checkWriteExplicit.sh

   1 # Check READ
   2 #-----------
   3 #
   4 # We just write XDCM Files and AFFIM them
   5 # to be sure the writting was OK
   6 #
   7 # Sebastien Barre's files have no interest here, since the header is
   8 # a *very clean* ACR-NEMA
   9 # Our pb come from DICOM V3, with SQ, shadow groups, etc.
  10
  11 # --> EVERYWHERE, with XMEDCOM :
  12 # --> warning: Incorrect OB value representation (fixed)
  13 # --> to be fixed in the WRITER ...
  14
  15 #No Swap Info
  16 #------------
  17 testWrite mr176621.dcm x;
  18 PrintHeader mr176621.dcm.XDCM 2;  .
  19 v mr176621.dcm.XDCM; #  OK
  20 xmedcon mr176621.dcm.XDCM; # warning: No transfer syntax found
  21                            # warning: Tag with uneven length
  22                            #
  23                           #breaks because 'DICM" without group 0000
  24                           # Write DCM needs 'CheckFileHeaderConsistency' method
  25
  26 # No Transfert Syntax
  27 #--------------------
  28
  29 #Big Endian
  30
  31 #      -------------------------------------------  BIG SOUCY !!
  32 affimdcm filein=cr172241.dcm zoom=-4;
  33 xmedcon cr172241.dcm;  # OK
  34
  35 testWrite cr172241.dcm r;
  36 affim filein=cr172241.dcm.RAW nbit=16  DIMX=1792 DIMY=2392;
  37 PrintHeader cr172241.dcm 2;  #OK
  38 # But ... :
  39 v cr172241.dcm;              # breaks (white image)   WHITE IMAGE ?!?
  40                              # Doesn't break DaVaW ...
  41 testWrite cr172241.dcm x;
  42 PrintHeader cr172241.dcm.XDCM 2;   #OK
  43 xmedcon cr172241.dcm.XDCM;         # OK Incorrect OB value representation (fixed)
  44 affimdcm filein=cr172241.dcm.XDCM; # OK
  45 v cr172241.dcm.XDCM;               # breaks ?!? White image !
  46
  47
  48 testWrite cr_45031.dcm x;
  49 v cr_45031.dcm.XDCM;          #OK
  50 xmedcon  cr_45031.dcm.XDCM;   #OK
  51
  52 testWrite CR-MONO1-10-chest.dcm x;
  53 PrintHeader CR-MONO1-10-chest.dcm.XDCM 2; #OK
  54 v CR-MONO1-10-chest.dcm.XDCM;             #OK
  55 xmedcon CR-MONO1-10-chest.dcm.XDCM;       #OK Incorrect OB value representation (fixed)
  56
  57 testWrite CT-MONO2-12-lomb-an2.acr2 x;
  58 PrintHeader CT-MONO2-12-lomb-an2.acr2.XDCM 2; # OK
  59 v CT-MONO2-12-lomb-an2.acr2.XDCM; #OK
  60 xmedcon CT-MONO2-12-lomb-an2.acr2.XDCM; #OK Incorrect OB value representation (fixed)
  61
  62 xmedcon gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1; # Original OK
  63 PrintHeader gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1; #OK
  64 testWrite gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1 x;
  65 PrintHeader gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1.XDCM 2;
  66 v  gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1.XDCM;
  67 xmedcon gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1.XDCM; #breaks error: No images found
  68
  69 xmedcon gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2 #original OK
  70 testWrite gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2 x;
  71 PrintHeader  gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2.XDCM 2;
  72 v gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2.XDCM; #OK
  73 xmedcon gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2.XDCM; #breaks
  74                                       # --> TODO fix group length for odd groups
  75 #Feb 03 18:50:24 log[4419]: warning: No transfer syntax found
  76 #Feb 03 18:50:24 log[4419]: warning: Tag with uneven length
