checkWriteExplicit.sh

   1 # Check READ
   2 #-----------
   3 #
   4 # We just write XDCM Files and AFFIM them
   5 # to be sure the writting was OK
   6 #
   7 # Sebastien Barre's files have no interest here, since the header is
   8 # a *very clean* ACR-NEMA
   9 # Our pb come from DICOM V3, with SQ, shadow groups, etc.
  10
  11 # --> EVERYWHERE, with XMEDCOM :
  12 # --> warning: Incorrect OB value representation (fixed)
  13 # --> to be fixed in the WRITER ...
  14
  15 #No Swap Info
  16 #------------
  17 testWrite mr176621.dcm x;
  18 PrintHeader mr176621.dcm.XDCM 2;  .
  19 v mr176621.dcm.XDCM; #  white image
  20 xmedcon mr176621.dcm.XDCM; #breaks because 'DICM" without group 0000
  21                           # Write DCM needs 'CheckFileHeaderConsistency' method
  22
  23 # No Transfert Syntax
  24 #--------------------
  25
  26 #Big Endian
  27 affimdcm filein=cr172241.dcm.XDCM zoom=-4;
  28 xmedcon cr172241.dcm;  # OK
  29
  30 testWrite cr172241.dcm r;
  31 affim filein=cr172241.dcm.RAW nbit=16  DIMX=1792 DIMY=2392;
  32 PrintHeader cr172241.dcm 2;  #OK
  33 # But ... :
  34 v cr172241.dcm;              # breaks (white image)   WHITE IMAGE ?!?
  35                              # Doesn't break DaVaW ...
  36 testWrite cr172241.dcm x;
  37 PrintHeader cr172241.dcm.XDCM 2; #OK
  38 xmedcon cr172241.dcm.XDCM;  # OK
  39 v cr172241.dcm.XDCM;        # breaks ?!? White image !
  40
  41
  42 testWrite cr_45031.dcm x;
  43 v cr_45031.dcm.XDCM; #OK
  44 xmedcon  cr_45031.dcm.XDCM;   #OK
  45
  46 testWrite CR-MONO1-10-chest.dcm x;
  47 PrintHeader CR-MONO1-10-chest.dcm.XDCM 2; #OK
  48 v CR-MONO1-10-chest.dcm.XDCM;
  49 xmedcon CR-MONO1-10-chest.dcm.XDCM; #OK
  50
  51 testWrite CT-MONO2-12-lomb-an2.acr2 x;
  52 PrintHeader CT-MONO2-12-lomb-an2.acr2.XDCM 2; # OK
  53 v CT-MONO2-12-lomb-an2.acr2.XDCM; #OK
  54 xmedcon CT-MONO2-12-lomb-an2.acr2.XDCM; #OK
  55
  56 xmedcon gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1; # Original OK
  57 PrintHeader gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1; #OK
  58 testWrite gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1 x;
  59 PrintHeader gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1.XDCM 2;
  60 v  gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1.XDCM;
  61 xmedcon gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1.XDCM; #breaks error: No images found
  62
  63 xmedcon gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2 #original OK
  64 testWrite gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2 x;
  65 PrintHeader  gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2.XDCM 2;
  66 v gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2.XDCM; #OK
  67 xmedcon gdcm-MR-SIEMENS-16.acr2.XDCM; #breaks
  68 #Feb 03 18:50:24 log[4419]: warning: No transfer syntax found
  69 #Feb 03 18:50:24 log[4419]: warning: Tag with uneven length
  70 #Feb 03 18:50:24 log[4419]: error: No images found
  71
  72 testWrite MR-MONO2-12-an2.acr2 x;
  73 PrintHeader newACR1000.nema.XDCM 2;
  74 v MR-MONO2-12-an2.acr2.XDCM;
  75 xmedcon MR-MONO2-12-an2.acr2.XDCM; # OK warning: Incorrect OB value representation
  76
  77 testWrite newACR1000.nema x;          # == gdcmMR-SIEMENS-16.acr2
  78 PrintHeader newACR1000.nema.XDCM; #OK
  79 v newACR1000.nema.XDCM; #OK
  80 xmedcon newACR1000.nema.XDCM; # breaks : no image found
  81
  82 testWrite oldACR00001.ima x;          # == gdcm-MR-SIEMENS.16.acr1
  83 PrintHeader oldACR00001.ima.XDCM; # OK
  84 v oldACR00001.ima.XDCM; #OK
  85 xmedcon oldACR00001.ima.XDCM; # breaks : no image found
  86
  87 testWrite OT-MONO2-8-a7.dcm x;
  88 v OT-MONO2-8-a7.dcm.XDCM;        #OK
  89 xmedcon OT-MONO2-8-a7.dcm.XDCM ; #OK
  90
  91 #No Samples Per Pixel
  92 #--------------------
