checkWriteExplicit.sh

   1 # Check READ
   2 # ==========
   3 #
   4 # This script :
   5 #   - gdcmreads the images of gdcmData
   6 #   - gdcmwrites the result, with Explicit Value Representation
   7 #                into a '.XDCM' file
   8 #   - tests the result
   9 #       - using creatis' LibIDO/affimdcm (you may drop it)
  10 #       - using mathieu malaterre's vtkgdcmViewer
  11 #       - using Eric Nolf's xmedcon
  12 #       - the full checking should be using e-film,
  13 #                  but it doesn't work on Windoz
  14 #
  15 #
  16 # Sebastien Barre's files have no interest here, since the header is
  17 # a *very clean* ACR-NEMA
  18 # Our problems come from DICOM V3, with SQ, shadow groups, etc.
  19
  20 # --> EVERYWHERE, with XMEDCOM :
  21 # --> warning: Incorrect OB value representation (fixed)
  22 # --> to be fixed in the WRITER ...
  23
  24 #No Swap Info
  25 #------------
  26 gdcmCxxTests testWrite mr176621.dcm x;
  27 gdcmCxxTests PrintHeader mr176621.dcm.XDCM 2;  .
  28 vtkgdcmViewer mr176621.dcm.XDCM; #  OK
  29 xmedcon mr176621.dcm.XDCM; # warning: No transfer syntax found
  30                            # warning: Tag with uneven length
  31                            #
  32                            #breaks because 'DICM" without group 0000
  33                            # Write DCM needs 'CheckFileHeaderConsistency' method
  34
  35 # No Transfert Syntax
  36 #--------------------
  37
  38 #Big Endian
  39
  40 #      -------------------------------------------  BIG SOUCY !!
  41 affimdcm filein=cr172241.dcm zoom=-4;
  42 xmedcon cr172241.dcm;  # OK
  43 gdcmCxxTests testWrite cr172241.dcm r;
  44 affim filein=cr172241.dcm.RAW nbit=16  DIMX=1792 DIMY=2392;
  45 gdcmCxxTests PrintHeader cr172241.dcm 2;  #OK
  46 # But ... :
  47 vtkgdcmViewer cr172241.dcm;              # breaks (white image)   WHITE IMAGE ?!?
  48                              # Doesn't break DaVaW ...
  49 gdcmCxxTests testWrite cr172241.dcm x;
  50 gdcmCxxTests  PrintHeader cr172241.dcm.XDCM 2;   #OK
  51 xmedcon cr172241.dcm.XDCM;         # OK Incorrect OB value representation (fixed)
  52 affimdcm filein=cr172241.dcm.XDCM; # OK
  53 vtkgdcmViewer cr172241.dcm.XDCM;               # breaks ?!? White image !
  54
  55
  56 vtkgdcmViewer Wrist.pap;                     # PAPYRUS 3.0 single frame image
  57 gdcmCxxTests  PrintHeader Wrist.pap 2;
  58 gdcmCxxTests testWrite Wrist.pap x;           # OK
  59 gdcmCxxTests  PrintHeader Wrist.pap.XDCM
  60
  61
  62 gdcmCxxTests testWrite cr_45031.dcm x;
  63 vtkgdcmViewer cr_45031.dcm.XDCM;          #OK
  64 xmedcon  cr_45031.dcm.XDCM;   #OK
  65
  66 gdcmCxxTests testWrite CR-MONO1-10-chest.dcm x;
  67 gdcmCxxTests  PrintHeader CR-MONO1-10-chest.dcm.XDCM 2; #OK
  68 vtkgdcmViewer CR-MONO1-10-chest.dcm.XDCM;             #OK
  69 xmedcon CR-MONO1-10-chest.dcm.XDCM;       #OK Incorrect OB value representation (fixed)
  70
  71 gdcmCxxTests testWrite CT-MONO2-12-lomb-an2.acr2 x;
  72 gdcmCxxTests  PrintHeader CT-MONO2-12-lomb-an2.acr2.XDCM 2; # OK
  73 vtkgdcmViewer CT-MONO2-12-lomb-an2.acr2.XDCM; #OK
  74 xmedcon CT-MONO2-12-lomb-an2.acr2.XDCM; #OK Incorrect OB value representation (fixed)
  75
  76 xmedcon gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1; # Original OK
  77 gdcmCxxTests  PrintHeader gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1; #OK
  78 gdcmCxxTests testWrite gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1 x;