  77 #Feb 03 18:50:24 log[4419]: error: No images found
  78
  79 testWrite MR-MONO2-12-an2.acr2 x;
  80 PrintHeader newACR1000.nema.XDCM 2;
  81 v MR-MONO2-12-an2.acr2.XDCM;
  82 xmedcon MR-MONO2-12-an2.acr2.XDCM; # OK warning: Incorrect OB value representation
  83
  84 testWrite newACR1000.nema x;          # == gdcmMR-SIEMENS-16.acr2
  85 PrintHeader newACR1000.nema.XDCM; #OK
  86 v newACR1000.nema.XDCM; #OK
  87 xmedcon newACR1000.nema.XDCM; # breaks : no image found
  88
  89 testWrite oldACR00001.ima x;          # == gdcm-MR-SIEMENS.16.acr1
  90 PrintHeader oldACR00001.ima.XDCM; # OK
  91 v oldACR00001.ima.XDCM; #OK
  92 xmedcon oldACR00001.ima.XDCM; # breaks : no image found
  93
  94 testWrite OT-MONO2-8-a7.dcm x;
  95 v OT-MONO2-8-a7.dcm.XDCM;        #OK
  96 xmedcon OT-MONO2-8-a7.dcm.XDCM ; #OK
  97
  98 #No Samples Per Pixel
  99 #--------------------
 100 testWrite gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm x;
 101 affim filein=gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm;
 102 PrintHeader  gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm.XDCM 2; # OK
 103 v gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm.XDCM;              #OK
 104 xmedcon gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm.XDCM         #OK
 105
 106 #Unnormalized Rectangular LibIDO format image
 107 #--------------------------------------------
 108 testWrite gdcm-ACR-LibIDO.acr x;
 109 v gdcm-ACR-LibIDO.acr.XDCM; # OK
 110 xmedcon gdcm-ACR-LibIDO.acr.XDCM; #inverts x and y (of course)
 111
 112 #Bits Allocated =12, Bits Stored=12
 113 #----------------------------------
 114 #MR Philips (once upon a time in Lyon-Sud)
 115 testWrite MR-MONO2-12-angio-an1.acr1 x;
 116 v MR-MONO2-12-angio-an1.acr1.XDCM;       # shitty image
 117 xmedcon MR-MONO2-12-angio-an1.acr1.XDCM; #  pas mieux : warning: Incorrect PixelData length
 118
 119 #RGB
 120 #---
 121 testWrite US.3405.1.dcm x;
 122 echo "expected  pixelType=8U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=0";
 123 echo "          PhotometricInterpretation=RGB";
 124 v US.3405.1.dcm.XDCM; #OK
 125 xmedcon US.3405.1.dcm.XDCM; #OK
 126
 127 #      -------------------------------------------  KING SIZE SOUCY !!
 128
 129 testWrite OT-PAL-8-face.dcm x;
 130 echo "expected  pixelType=8U SamplesPerPixel=3 PlanarConfiguration=1";
 131 echo "          PhotometricInterpretation=PALETTE COLOR";
 132 PrintHeaderOT-PAL-8-face.dcm.XDCM; OK
 133 affimdcm filein=OT-PAL-8-face.dcm.XDCM; #OK
 134 v OT-PAL-8-face.dcm.XDCM;               #   seg fault .!?
 135 xmedcon OT-PAL-8-face.dcm.XDCM; #OK
 136
 137 testWrite 8BitsUncompressedColor.dcm x;
 138 v 8BitsUncompressedColor.dcm.XDCM;        #   seg fault .!?
 139 xmedcon 8BitsUncompressedColor.dcm.XDCM ; #OK
 140
 141 # Implicit VR - Little Endian
 142 #-----------------------------
 143
 144 testWrite CT-MONO2-16-ankle.dcm x;
 145  xmedcon CT-MONO2-16-ankle.dcm.XDCM; #ok
 146  v CT-MONO2-16-ankle.dcm.XDCM; #ok
 147  PrintHeader  CT-MONO2-16-ankle.dcm 2; #ok
 148
 149 testWrite CT-MONO2-16-ort.dcm x;
 150 v CT-MONO2-16-ort.dcm.XDCM;  #OK
 151 xmedcon CT-MONO2-16-ort.dcm.XDCM;  #OK
 152
 153
 154 testWrite CT-MONO2-8-abdo.dcm x;
 155 v CT-MONO2-8-abdo.dcm.XDCM; #OK
 156 xmedcon CT-MONO2-8-abdo.dcm.XDCM; #OK
 157
 158 testWrite gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm x;
 159 PrintHeader gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm.XDCM 2; #OK