  93 testWrite gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm x;
  94 affim filein=gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm;
  95 PrintHeader  gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm.XDCM 2; # OK
  96 v gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm.XDCM; #OK
  97 xmedcon gdcm-CR-DCMTK-16-NonSamplePerPix.dcm.XDCM #OK
  98
  99 #Unnormalized Rectangular LibIDO format image
 100 #--------------------------------------------
 101 testWrite gdcm-ACR-LibIDO.acr x;
 102 v gdcm-ACR-LibIDO.acr.XDCM; # OK
 103 xmedcon gdcm-ACR-LibIDO.acr.XDCM; #inverts x and y (of course)
 104
 105 #Bits Allocated =12, Bits Stored=12
 106 #----------------------------------
 107 #MR Philips (once upon a time in Lyon-Sud)
 108 testWrite MR-MONO2-12-angio-an1.acr1 x;
 109 v MR-MONO2-12-angio-an1.acr1.XDCM;       # shitty image
 110 xmedcon MR-MONO2-12-angio-an1.acr1.XDCM; #  pas mieux : warning: Incorrect PixelData length
 111
 112 #RGB
 113 #---
 114 testWrite US.3405.1.dcm x;
 115 echo "expected  pixelType=8U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=0";
 116 echo "          PhotometricInterpretation=RGB";
 117 v US.3405.1.dcm.XDCM; #OK
 118 xmedcon US.3405.1.dcm.XDCM; #OK
 119
 120 testWrite OT-PAL-8-face.dcm x;
 121 echo "expected  pixelType=8U SamplesPerPixel=3 PlanarConfiguration=1";
 122 echo "          PhotometricInterpretation=PALETTE COLOR";
 123 PrintHeaderOT-PAL-8-face.dcm.XDCM; OK
 124 v OT-PAL-8-face.dcm.XDCM;               #   seg fault .!?
 125 xmedcon OT-PAL-8-face.dcm.XDCM; #OK
 126
 127 testWrite 8BitsUncompressedColor.dcm x;
 128 v 8BitsUncompressedColor.dcm.XDCM;        #   seg fault .!?
 129 xmedcon 8BitsUncompressedColor.dcm.XDCM ; #OK
 130
 131 # Implicit VR - Little Endian
 132 #-----------------------------
 133
 134 testWrite CT-MONO2-16-ankle.dcm x;
 135  xmedcon CT-MONO2-16-ankle.dcm.XDCM; #ok
 136  v CT-MONO2-16-ankle.dcm.XDCM; #ok
 137  PrintHeader  CT-MONO2-16-ankle.dcm 2; #ok
 138
 139 testWrite CT-MONO2-16-ort.dcm x;
 140 v CT-MONO2-16-ort.dcm.XDCM;  #OK
 141 xmedcon CT-MONO2-16-ort.dcm.XDCM;  #OK
 142
 143
 144 testWrite CT-MONO2-8-abdo.dcm x;
 145 v CT-MONO2-8-abdo.dcm.XDCM; #OK
 146 xmedcon CT-MONO2-8-abdo.dcm.XDCM; #OK
 147
 148 testWrite gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm x;
 149 PrintHeader gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm.XDCM 2; #OK
 150 v gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm.XDCM; # OK
 151 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm.XDCM; # error: No images found
 152 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm; # OK with original image
 153
 154 testWrite MR-MONO2-16-head.dcm x;
 155 v MR-MONO2-16-head.dcm.XDCM;  #OK
 156 xmedcon MR-MONO2-16-head.dcm.XDCM;  #OK
 157
 158 testWrite multiframe1Integris.dcm x;
 159 PrintHeader CT-MONO2-8-abdo.dcm.XDCM 2; #OK
 160 v multiframe1Integris.dcm.XDCM; #OK
 161 xmedcon multiframe1Integris.dcm.XDCM; #breaks No images found
 162 xmedcon multiframe1Integris.dcm;
 163
 164 testWrite multiframe2GE.dcm x;
 165 v multiframe2GE.dcm.XDCM; #OK
 166 #breaks xmedcon
 167 xmedcon multiframe2GE.dcm.XDCM; #breaks No images found
 168
 169 v irmPhlipsNew1.dcm;
 170 testWrite irmPhlipsNew1.dcm x; # == gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
 171 v irmPhlipsNew1.dcm.XDCM;     #OK
 172 xmedcon irmPhlipsNew1.dcm.XDCM; #breaks : No images found
 173
 174 #avec imagette (icone)
 175
 176 v icone.dcm;   #OK
 177 PrintHeader icone.dcm 2 | grep fffe;
 178 echo "so many 0xfffe ! (274)"
 179
 180 testWrite icone.dcm x;
 181 PrintHeader icone.dcm.XDCM 2;
 182 #PrintHeader OK; v OK; breaks xmedcom
 183 v icone.dcm.XDCM; #   shitty image
 184 xmedcon icone.dcm.XDCM; #breaks
 185
 186 #Palette
 187
 188 # ???