  79 gdcmCxxTests  PrintHeader gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1.XDCM 2;
  80 vtkgdcmViewer  gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1.XDCM;
  81 xmedcon gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1.XDCM; #breaks error: No images found
  82
  83 xmedcon gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2 #original OK
  84 gdcmCxxTests testWrite gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2 x;
  85 gdcmCxxTests  PrintHeader  gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2.XDCM 2;
  86 vtkgdcmViewer gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2.XDCM; #OK
  87 xmedcon gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2.XDCM; #breaks
  88                                       # --> TODO fix group length for odd groups#Feb 03 18:50:24 log[4419]: warning: No transfer syntax found
  89 #Feb 03 18:50:24 log[4419]: warning: Tag with uneven length
  90 #Feb 03 18:50:24 log[4419]: error: No images found
  91
  92 gdcmCxxTests testWrite MR-MONO2-12-an2.acr2 x;
  93 gdcmCxxTests  PrintHeader newACR1000.nema.XDCM 2;
  94 vtkgdcmViewer MR-MONO2-12-an2.acr2.XDCM;
  95 xmedcon MR-MONO2-12-an2.acr2.XDCM; # OK warning: Incorrect OB value representation
  96
  97 gdcmCxxTests testWrite newACR1000.nema x;          # == gdcmMR-SIEMENS-16.acr2
  98 gdcmCxxTests  PrintHeader newACR1000.nema.XDCM; #OK
  99 vtkgdcmViewer newACR1000.nema.XDCM; #OK
 100 xmedcon newACR1000.nema.XDCM; # breaks : no image found
 101
 102 gdcmCxxTests testWrite oldACR00001.ima x;          # == gdcm-MR-SIEMENS.16.acr1
 103 gdcmCxxTests  PrintHeader oldACR00001.ima.XDCM; # OK
 104 vtkgdcmViewer oldACR00001.ima.XDCM; #OK
 105 xmedcon oldACR00001.ima.XDCM; # breaks : no image found
 106
 107 gdcmCxxTests testWrite OT-MONO2-8-a7.dcm x;
 108 vtkgdcmViewer OT-MONO2-8-a7.dcm.XDCM;        #OK
 109 xmedcon OT-MONO2-8-a7.dcm.XDCM ; #OK
 110
 111 #No Samples Per Pixel
 112 #--------------------
 113 gdcmCxxTests testWrite gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm x;
 114 affim filein=gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm;
 115 gdcmCxxTests  PrintHeader  gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm.XDCM 2; # OK
 116 vtkgdcmViewer gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm.XDCM;              #OK
 117 xmedcon gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm.XDCM         #OK
 118
 119 #Unnormalized Rectangular LibIDO format image
 120 #--------------------------------------------
 121 gdcmCxxTests testWrite gdcm-ACR-LibIDO.acr x;
 122 vtkgdcmViewer gdcm-ACR-LibIDO.acr.XDCM; # OK
 123 xmedcon gdcm-ACR-LibIDO.acr.XDCM; #inverts x and y (of course)
 124
 125 #Bits Allocated =12, Bits Stored=12
 126 #----------------------------------
 127 #MR Philips (once upon a time in Lyon-Sud)
 128 gdcmCxxTests testWrite MR-MONO2-12-angio-an1.acr1 x;
 129 vtkgdcmViewer MR-MONO2-12-angio-an1.acr1.XDCM;       # shitty image
 130 xmedcon MR-MONO2-12-angio-an1.acr1.XDCM; #  pas mieux : warning: Incorrect PixelData length
 131
 132 #RGB
 133 #---
 134 gdcmCxxTests testWrite US.3405.1.dcm x;
 135 echo "expected  pixelType=8U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=0";
 136 echo "          PhotometricInterpretation=RGB";
 137 vtkgdcmViewer US.3405.1.dcm.XDCM; #OK
 138 xmedcon US.3405.1.dcm.XDCM; #OK
 139
 140 #      -------------------------------------------  KING SIZE SOUCY !!