 160 v gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm.XDCM; # OK
 161 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm.XDCM; # error: No images found
 162 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm; # OK with original image
 163
 164 testWrite MR-MONO2-16-head.dcm x;
 165 v MR-MONO2-16-head.dcm.XDCM;  #OK
 166 xmedcon MR-MONO2-16-head.dcm.XDCM;  #OK
 167
 168 testWrite multiframe1Integris.dcm x;
 169 PrintHeader CT-MONO2-8-abdo.dcm.XDCM 2; #OK
 170 v multiframe1Integris.dcm.XDCM; #OK
 171 xmedcon multiframe1Integris.dcm.XDCM; #breaks No images found
 172 xmedcon multiframe1Integris.dcm;
 173
 174 testWrite multiframe2GE.dcm x;
 175 v multiframe2GE.dcm.XDCM; #OK
 176 #breaks xmedcon
 177 xmedcon multiframe2GE.dcm.XDCM; #breaks No images found
 178
 179 v irmPhlipsNew1.dcm;
 180 testWrite irmPhlipsNew1.dcm x; # == gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
 181 v irmPhlipsNew1.dcm.XDCM;     #OK
 182 xmedcon irmPhlipsNew1.dcm.XDCM; #breaks : No images found
 183
 184 #avec imagette (icone)
 185
 186 v icone.dcm;   #OK
 187 PrintHeader icone.dcm 2 | grep fffe;
 188 echo "so many 0xfffe ! (274)"
 189
 190 testWrite icone.dcm x;
 191 xmedcon icone.dcm; #original image OK
 192 PrintHeader icone.dcm.XDCM 2;
 193 #PrintHeader OK; v OK; breaks xmedcom
 194 v icone.dcm.XDCM; #   shitty image        --> TODO : FIX (once again)icon pb
 195 xmedcon icone.dcm.XDCM; #breaks
 196
 197 #Palette
 198
 199 # ???
 200 # 8 Bits  ?
 201 # 16 Bits ?
 202
 203 #Explicit VR - Little Endian
 204 #----------------------------
 205 testWrite CT-MONO2-16-brain.dcm x;
 206 v CT-MONO2-16-brain.dcm.XDCM;       #OK
 207 xmedcon CT-MONO2-16-brain.dcm.XDCM; #OK
 208
 209 PrintHeader gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm 2;
 210 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm #OK :Skip PHILIPS premature item bug
 211 v gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm; #OK
 212 testWrite gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm x;
 213 PrintHeader gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm.XDCM 2; #pixel group missing??!?
 214 #v gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm.XDCM;            #shitty image, ofcourse
 215 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm.XDCM;       #  works ?!?
 216 v gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm.XDCM;
 217
 218
 219 testWrite gdcm-MR-PHILIPS-16-NonRectPix.dcm x;
 220 v gdcm-MR-PHILIPS-16-NonRectPix.dcm.XDCM; #OK
 221 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16-NonRectPix.dcm.XDCM; #OK warning: Incorrect sequence length
 222
 223 testWrite MR-MONO2-8-16x-heart.dcm x;  #multiframe # equals to ???
 224 v MR-MONO2-8-16x-heart.dcm.XDCM;       #OK
 225 xmedcon MR-MONO2-8-16x-heart.dcm.XDCM; #OK
 226
 227 testWrite NM-MONO2-16-13x-heart.dcm x;  #multiframe
 228 v NM-MONO2-16-13x-heart.dcm.XDCM;       #OK
 229 xmedcon NM-MONO2-16-13x-heart.dcm.XDCM; #OK
 230
 231 testWrite sonataMonaco.dcm x;
 232 v sonataMonaco.dcm.XDCM;       #OK
 233 xmedcon sonataMonaco.dcm.XDCM; #OK
 234
 235 #MultiFrame
 236 testWrite US-MONO2-8-8x-execho.dcm x;
 237 PrintHeader US-MONO2-8-8x-execho.dcm.XDCM;
 238 v US-MONO2-8-8x-execho.dcm.XDCM;       # OK
 239 xmedcon US-MONO2-8-8x-execho.dcm.XDCM; #OK
 240
 241 #RGB
 242
 243 testWrite US-RGB-8-epicard.dcm x;
 244 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=3 PlanarConfiguration=1";