 189 # 8 Bits  ?
 190 # 16 Bits ?
 191
 192 #Explicit VR - Little Endian
 193 #----------------------------
 194 testWrite CT-MONO2-16-brain.dcm x;
 195 v CT-MONO2-16-brain.dcm.XDCM; #OK
 196 xmedcon CT-MONO2-16-brain.dcm.XDCM; #OK
 197
 198 PrintHeader gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm 2;
 199 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm #OK :Skip PHILIPS premature item bug
 200 v gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm; #OK
 201 testWrite gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm x;
 202 PrintHeader gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm.XDCM 2; #pixel group missing??!?
 203 #v gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm.XDCM;            #shitty image, ofcourse
 204 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm.XDCM;    #  works ?!?
 205
 206 testWrite gdcm-MR-PHILIPS-16-NonRectPix.dcm x;
 207 v gdcm-MR-PHILIPS-16-NonRectPix.dcm.XDCM; #OK
 208 xmedcon gdcm-MR-PHILIPS-16-NonRectPix.dcm.XDCM; #OK warning: Incorrect sequence length
 209
 210 testWrite MR-MONO2-8-16x-heart.dcm x; #multiframe # equals to ???
 211 v MR-MONO2-8-16x-heart.dcm.XDCM; #OK
 212 xmedcon MR-MONO2-8-16x-heart.dcm.XDCM; #OK
 213
 214 testWrite NM-MONO2-16-13x-heart.dcm x;  #multiframe
 215 v NM-MONO2-16-13x-heart.dcm.XDCM; #OK
 216 xmedcon NM-MONO2-16-13x-heart.dcm.XDCM; #OK
 217
 218 testWrite sonataMonaco.dcm x;
 219 v sonataMonaco.dcm.XDCM; #OK
 220 xmedcon sonataMonaco.dcm.XDCM; #OK
 221
 222 #MultiFrame
 223 testWrite US-MONO2-8-8x-execho.dcm x;
 224 PrintHeader US-MONO2-8-8x-execho.dcm.XDCM;
 225 v US-MONO2-8-8x-execho.dcm.XDCM; # OK
 226 xmedcon US-MONO2-8-8x-execho.dcm.XDCM; #OK
 227
 228 #RGB
 229
 230 testWrite US-RGB-8-epicard.dcm x;
 231 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=3 PlanarConfiguration=1";
 232 echo "         PhotometricInterpretation=RGB";
 233 v US-RGB-8-epicard.dcm.XDCM; #OK
 234 xmedcon US-RGB-8-epicard.dcm.XDCM; #OK
 235
 236 testWrite US-RGB-8-esopecho.dcm x;
 237 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=3 PlanarConfiguration=0";
 238 echo "         PhotometricInterpretation=RGB",
 239 xmedcon US-RGB-8-esopecho.dcm.XDCM; #OK
 240
 241 # Non-Hierarchical, First-Order Prediction (Process 14 [Selection Value 1])
 242 #--------------------------------------------------------------------------
 243 # (JPEG Lossless)
 244
 245 testWrite CT-MONO2-16-chest.dcm x;
 246 v CT-MONO2-16-chest.dcm.XDCM; #OK
 247 xmedcon CT-MONO2-16-chest.dcm.XDCM; #OK
 248
 249 testWrite 012345.002.050.dcm x;
 250 v 012345.002.050.dcm.XDCM; #OK
 251 xmedcon 012345.002.050.dcm.XDCM; #OK
 252
 253 testWrite gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm x;
 254 v gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm.XDCM ; #OK
 255 xmedcon gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm.XDCM;  #OK
 256
 257 testWrite XA-MONO2-8-12x-catheter.dcm x;
 258 v XA-MONO2-8-12x-catheter.dcm.XDCM; #OK
 259 PrintHeader XA-MONO2-8-12x-catheter.dcm.XDCM 2;
 260 xmedcon XA-MONO2-8-12x-catheter.dcm.XDCM; #OK
 261
 262 testWrite xa_integris.dcm x;
 263 echo "a lot of fragments expected here";
 264 v xa_integris.dcm.XDCM #OK
 265 xmedcon xa_integris.dcm.XDCM #OK
 266
 267 testWrite 16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm x;
 268 v 16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.XDCM #OK
 269 xmedcon 16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.XDCM #OK
 270
 271 #comming from GE dlx via VTServer
 272 v I9000001.dcm;
 273 testWrite I9000001.dcm x;