 141
 142 gdcmCxxTests testWrite OT-PAL-8-face.dcm x;
 143 echo "expected  pixelType=8U SamplesPerPixel=3 PlanarConfiguration=1";
 144 echo "          PhotometricInterpretation=PALETTE COLOR";
 145 gdcmCxxTests  PrintHeaderOT-PAL-8-face.dcm.XDCM; OK
 146 affimdcm filein=OT-PAL-8-face.dcm.XDCM; #OK
 147 vtkgdcmViewer OT-PAL-8-face.dcm.XDCM;               #   seg fault .!?
 148 xmedcon OT-PAL-8-face.dcm.XDCM; #OK
 149
 150 gdcmCxxTests testWrite 8BitsUncompressedColor.dcm x;
 151 vtkgdcmViewer 8BitsUncompressedColor.dcm.XDCM;        #   seg fault .!?
 152 xmedcon 8BitsUncompressedColor.dcm.XDCM ; #OK
 153
 154 # Implicit VR - Little Endian
 155 #-----------------------------
 156
 157 gdcmCxxTests testWrite CT-MONO2-16-ankle.dcm x;
 158  xmedcon CT-MONO2-16-ankle.dcm.XDCM; #ok
 159  vtkgdcmViewer CT-MONO2-16-ankle.dcm.XDCM; #ok
 160  gdcmCxxTests  PrintHeader  CT-MONO2-16-ankle.dcm 2; #ok
 161
 162 gdcmCxxTests testWrite CT-MONO2-16-ort.dcm x;
 163 vtkgdcmViewer CT-MONO2-16-ort.dcm.XDCM;  #OK
 164 xmedcon CT-MONO2-16-ort.dcm.XDCM;  #OK
 165
 166
 167 gdcmCxxTests testWrite CT-MONO2-8-abdo.dcm x;
 168 vtkgdcmViewer CT-MONO2-8-abdo.dcm.XDCM; #OK
 169 xmedcon CT-MONO2-8-abdo.dcm.XDCM; #OK
 170
 171 gdcmCxxTests testWrite gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm x;
 172 gdcmCxxTests  PrintHeader gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm.XDCM 2; #OK
 173 vtkgdcmViewer gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm.XDCM; # OK
 174 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm.XDCM; # error: No images found
 175 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm; # OK with original image
 176
 177 gdcmCxxTests testWrite MR-MONO2-16-head.dcm x;
 178 vtkgdcmViewer MR-MONO2-16-head.dcm.XDCM;  #OK
 179 xmedcon MR-MONO2-16-head.dcm.XDCM;  #OK
 180
 181 gdcmCxxTests testWrite multiframe1Integris.dcm x;
 182 gdcmCxxTests  PrintHeader CT-MONO2-8-abdo.dcm.XDCM 2; #OK
 183 vtkgdcmViewer multiframe1Integris.dcm.XDCM; #OK
 184 xmedcon multiframe1Integris.dcm.XDCM; #breaks No images found
 185 xmedcon multiframe1Integris.dcm;
 186
 187 gdcmCxxTests testWrite multiframe2GE.dcm x;
 188 vtkgdcmViewer multiframe2GE.dcm.XDCM; #OK
 189 #breaks xmedcon
 190 xmedcon multiframe2GE.dcm.XDCM; #breaks No images found
 191
 192 vtkgdcmViewer irmPhlipsNew1.dcm;
 193 gdcmCxxTests testWrite irmPhlipsNew1.dcm x; # == gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
 194 vtkgdcmViewer irmPhlipsNew1.dcm.XDCM;     #OK
 195 xmedcon irmPhlipsNew1.dcm.XDCM; #breaks : No images found
 196
 197 #avec imagette (icone)
 198
 199 vtkgdcmViewer icone.dcm;   #OK
 200 gdcmCxxTests  PrintHeader icone.dcm 2 | grep fffe;
 201 echo "so many 0xfffe ! (274)"
 202
 203 gdcmCxxTests testWrite icone.dcm x;
 204 xmedcon icone.dcm; #original image OK
 205 gdcmCxxTests  PrintHeader icone.dcm.XDCM 2;
 206 #gdcmCxxTests  PrintHeader OK; vtkgdcmViewer OK; breaks xmedcom
 207 vtkgdcmViewer icone.dcm.XDCM; #   shitty image        --> TODO : FIX (once again)icon pb
 208 xmedcon icone.dcm.XDCM; #breaks
 209
 210 #Palette
 211
 212 # ???