 245 echo "         PhotometricInterpretation=RGB";
 246 v US-RGB-8-epicard.dcm.XDCM; #OK
 247 xmedcon US-RGB-8-epicard.dcm.XDCM; #OK
 248
 249 testWrite US-RGB-8-esopecho.dcm x;
 250 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=3 PlanarConfiguration=0";
 251 echo "         PhotometricInterpretation=RGB",
 252 xmedcon US-RGB-8-esopecho.dcm.XDCM; #OK
 253
 254 # Non-Hierarchical, First-Order Prediction (Process 14 [Selection Value 1])
 255 #--------------------------------------------------------------------------
 256 # (JPEG Lossless)
 257
 258 testWrite CT-MONO2-16-chest.dcm x;
 259 v CT-MONO2-16-chest.dcm.XDCM; #OK
 260 xmedcon CT-MONO2-16-chest.dcm.XDCM; #OK
 261
 262 testWrite 012345.002.050.dcm x;
 263 v 012345.002.050.dcm.XDCM; #OK
 264 xmedcon 012345.002.050.dcm.XDCM; #OK
 265
 266 testWrite gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm x;
 267 v gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm.XDCM ; #OK
 268 xmedcon gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm.XDCM;  #OK
 269
 270 testWrite XA-MONO2-8-12x-catheter.dcm x;
 271 v XA-MONO2-8-12x-catheter.dcm.XDCM; #OK
 272 PrintHeader XA-MONO2-8-12x-catheter.dcm.XDCM 2;
 273 xmedcon XA-MONO2-8-12x-catheter.dcm.XDCM; #OK
 274
 275 testWrite xa_integris.dcm x;
 276 echo "a lot of fragments expected here";
 277 v xa_integris.dcm.XDCM #OK
 278 xmedcon xa_integris.dcm.XDCM #OK
 279
 280 testWrite 16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm x;
 281 v 16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.XDCM #OK
 282 xmedcon 16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.XDCM #OK
 283
 284 #comming from GE dlx via VTServer
 285 v I9000001.dcm;
 286 testWrite I9000001.dcm x;
 287 PrintHeader I9000001.dcm.XDCM 2; # pixel group NOT FOUND ??!??
 288 #black image
 289 v I9000001.dcm.XDCM;
 290 #no image found
 291 xmedcon I9000001.dcm.XDCM;
 292
 293 #JPEG Extended (Process 2 & 4) // 16 bits
 294 #-----------------------------
 295 testWrite gdcm-JPEG-Extended.dcm x;
 296 v gdcm-JPEG-Extended.dcm.XDCM; #OK
 297 xmedcon gdcm-JPEG-Extended.dcm.XDCM; #OK
 298
 299 testWrite jpeglossy1.dcm x;
 300 v jpeglossy1.dcm.XDCM #OK
 301 xmedcon jpeglossy1.dcm.XDCM #OK
 302
 303 #JPEG Baseline (Process 14)
 304 #--------------------------
 305 testWrite MR-MONO2-12-shoulder.dcm x;
 306 v  MR-MONO2-12-shoulder.dcm.XDCM; #OK
 307 xmedcon MR-MONO2-12-shoulder.dcm.XDCM; #OK
 308
 309
 310 #fichier format ecat.
 311 #testWrite imageEcat.ecat r
 312
 313 #JPEG Lossy 8 bits
 314 #=================
 315 #JPEG Baseline (Process 1)
 316 #-------------------------
 317 # Bracco Files
 318 testWrite US.1.2.dcm x;
 319 echo "expected : A lot of Fragments (40), nb Frames = 40 ;-)";
 320 echo "expected  pixelType=8U SamplesPerPixel=3 PlanarConfiguration=0";
 321 echo "          PhotometricInterpretation=YBR_FULL_422";
 322 v US.1.2.dcm.XDCM;  #OK
 323 xmedcon US.1.2.dcm.XDCM;  #OK
 324
 325 #Sequoia Acusson U11
 326 testWrite CLIP0001-Sequoia-U11.dcm x;
 327 v CLIP0001-Sequoia-U11.dcm.XDCM; #OK
 328 xmedcon CLIP0001-Sequoia-U11.dcm.XDCM; #OK
 329
 330 #RLE Lossless
 331 #-------------
 332 testWrite canadaAloka.dcm x;
 333 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=1";
 334 echo "         PlanarConfiguration=0 PhotometricInterpretation=MONOCHROME2";
 335 echo "         nb Frames (DIMZ) : 1";
 336 v canadaAloka.dcm.XDCM; # OK
 337 xmedcon canadaAloka.dcm.XDCM; #OK
 338
 339 testWrite jpeglossy1.dcm x; # equal to ???