 274 PrintHeader I9000001.dcm.XDCM 2; # pixel group NOT FOUND ??!??
 275 #black image
 276 v I9000001.dcm.XDCM;
 277 #no image found
 278 xmedcon I9000001.dcm.XDCM;
 279
 280 #JPEG Extended (Process 2 & 4) // 16 bits
 281 #-----------------------------
 282 testWrite gdcm-JPEG-Extended.dcm x;
 283 v gdcm-JPEG-Extended.dcm.XDCM; #OK
 284 xmedcon gdcm-JPEG-Extended.dcm.XDCM; #OK
 285
 286 testWrite jpeglossy1.dcm x;
 287 v jpeglossy1.dcm.XDCM #OK
 288 xmedcon jpeglossy1.dcm.XDCM #OK
 289
 290 #JPEG Baseline (Process 14)
 291 #--------------------------
 292 testWrite MR-MONO2-12-shoulder.dcm x;
 293 v  MR-MONO2-12-shoulder.dcm.XDCM; #OK
 294 xmedcon MR-MONO2-12-shoulder.dcm.XDCM; #OK
 295
 296
 297 #fichier format ecat.
 298 #testWrite imageEcat.ecat r
 299
 300 #JPEG Lossy 8 bits
 301 #=================
 302 #JPEG Baseline (Process 1)
 303 #-------------------------
 304 # Bracco Files
 305 testWrite US.1.2.dcm x;
 306 echo "expected : A lot of Fragments (40), nb Frames = 40 ;-)";
 307 echo "expected  pixelType=8U SamplesPerPixel=3 PlanarConfiguration=0";
 308 echo "          PhotometricInterpretation=YBR_FULL_422";
 309 v US.1.2.dcm.XDCM;  #OK
 310 xmedcon US.1.2.dcm.XDCM;  #OK
 311
 312 #Sequoia Acusson U11
 313 testWrite CLIP0001-Sequoia-U11.dcm x;
 314 v CLIP0001-Sequoia-U11.dcm.XDCM; #OK
 315 xmedcon CLIP0001-Sequoia-U11.dcm.XDCM; #OK
 316
 317 #RLE Lossless
 318 #-------------
 319 testWrite canadaAloka.dcm x;
 320 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=1";
 321 echo "         PlanarConfiguration=0 PhotometricInterpretation=MONOCHROME2";
 322 echo "         nb Frames (DIMZ) : 1";
 323 v canadaAloka.dcm.XDCM; # OK
 324 xmedcon canadaAloka.dcm.XDCM; #OK
 325
 326 testWrite jpeglossy1.dcm x; # equal to ???