 213 # 8 Bits  ?
 214 # 16 Bits ?
 215
 216 #Explicit VR - Little Endian
 217 #----------------------------
 218 gdcmCxxTests testWrite CT-MONO2-16-brain.dcm x;
 219 vtkgdcmViewer CT-MONO2-16-brain.dcm.XDCM;       #OK
 220 xmedcon CT-MONO2-16-brain.dcm.XDCM; #OK
 221
 222 gdcmCxxTests  PrintHeader gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm 2;
 223 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm #OK :Skip PHILIPS premature item bug
 224 vtkgdcmViewer gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm; #OK
 225 gdcmCxxTests testWrite gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm x;
 226 gdcmCxxTests  PrintHeader gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm.XDCM 2; #pixel group missing??!?
 227 #vtkgdcmViewer gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm.XDCM;            #shitty image, ofcourse
 228 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm.XDCM;       #  works ?!?
 229 vtkgdcmViewer gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm.XDCM;
 230
 231
 232 gdcmCxxTests testWrite gdcm-MR-PHILIPS-16-NonRectPix.dcm x;
 233 vtkgdcmViewer gdcm-MR-PHILIPS-16-NonRectPix.dcm.XDCM; #OK
 234 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16-NonRectPix.dcm.XDCM; #OK warning: Incorrect sequence length
 235
 236 gdcmCxxTests testWrite MR-MONO2-8-16x-heart.dcm x;  #multiframe # equals to ???
 237 vtkgdcmViewer MR-MONO2-8-16x-heart.dcm.XDCM;       #OK
 238 xmedcon MR-MONO2-8-16x-heart.dcm.XDCM; #OK
 239
 240 gdcmCxxTests testWrite NM-MONO2-16-13x-heart.dcm x;  #multiframe
 241 vtkgdcmViewer NM-MONO2-16-13x-heart.dcm.XDCM;       #OK
 242 xmedcon NM-MONO2-16-13x-heart.dcm.XDCM; #OK
 243
 244 gdcmCxxTests testWrite sonataMonaco.dcm x;
 245 vtkgdcmViewer sonataMonaco.dcm.XDCM;       #OK
 246 xmedcon sonataMonaco.dcm.XDCM; #OK
 247
 248 #MultiFrame
 249 gdcmCxxTests testWrite US-MONO2-8-8x-execho.dcm x;
 250 gdcmCxxTests  PrintHeader US-MONO2-8-8x-execho.dcm.XDCM;
 251 vtkgdcmViewer US-MONO2-8-8x-execho.dcm.XDCM;       # OK
 252 xmedcon US-MONO2-8-8x-execho.dcm.XDCM; #OK
 253
 254 #RGB
 255
 256 gdcmCxxTests testWrite US-RGB-8-epicard.dcm x;
 257 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=3 PlanarConfiguration=1";
 258 echo "         PhotometricInterpretation=RGB";
 259 vtkgdcmViewer US-RGB-8-epicard.dcm.XDCM; #OK
 260 xmedcon US-RGB-8-epicard.dcm.XDCM; #OK
 261
 262 gdcmCxxTests testWrite US-RGB-8-esopecho.dcm x;
 263 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=3 PlanarConfiguration=0";