 340 v jpeglossy1.dcm.XDCM; #OK
 341 xmedcon jpeglossy1.dcm.XDCM; #OK
 342
 343 testWrite FMAG0001.dcm x;
 344 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=3";
 345 echo "         PlanarConfiguration=1 PhotometricInterpretation=YBR_FULL";
 346 echo "         nb Frames (DIMZ) : 1";
 347 v FMAG0001.dcm.XDCM; #OK
 348 xmedcon FMAG0001.dcm.XDCM; #OK
 349
 350 v QMAG0001.dcm; #OK
 351 xmedcon QMAG0001.dcm; #original breaks xmedcon
 352                       #warning: Unknown PhotometricInterpretation
 353 testWrite QMAG0001.dcm x;
 354 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=3";
 355 echo "         PlanarConfiguration=1 PhotometricInterpretation=YBR_FULL";
 356 v QMAG0001.dcm.XDCM; #OK
 357 xmedcon QMAG0001.dcm.XDCM; #OK
 358
 359 testWrite US-PAL-8-10x-echo.dcm x;
 360 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=0";
 361 echo "         PhotometricInterpretation=PALETTE COLOR";
 362 echo "         nb Frames (DIMZ): 10";
 363 echo "expected : Parsing 10 'single fragment' Segments";
 364 echo "           Reading 10 'single fragment' Segments (ouf!)";
 365 v US-PAL-8-10x-echo.dcm.XDCM; #                       SEG FAULT
 366 xmedcon US-PAL-8-10x-echo.dcm.XDCM; #OK
 367
 368 testWrite 8BitsRunLengthGrayScale.dcm x;
 369 echo "expected : correct Gray image";
 370 v 8BitsRunLengthGrayScale.dcm.XDCM; #OK
 371 xmedcon 8BitsRunLengthGrayScale.dcm.XDCM; #OK
 372
 373 testWrite 8BitsRunLengthColor.dcm x;
 374 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=2";
 375 echo "         PhotometricInterpretation=PALETTE COLOR";
 376 v 8BitsRunLengthColor.dcm.XDCM;  #             SEG FAULT
 377 echo "WAS expected correct color image";
 378 xmedcon 8BitsRunLengthColor.dcm.XDCM;  #OK
 379
 380 #RLE 16 bits --> Try to find some more images
 381
 382 testWrite 16BitsRunLengthGrayScale.dcm x;
 383 echo "expected pixelType=16U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=0";
 384 echo "         PhotometricInterpretation=MONOCHROME2";
 385 v 16BitsRunLengthGrayScale.dcm.XDCM;
 386 xmedcon 16BitsRunLengthGrayScale.dcm.XDCM; #OK
 387
 388 #Were supposed to be bugged
 389 #--------------------------
 390 #(break xmedcon)
 391 xmedcon 00191113.dcm; #No images found
 392 testWrite 00191113.dcm x;
 393 v 00191113.dcm.XDCM; #OK
 394 xmedcon 00191113.dcm.XDCM; #OK
 395
 396 xmedcon DermaColorLossLess.dcm; #breaks xmedcon : No images found
 397 testWrite DermaColorLossLess.dcm x;
 398 xmedcon DermaColorLossLess.dcm.XDCM; #breaks xmedcon
 399 #Feb 02 19:33:16 log[2619]: warning: Tag with uneven length
 400 #Feb 02 19:33:16 log[2619]: warning: No transfer syntax found
 401 #Feb 02 19:33:16 log[2619]: error: No images found
 402 v DermaColorLossLess.dcm.XDCM #OK
 403
 404 #Original breaks xmedcon, affimdcm complian ?!
 405 affimdcm filein=RadBWLossLess.dcm; #OK
 406 v RadBWLossLess.dcm; #OK
 407 xmedcon RadBWLossLess.dcm; # breaks :error: No images found
 408 testWrite RadBWLossLess.dcm x;
 409 v RadBWLossLess.dcm.XDCM; #OK
 410 xmedcon RadBWLossLess.dcm.XDCM; #error: No images found
 411
 412 #Known as BUGGED !