 327 v jpeglossy1.dcm.XDCM; #OK
 328 xmedcon jpeglossy1.dcm.XDCM; #OK
 329
 330 testWrite FMAG0001.dcm x;
 331 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=3";
 332 echo "         PlanarConfiguration=1 PhotometricInterpretation=YBR_FULL";
 333 echo "         nb Frames (DIMZ) : 1";
 334 v FMAG0001.dcm.XDCM; #OK
 335 xmedcon FMAG0001.dcm.XDCM; #OK
 336
 337 v QMAG0001.dcm; #OK
 338 xmedcon QMAG0001.dcm; #original breaks xmedcon
 339                       #warning: Unknown PhotometricInterpretation
 340 testWrite QMAG0001.dcm x;
 341 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=3";
 342 echo "         PlanarConfiguration=1 PhotometricInterpretation=YBR_FULL";
 343 v QMAG0001.dcm.XDCM; #OK
 344 xmedcon QMAG0001.dcm.XDCM; #OK
 345
 346 testWrite US-PAL-8-10x-echo.dcm x;
 347 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=0";
 348 echo "         PhotometricInterpretation=PALETTE COLOR";
 349 echo "         nb Frames (DIMZ): 10";
 350 echo "expected : Parsing 10 'single fragment' Segments";
 351 echo "           Reading 10 'single fragment' Segments (ouf!)";
 352 v US-PAL-8-10x-echo.dcm.XDCM; #                       SEG FAULT
 353 xmedcon US-PAL-8-10x-echo.dcm.XDCM; #OK
 354
 355 testWrite 8BitsRunLengthGrayScale.dcm x;
 356 echo "expected : correct Gray image";
 357 v 8BitsRunLengthGrayScale.dcm.XDCM; #OK
 358 xmedcon 8BitsRunLengthGrayScale.dcm.XDCM; #OK
 359
 360 testWrite 8BitsRunLengthColor.dcm x;
 361 echo "expected pixelType=8U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=2";
 362 echo "         PhotometricInterpretation=PALETTE COLOR";
 363 v 8BitsRunLengthColor.dcm.XDCM;  #             SEG FAULT
 364 echo "WAS expected correct color image";
 365 xmedcon 8BitsRunLengthColor.dcm.XDCM;  #OK
 366
 367 #RLE 16 bits --> Try to find some more images
 368
 369 testWrite 16BitsRunLengthGrayScale.dcm x;
 370 echo "expected pixelType=16U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=0";
 371 echo "         PhotometricInterpretation=MONOCHROME2";
 372 v 16BitsRunLengthGrayScale.dcm.XDCM;
 373 xmedcon 16BitsRunLengthGrayScale.dcm.XDCM; #OK
 374
 375 #Were supposed to be bugged
 376 #--------------------------
 377 #(break xmedcon)
 378 xmedcon 00191113.dcm; #No images found
 379 testWrite 00191113.dcm x;
 380 v 00191113.dcm.XDCM; #OK
 381 xmedcon 00191113.dcm.XDCM; #OK
 382
 383 xmedcon DermaColorLossLess.dcm; #breaks xmedcon : No images found
 384 testWrite DermaColorLossLess.dcm x;
 385 xmedcon DermaColorLossLess.dcm.XDCM; #breaks xmedcon
 386 #Feb 02 19:33:16 log[2619]: warning: Tag with uneven length
 387 #Feb 02 19:33:16 log[2619]: warning: No transfer syntax found
 388 #Feb 02 19:33:16 log[2619]: error: No images found
 389 v DermaColorLossLess.dcm.XDCM #OK
 390
 391 #Original breaks xmedcon, affimdcm complian ?!
 392 affimdcm filein=RadBWLossLess.dcm; #OK
 393 v RadBWLossLess.dcm; #OK
 394 xmedcon RadBWLossLess.dcm; # breaks :error: No images found
 395 testWrite RadBWLossLess.dcm x;
 396 v RadBWLossLess.dcm.XDCM; #OK
 397 xmedcon RadBWLossLess.dcm.XDCM; #error: No images found
 398
 399 #Known as BUGGED !
