
  17 //=====
  18 void NIFTIImageReader::Process()
  19 {
  20
  21 // THE MAIN PROCESSING METHOD BODY
  22 //   Here we simply set the input 'In' value to the output 'Out'
  23 //   And print out the output value
  24 // INPUT/OUTPUT ACCESSORS ARE OF THE FORM :
  25 //    void bbSet{Input|Output}NAME(const TYPE&)
  26 //    const TYPE& bbGet{Input|Output}NAME() const
  27 //    Where :
  28 //    * NAME is the name of the input/output
  29 //      (the one provided in the attribute 'name' of the tag 'input')
  30 //    * TYPE is the C++ type of the input/output
  31 //      (the one provided in the attribute 'type' of the tag 'input')
  32 //    bbSetOutputOut( bbGetInputIn() );
  33 //    std::cout << "Output value = " <<bbGetOutputOut() << std::endl;
  34
  35
  36         std::vector<vtkImageData*> lstImages;
  37
  38         if (bbGetInputType()==0)
  39         {
  40                 vtkNIFTIImageReader* reader=vtkNIFTIImageReader::New();
  41                 if ( bbGetInputFileNames().size()==1)
  42                 {
  43                         reader->SetFileName( bbGetInputFileNames()[0].c_str() );
  44                         reader->Update();
  45                 } else          {
  46                         vtkStringArray *lstFileNames=vtkStringArray::New();
  47                         int i,size=bbGetInputFileNames().size();
  48                         for (i=0;i<size;i++)
  49                         {
  50 printf("EED Warnning, somethin is not working ????   NIFTIImageReader::Process()    %s\n ", bbGetInputFileNames()[i].c_str()  );
  51                                 lstFileNames->InsertNextValue( bbGetInputFileNames()[i].c_str() );
  52                         } // for i
  53                         reader->SetFileNames( lstFileNames );
  54                         reader->Update();
  55                 } // FileNames
  56                 lstImages.push_back( reader->GetOutput() );
  57         } // Type 0
  58
  59         if (bbGetInputType()==1)
  60         {
  61                 int i,size=bbGetInputFileNames().size();
  62                 for (i=0;i<size;i++)
  63                 {
  64                         vtkNIFTIImageReader* reader=vtkNIFTIImageReader::New();
  65                         reader->SetFileName( bbGetInputFileNames()[i].c_str() );
  66                         reader->Update();
  67                         lstImages.push_back( reader->GetOutput() );
  68                 } // for i
  69         } // Type 1
  70
  71
  72         if (lstImages.size()>=1) { bbSetOutputOut( lstImages[0] ); } else {bbSetOutputOut( NULL ); }
  73         bbSetOutputOutVector( lstImages );
  74 }
  75 //=====
  76 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
  77 //=====
  78 void NIFTIImageReader::bbUserSetDefaultValues()
  79 {
  80
  81 //  SET HERE THE DEFAULT INPUT/OUTPUT VALUES OF YOUR BOX
  82 //    Here we initialize the input 'In' to 0
  83    bbSetInputType(0);
  84
  85 }
  86 //=====
  87 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
  88 //=====
  89 void NIFTIImageReader::bbUserInitializeProcessing()
  90 {
  91
  92 //  THE INITIALIZATION METHOD BODY :
  93 //    Here does nothing
  94 //    but this is where you should allocate the internal/output pointers
  95 //    if any
  96
  97
  98 }
  99 //=====
 100 // Before editing this file, make sure it's a file of your own (i.e.: it wasn't generated from xml description; if so : your modifications will be lost)
 101 //=====
 102 void NIFTIImageReader::bbUserFinalizeProcessing()
 103 {
 104
 105 //  THE FINALIZATION METHOD BODY :
 106 //    Here does nothing
 107 //    but this is where you should desallocate the internal/output pointers
 108 //    if any
 109
 110 }
 111 }
 112 // EO namespace bbcreaVtk
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