 413 #----------------
 414
 415 #Rectangular old 24 Bits image
 416 v gdcm-RGB-LibIDORect.acr; # OK
 417 testWrite gdcm-RGB-LibIDORect.acr x;
 418 v gdcm-RGB-LibIDORect.acr.XDCM;
 419 xmedcon gdcm-RGB-LibIDORect.acr.XDCM; # breaks : large Bit Allocated (24)
 420 #TODO transform '24 bit images' into 8 bits + samples per pixel = 3
 421
 422 #MR GE GENESIS_SIGNA Palo Alto
 423 testWrite DicomSampleNastyGEImage.dcm x;
 424 echo " expected : warning uneven length (13) for 0008|103e";
 425 v DicomSampleNastyGEImage.dcm.XDCM; #OK
 426 xmedcon DicomSampleNastyGEImage.dcm.XDCM; #OK
 427
 428 #MR Philips NTSCAN Hop. Neuro Lyon
 429 PrintHeader philipsMR-lossy.ima #OK
 430 xmedcon philipsMR-lossy.ima;    #original breaks xmedcon
 431 v philipsMR-lossy.ima;          #Original OK
 432 testWrite philipsMR-lossy.ima x;
 433 echo "WAS expected : 'Bogus Huffman table definition' on philipsMR-lossy.ima";
 434 echo "IS  expected : 'JERR_BAD_HUFF_TABLE sym 16 (>15)' but the show goes on";
 435 v philipsMR-lossy.ima.XDCM;  #      BLACK IMAGE
 436 xmedcon philipsMR-lossy.ima.XDCM; #OK
 437
 438 #CT Siemens Hop. Salengro Lille
 439 testWrite gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm x;
 440 echo "expected : wrong sequence delimiter (b00c,0eb6) at end of pixels";
 441 echo "xmedcon says 'error: Unexpected end of file'";
 442 vtkgdcmViewer gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm.XDCM;  #OK; needs 'R' for display
 443 xmedcon gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm.XDCM; #OK
 444
 445 #CR Philips Thoravision Hop Cardio Lyon
 446 affimdcm filein=gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm; # OK, wrong image as usual
 447 xmedcon gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm;        #original seg faults xmedcon
 448 testWrite gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm x; #breaks ;
 449 echo "expected : 147 fragments,length : 29860 + 145*32760 + 14416";
 450 echo "breaks xmedcom, breaks e-film";
 451 echo "WAS expected : hashed image -with jLBJpeg-";
 452 echo "IS  expected : Seg Fault";
 453 xmedcon gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm.XDCM; # NOT CHECKED
 454
 455 #MR Picker ST. ANTHONY HOSPITAL
 456 testWrite MR.6799.1.dcm x;  #equal to ???
 457 echo "OK; DICOM Image with NO Preamble";
 458 v MR.6799.1.dcm.XDCM; #OK
 459 xmedcon MR.6799.1.dcm.XDCM; #OK
 460
 461 #Segmented Palette Color LUT Data
 462 xmedcon gdcm-US-ALOKA-16.dcm; #breaks # Missing CLUT
 463 vtkgdcmViewer gdcm-US-ALOKA-16.dcm3; #OK
 464 testWrite gdcm-US-ALOKA-16.dcm x;
 465 echo "expected  pixelType=16U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=0";
 466 echo "          PhotometricInterpretation=PALETTE COLOR";
 467 echo "expected : Gray image since 'Segmented xxx Palette Color LUT Data' not yet taken into account";
 468 echo "neither e-film nor DicomWorks deals with the color"
 469 echo "breaks xmedcom";
 470 echo "breaks vtkgdcmViewer (bad result : 24 bits expected; 16 found in Pixels area)";
 471 vtkgdcmViewer gdcm-US-ALOKA-16.dcm.XDCM; #OK
 472 xmedcon gdcm-US-ALOKA-16.dcm.XDCM; #breaks
 473 #Feb 03 13:40:19 log[26999]: error: Missing CLUT
 474 #Feb 03 13:40:19 log[26999]: error: No images found
 475
 476 # bugged Siemens 'Leonardo' image
 477 testWrite 8078283Leonardo.dcm x;
 478 xmedcon 8078283Leonardo.dcm.XDCM; #OK
 479
 480 #CT McTwin Elscint C.H.R.U  LILLE  C.HURIEZ
 481  xmedcon MxTwinLossLess.dcm; #breaks No images found
 482  v MxTwinLossLess.dcm; #OK
 483  testWrite MxTwinLossLess.dcm x;
 484  v MxTwinLossLess.dcm.XDCM;  #OK
 485  xmedcon MxTwinLossLess.dcm.XDCM #breaks
 486
 487 # MRI image from VPRO burned CD
 488 v mriThruVPRO.dcm;                               # Tasteless SHIT
 489 xmedcon mriThruVPRO.dcm;                         # pas mieux
 490 testWrite mriThruVPRO.dcm x;
 491 v mriThruVPRO.dcm.XDCM;
 492 echo "expected : tasteless SHIT !"
 493 echo "breaks Siemens Leonardo viewer . JPEG encoding is bugged?"
 494
 495 # gdcm made Theralys image
 496 # due to H table, a SeQuence is tagged with 0 length
 497 # when using gdcmFile::WriteDcmXXX
 498 xmedcon fromTheralys.dcm; # Original breaks xmedcon
 499 testWrite fromTheralys.dcm x;
 500 v fromTheralys.dcm.XDCM; # OK
 501 xmedcon fromTheralys.dcm.XDCM; # OK