 264 echo "         PhotometricInterpretation=RGB",
 265 xmedcon US-RGB-8-esopecho.dcm.XDCM; #OK
 266
 267 # Non-Hierarchical, First-Order Prediction (Process 14 [Selection Value 1])
 268 #--------------------------------------------------------------------------
 269 # (JPEG Lossless)
 270
 271 gdcmCxxTests testWrite CT-MONO2-16-chest.dcm x;
 272 vtkgdcmViewer CT-MONO2-16-chest.dcm.XDCM; #OK
 273 xmedcon CT-MONO2-16-chest.dcm.XDCM; #OK
 274
 275 gdcmCxxTests testWrite 012345.002.050.dcm x;
 276 vtkgdcmViewer 012345.002.050.dcm.XDCM; #OK
 277 xmedcon 012345.002.050.dcm.XDCM; #OK
 278
 279 gdcmCxxTests testWrite gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm x;
 280 vtkgdcmViewer gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm.XDCM ; #OK
 281 xmedcon gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm.XDCM;  #OK
 282
 283 gdcmCxxTests testWrite XA-MONO2-8-12x-catheter.dcm x;
 284 vtkgdcmViewer XA-MONO2-8-12x-catheter.dcm.XDCM; #OK
 285 gdcmCxxTests  PrintHeader XA-MONO2-8-12x-catheter.dcm.XDCM 2;
 286 xmedcon XA-MONO2-8-12x-catheter.dcm.XDCM; #OK
 287
 288 gdcmCxxTests testWrite xa_integris.dcm x;
 289 echo "a lot of fragments expected here";
 290 vtkgdcmViewer xa_integris.dcm.XDCM #OK
 291 xmedcon xa_integris.dcm.XDCM #OK
 292
 293 gdcmCxxTests testWrite 16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm x;
 294 vtkgdcmViewer 16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.XDCM #OK
 295 xmedcon 16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.XDCM #OK
 296
 297 #comming from GE dlx via VTServer
 298 vtkgdcmViewer I9000001.dcm;
 299 gdcmCxxTests testWrite I9000001.dcm x;
 300 gdcmCxxTests  PrintHeader I9000001.dcm.XDCM 2; # pixel group NOT FOUND ??!??
 301 #black image
 302 vtkgdcmViewer I9000001.dcm.XDCM;
 303 #no image found
 304 xmedcon I9000001.dcm.XDCM;
 305
 306 #JPEG Extended (Process 2 & 4) // 16 bits
 307 #-----------------------------
 308 gdcmCxxTests testWrite gdcm-JPEG-Extended.dcm x;
 309 vtkgdcmViewer gdcm-JPEG-Extended.dcm.XDCM; #OK
 310 xmedcon gdcm-JPEG-Extended.dcm.XDCM; #OK
 311
 312 gdcmCxxTests testWrite jpeglossy1.dcm x;
 313 vtkgdcmViewer jpeglossy1.dcm.XDCM #OK
 314 xmedcon jpeglossy1.dcm.XDCM #OK
 315
 316 #JPEG Baseline (Process 14)
 317 #--------------------------
 318 gdcmCxxTests testWrite MR-MONO2-12-shoulder.dcm x;
 319 vtkgdcmViewer  MR-MONO2-12-shoulder.dcm.XDCM; #OK
 320 xmedcon MR-MONO2-12-shoulder.dcm.XDCM; #OK
 321
 322
 323 #fichier format ecat.