 400 #----------------
 401
 402 #Rectangular old 24 Bits image
 403 v gdcm-RGB-LibIDORect.acr; # OK
 404 testWrite gdcm-RGB-LibIDORect.acr x;
 405 v gdcm-RGB-LibIDORect.acr.XDCM;
 406 xmedcon gdcm-RGB-LibIDORect.acr.XDCM; # breaks : large Bit Allocated (24)
 407 #TODO transform '24 bit images' into 8 bits + samples per pixel = 3
 408
 409 #MR GE GENESIS_SIGNA Palo Alto
 410 testWrite DicomSampleNastyGEImage.dcm x;
 411 echo " expected : warning uneven length (13) for 0008|103e";
 412 v DicomSampleNastyGEImage.dcm.XDCM; #OK
 413 xmedcon DicomSampleNastyGEImage.dcm.XDCM; #OK
 414
 415 #MR Philips NTSCAN Hop. Neuro Lyon
 416 PrintHeader philipsMR-lossy.ima #OK
 417 xmedcon philipsMR-lossy.ima;    #original breaks xmedcon
 418 v philipsMR-lossy.ima;          #Original OK
 419 testWrite philipsMR-lossy.ima x;
 420 echo "WAS expected : 'Bogus Huffman table definition' on philipsMR-lossy.ima";
 421 echo "IS  expected : 'JERR_BAD_HUFF_TABLE sym 16 (>15)' but the show goes on";
 422 v philipsMR-lossy.ima.XDCM;  #      BLACK IMAGE
 423 xmedcon philipsMR-lossy.ima.XDCM; #OK
 424
 425 #CT Siemens Hop. Salengro Lille
 426 testWrite gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm x;
 427 echo "expected : wrong sequence delimiter (b00c,0eb6) at end of pixels";
 428 echo "xmedcon says 'error: Unexpected end of file'";
 429 vtkgdcmViewer gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm.XDCM;  #OK; needs 'R' for display
 430 xmedcon gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm.XDCM; #OK
 431
 432 #CR Philips Thoravision Hop Cardio Lyon
 433 affimdcm filein=gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm; # OK, wrong image as usual
 434 xmedcon gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm;        #original seg faults xmedcon
 435 testWrite gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm x; #breaks ;
 436 echo "expected : 147 fragments,length : 29860 + 145*32760 + 14416";
 437 echo "breaks xmedcom, breaks e-film";
 438 echo "WAS expected : hashed image -with jLBJpeg-";
 439 echo "IS  expected : Seg Fault";
 440 xmedcon gdcm-JPEG-LossLessThoravision.dcm.XDCM; # NOT CHECKED
 441
 442 #MR Picker ST. ANTHONY HOSPITAL
 443 testWrite MR.6799.1.dcm x;  #equal to ???
 444 echo "OK; DICOM Image with NO Preamble";
 445 v MR.6799.1.dcm.XDCM; #OK
 446 xmedcon MR.6799.1.dcm.XDCM; #OK
 447
 448 #Segmented Palette Color LUT Data
 449 xmedcon gdcm-US-ALOKA-16.dcm; #breaks # Missing CLUT
 450 vtkgdcmViewer gdcm-US-ALOKA-16.dcm3; #OK
 451 testWrite gdcm-US-ALOKA-16.dcm x;
 452 echo "expected  pixelType=16U SamplesPerPixel=1 PlanarConfiguration=0";
 453 echo "          PhotometricInterpretation=PALETTE COLOR";
 454 echo "expected : Gray image since 'Segmented xxx Palette Color LUT Data' not yet taken into account";
 455 echo "neither e-film nor DicomWorks deals with the color"
 456 echo "breaks xmedcom";
 457 echo "breaks vtkgdcmViewer (bad result : 24 bits expected; 16 found in Pixels area)";
 458 vtkgdcmViewer gdcm-US-ALOKA-16.dcm.XDCM; #OK
 459 xmedcon gdcm-US-ALOKA-16.dcm.XDCM; #breaks
 460 #Feb 03 13:40:19 log[26999]: error: Missing CLUT
 461 #Feb 03 13:40:19 log[26999]: error: No images found
 462
 463 # bugged Siemens 'Leonardo' image
 464 testWrite 8078283Leonardo.dcm x;
 465 xmedcon 8078283Leonardo.dcm.XDCM; #OK
 466
 467 #CT McTwin Elscint C.H.R.U  LILLE  C.HURIEZ
 468  xmedcon MxTwinLossLess.dcm; #breaks No images found
 469  v MxTwinLossLess.dcm; #OK
 470  testWrite MxTwinLossLess.dcm x;
 471  v MxTwinLossLess.dcm.XDCM;  #OK
 472  xmedcon MxTwinLossLess.dcm.XDCM #breaks
 473
 474 # MRI image from VPRO burned CD
 475 v mriThruVPRO.dcm;                               # Tasteless SHIT
 476 xmedcon mriThruVPRO.dcm;                         # pas mieux
 477 testWrite mriThruVPRO.dcm x;
 478 v mriThruVPRO.dcm.XDCM;
 479 echo "expected : tasteless SHIT !"
 480 echo "breaks Siemens Leonardo viewer . JPEG encoding is bugged?"
 481
 482 # gdcm made Theralys image
 483 # due to H table, a SeQuence is tagged with 0 length
 484 # when using gdcmFile::WriteDcmXXX
 485 xmedcon fromTheralys.dcm; # Original breaks xmedcon
 486 testWrite fromTheralys.dcm x;
 487 v fromTheralys.dcm.XDCM; # OK
 488 xmedcon fromTheralys.dcm.XDCM; # OK