 324 #gdcmCxxTests testWrite imageEcat.ecat r
 325
 326 #JPEG Lossy 8 bits
 327 #=================
 328 #JPEG Baseline (Process 1)
 329 #-------------------------
 330 # Bracco Files
 331 gdcmCxxTests testWrite US.1.2.dcm x;
 332 echo "expected : A lot of Fragments (40), nb Frames = 40 ;-)";
 333 echo "expected  pixelType=8U SamplesPerPixel=3 PlanarConfiguration=0";
 334 echo "          PhotometricInterpretation=YBR_FULL_422";
 335 vtkgdcmViewer US.1.2.dcm.XDCM;  #OK
 336 xmedcon US.1.2.dcm.XDCM;  #OK
 337
 338 #Sequoia Acusson U11
 339 gdcmCxxTests testWrite CLIP0001-Sequoia-U11.dcm x;
 340 vtkgdcmViewer CLIP0001-Sequoia-U11.dcm.XDCM; #OK
 341 xmedcon CLIP0001-Sequoia-U11.dcm.XDCM; #OK
 342
 343 #RLE Lossless
 344 #-------------
 345 gdcmCxxTests testWrite canadaAloka.dcm x;
 346 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=1";
 347 echo "         PlanarConfiguration=0 PhotometricInterpretation=MONOCHROME2";
 348 echo "         nb Frames (DIMZ) : 1";
 349 vtkgdcmViewer canadaAloka.dcm.XDCM; # OK
 350 xmedcon canadaAloka.dcm.XDCM; #OK
 351
 352 gdcmCxxTests testWrite jpeglossy1.dcm x; # equal to ???
 353 vtkgdcmViewer jpeglossy1.dcm.XDCM; #OK
 354 xmedcon jpeglossy1.dcm.XDCM; #OK
 355
 356 gdcmCxxTests testWrite FMAG0001.dcm x;
 357 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=3";
 358 echo "         PlanarConfiguration=1 PhotometricInterpretation=YBR_FULL";
 359 echo "         nb Frames (DIMZ) : 1";
 360 vtkgdcmViewer FMAG0001.dcm.XDCM; #OK
 361 xmedcon FMAG0001.dcm.XDCM; #OK
 362
 363 vtkgdcmViewer QMAG0001.dcm; #OK
 364 xmedcon QMAG0001.dcm; #original breaks xmedcon
 365                       #warning: Unknown PhotometricInterpretation
 366 gdcmCxxTests testWrite QMAG0001.dcm x;
 367 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=3";
 368 echo "         PlanarConfiguration=1 PhotometricInterpretation=YBR_FULL";
 369 vtkgdcmViewer QMAG0001.dcm.XDCM; #OK
 370 xmedcon QMAG0001.dcm.XDCM; #OK
 371
 372 gdcmCxxTests testWrite US-PAL-8-10x-echo.dcm x;
 373 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=0";
 374 echo "         PhotometricInterpretation=PALETTE COLOR";
 375 echo "         nb Frames (DIMZ): 10";
 376 echo "expected : Parsing 10 'single fragment' Segments";
 377 echo "           Reading 10 'single fragment' Segments (ouf!)";
 378 vtkgdcmViewer US-PAL-8-10x-echo.dcm.XDCM; #                       SEG FAULT
 379 xmedcon US-PAL-8-10x-echo.dcm.XDCM; #OK
 380
 381 gdcmCxxTests testWrite 8BitsRunLengthGrayScale.dcm x;
 382 echo "expected : correct Gray image";
 383 vtkgdcmViewer 8BitsRunLengthGrayScale.dcm.XDCM; #OK
 384 xmedcon 8BitsRunLengthGrayScale.dcm.XDCM; #OK
 385
 386 gdcmCxxTests testWrite 8BitsRunLengthColor.dcm x;
 387 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=2";
 388 echo "         PhotometricInterpretation=PALETTE COLOR";
 389 vtkgdcmViewer 8BitsRunLengthColor.dcm.XDCM;  #             SEG FAULT
 390 echo "WAS expected correct color image";
 391 xmedcon 8BitsRunLengthColor.dcm.XDCM;  #OK
 392
 393 #RLE 16 bits --> Try to find some more images
 394
 395 gdcmCxxTests testWrite 16BitsRunLengthGrayScale.dcm x;
 396 echo "expected pixelType=16U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=0";
 397 echo "         PhotometricInterpretation=MONOCHROME2";
 398 vtkgdcmViewer 16BitsRunLengthGrayScale.dcm.XDCM;
 399 xmedcon 16BitsRunLengthGrayScale.dcm.XDCM; #OK
 400
 401 #Were supposed to be bugged
 402 #--------------------------
 403 #(break xmedcon)
 404 xmedcon 00191113.dcm; #No images found
 405 gdcmCxxTests testWrite 00191113.dcm x;
 406 vtkgdcmViewer 00191113.dcm.XDCM; #OK
 407 xmedcon 00191113.dcm.XDCM; #OK
 408
 409 xmedcon DermaColorLossLess.dcm; #breaks xmedcon : No images found
 410 gdcmCxxTests testWrite DermaColorLossLess.dcm x;
 411 xmedcon DermaColorLossLess.dcm.XDCM; #breaks xmedcon
 412 #Feb 02 19:33:16 log[2619]: warning: Tag with uneven length
 413 #Feb 02 19:33:16 log[2619]: warning: No transfer syntax found
 414 #Feb 02 19:33:16 log[2619]: error: No images found
 415 vtkgdcmViewer DermaColorLossLess.dcm.XDCM #OK
 416
 417 #Original breaks xmedcon, affimdcm complian ?!
 418 affimdcm filein=RadBWLossLess.dcm; #OK
 419 vtkgdcmViewer RadBWLossLess.dcm; #OK
 420 xmedcon RadBWLossLess.dcm; # breaks :error: No images found
 421 gdcmCxxTests testWrite RadBWLossLess.dcm x;
 422 vtkgdcmViewer RadBWLossLess.dcm.XDCM; #OK
 423 xmedcon RadBWLossLess.dcm.XDCM; #error: No images found
 424
 425 #Known as BUGGED !
 426 #----------------
 427
 428 #Rectangular old 24 Bits image
 429 vtkgdcmViewer gdcm-RGB-LibIDORect.acr; # OK
 430 gdcmCxxTests testWrite gdcm-RGB-LibIDORect.acr x;
 431 vtkgdcmViewer gdcm-RGB-LibIDORect.acr.XDCM;
 432 xmedcon gdcm-RGB-LibIDORect.acr.XDCM; # breaks : large Bit Allocated (24)
 433 #TODO transform '24 bit images' into 8 bits + samples per pixel = 3
 434
 435 #MR GE GENESIS_SIGNA Palo Alto
 436 gdcmCxxTests testWrite DicomSampleNastyGEImage.dcm x;
 437 echo " expected : warning uneven length (13) for 0008|103e";
 438 vtkgdcmViewer DicomSampleNastyGEImage.dcm.XDCM; #OK
 439 xmedcon DicomSampleNastyGEImage.dcm.XDCM; #OK
 440
 441 #MR Philips NTSCAN Hop. Neuro Lyon
 442 gdcmCxxTests  PrintHeader philipsMR-lossy.ima #OK
 443 xmedcon philipsMR-lossy.ima;    #original breaks xmedcon
 444 vtkgdcmViewer philipsMR-lossy.ima;          #Original OK
 445 gdcmCxxTests testWrite philipsMR-lossy.ima x;
 446 echo "WAS expected : 'Bogus Huffman table definition' on philipsMR-lossy.ima";
 447 echo "IS  expected : 'JERR_BAD_HUFF_TABLE sym 16 (>15)' but the show goes on";
 448 vtkgdcmViewer philipsMR-lossy.ima.XDCM;  #      BLACK IMAGE
 449 xmedcon philipsMR-lossy.ima.XDCM; #OK
 450
 451 #CT Siemens Hop. Salengro Lille
 452 gdcmCxxTests testWrite gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm x;
 453 echo "expected : wrong sequence delimiter (b00c,0eb6) at end of pixels";
 454 echo "xmedcon says 'error: Unexpected end of file'";
 455 vtkgdcmViewer gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm.XDCM;  #OK; needs 'R' for display
 456 xmedcon gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm.XDCM; #OK
 457
 458 #CR Philips Thoravision Hop Cardio Lyon
 459 affimdcm filein=gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm; # OK, wrong image as usual
 460 xmedcon gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm;        #original seg faults xmedcon
 461 gdcmCxxTests testWrite gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm x; #breaks ;
 462 echo "expected : 147 fragments,length : 29860 + 145*32760 + 14416";
 463 echo "breaks xmedcom, breaks e-film";
 464 echo "WAS expected : hashed image -with jLBJpeg-";
 465 echo "IS  expected : Seg Fault";
 466 xmedcon gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm.XDCM; # NOT CHECKED
 467
 468 #MR Picker ST. ANTHONY HOSPITAL
 469 gdcmCxxTests testWrite MR.6799.1.dcm x;  #equal to ???
 470 echo "OK; DICOM Image with NO Preamble";
 471 vtkgdcmViewer MR.6799.1.dcm.XDCM; #OK
 472 xmedcon MR.6799.1.dcm.XDCM; #OK
 473
 474 #Segmented Palette Color LUT Data
 475 xmedcon gdcm-US-ALOKA-16.dcm; #breaks # Missing CLUT
 476 vtkgdcmViewer gdcm-US-ALOKA-16.dcm3; #OK
 477 gdcmCxxTests testWrite gdcm-US-ALOKA-16.dcm x;
 478 echo "expected  pixelType=16U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=0";
 479 echo "          PhotometricInterpretation=PALETTE COLOR";
 480 echo "expected : Gray image since 'Segmented xxx Palette Color LUT Data' not yet taken into account";
 481 echo "neither e-film nor DicomWorks deals with the color"
 482 echo "breaks xmedcom";
 483 echo "breaks vtkgdcmViewer (bad result : 24 bits expected; 16 found in Pixels area)";
 484 vtkgdcmViewer gdcm-US-ALOKA-16.dcm.XDCM; #OK
 485 xmedcon gdcm-US-ALOKA-16.dcm.XDCM; #breaks
 486 #Feb 03 13:40:19 log[26999]: error: Missing CLUT
 487 #Feb 03 13:40:19 log[26999]: error: No images found
 488
 489 # bugged Siemens 'Leonardo' image
 490 gdcmCxxTests testWrite 8078283Leonardo.dcm x;
 491 xmedcon 8078283Leonardo.dcm.XDCM; #OK
 492
 493 #CT McTwin Elscint C.H.R.U  LILLE  C.HURIEZ
 494  xmedcon MxTwinLossLess.dcm; #breaks No images found
 495  vtkgdcmViewer MxTwinLossLess.dcm; #OK
 496  gdcmCxxTests testWrite MxTwinLossLess.dcm x;
 497  vtkgdcmViewer MxTwinLossLess.dcm.XDCM;  #OK
 498  xmedcon MxTwinLossLess.dcm.XDCM #breaks
 499
 500 # MRI image from VPRO burned CD
 501 vtkgdcmViewer mriThruVPRO.dcm;                               # Tasteless SHIT
 502 xmedcon mriThruVPRO.dcm;                         # pas mieux
 503 gdcmCxxTests testWrite mriThruVPRO.dcm x;
 504 vtkgdcmViewer mriThruVPRO.dcm.XDCM;
 505 echo "expected : tasteless SHIT !"
 506 echo "breaks Siemens Leonardo viewer . JPEG encoding is bugged?"
 507
 508 # gdcm made Theralys image
 509 # due to H table, a SeQuence is tagged with 0 length
 510 # when using gdcmFile::WriteDcmXXX
 511 xmedcon fromTheralys.dcm; # Original breaks xmedcon
 512 gdcmCxxTests testWrite fromTheralys.dcm x;
 513 vtkgdcmViewer fromTheralys.dcm.XDCM; # OK
 514 xmedcon fromTheralys.dcm.XDCM; # OK