common/clitkCommon.txx

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   3   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   4   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
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   8   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
   9   PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
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  13 #ifndef CLITKCOMMON_TXX
  14 #define CLITKCOMMON_TXX
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  16 /**
  17    -------------------------------------------------
  18    * @file   clitkCommon.txx
  19    * @author David Sarrut <david.sarrut@creatis.insa-lyon.fr>
  20    * @date   18 May 2006
  21    *
  22    -------------------------------------------------*/
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  24 //--------------------------------------------------------------------
  25 // Convert float, double ... to string
  26 template<class T>
  27 std::string toString(const T & t) {
  28   std::ostringstream myStream;
  29   myStream << t << std::flush;
  30   return(myStream.str());
  31 }
  32 //--------------------------------------------------------------------
  33
  34 //--------------------------------------------------------------------
  35 // Convert float*, double* ... to string
  36 template<class T>
  37 std::string toStringVector(const T * t, const int n) {
  38   std::ostringstream myStream;
  39   for(int i=0; i<n-1; i++)
  40     myStream << clitk::toString<T>(t[i]) << " ";
  41   myStream << clitk::toString<T>(t[n-1]) << std::flush;
  42   return(myStream.str());
  43 }
  44 //--------------------------------------------------------------------
  45
  46 //--------------------------------------------------------------------
  47 // Convert float*, double* ... to string
  48 template<class T>
  49 std::string toStringVector(const T & t, const int n) {
  50   std::ostringstream myStream;
  51   for(int i=0; i<n-1; i++)
  52     myStream << t[i] << " ";
  53   myStream << t[n-1] << std::flush;
  54   return(myStream.str());
  55 }
  56 //--------------------------------------------------------------------
  57
  58 //--------------------------------------------------------------------
  59 // Convert float*, double* ... to string
  60 template<class T>
  61 std::string toStringVector(const std::vector<T> & t) {
  62   return toStringVector(&t[0], t.size());
  63 }
  64 //--------------------------------------------------------------------
  65
  66 //--------------------------------------------------------------------
  67 // Convert a pixel type to another (downcast)
  68 template<class TPixelUp, class TPixelDown>
  69 TPixelDown PixelTypeDownCast(const TPixelUp & x) {
  70   return (TPixelDown)lrint(x);
  71 }
  72 //--------------------------------------------------------------------
  73
  74 //--------------------------------------------------------------------
  75 template<class Type>
  76 struct vectorComparisonLowerThan: public std::binary_function<int, int, bool> {
  77   vectorComparisonLowerThan(const std::vector<Type> & v):vect(v) {};
  78   bool operator()(int x, int y) {
  79     return (vect[x] < vect[y]);
  80   }
  81   const std::vector<Type> & vect;
  82 };
  83 //--------------------------------------------------------------------
  84
  85 //--------------------------------------------------------------------
  86 template<class Type>
  87 struct vectorComparisonGreaterThan: public std::binary_function<int, int, bool> {
  88   vectorComparisonGreaterThan(const std::vector<Type> & v):vect(v) {};
  89   bool operator()(int x, int y) {
  90     return (vect[x] > vect[y]);
  91   }
  92   const std::vector<Type> & vect;
  93 };
  94 //--------------------------------------------------------------------
  95
  96 //--------------------------------------------------------------------
  97 template<class Type>
  98 void GetSortedIndex(const std::vector<Type> & toSort, std::vector<int> & index, bool increasing) {
  99   index.resize(toSort.size());
 100   for(unsigned int i=0; i<index.size(); i++) index[i] = i;
 101   if (increasing)
 102     std::sort(index.begin(),
 103               index.end(),
 104               vectorComparisonLowerThan<double>(toSort));
 105   else
 106     std::sort(index.begin(),
 107               index.end(),
 108               vectorComparisonGreaterThan<double>(toSort));
 109 }
 110 //--------------------------------------------------------------------
 111
 112 //--------------------------------------------------------------------
 113 template<class TPixel>
 114 std::string GetTypeAsString() {
 115   //  http://www.vtk.org/doc/release/3/html/vtkSetGet_8h-source.html
 116   // and
 117   // itkImageIOBase.cxx
 118   const std::type_info & PixType = typeid(TPixel);
 119   std::string pixelName;
 120   if (PixType == typeid(char)) pixelName = "char"; // 'plain" char is different from signed char and unsigned char ...
 121   else if (PixType == typeid(signed char)) pixelName = "signed_char";
 122   else if (PixType == typeid(unsigned char)) pixelName = "unsigned_char";
 123   else if (PixType == typeid(short)) pixelName = "short";
 124   else if (PixType == typeid(unsigned short)) pixelName = "unsigned_short";
 125   else if (PixType == typeid(int)) pixelName = "int";
 126   else if (PixType == typeid(unsigned int)) pixelName = "unsigned_int";
 127   else if (PixType == typeid(float)) pixelName = "float";
 128   else if (PixType == typeid(double)) pixelName = "double";
 129   else pixelName = PixType.name();
 130   return pixelName;
 131 }
 132 //--------------------------------------------------------------------
 133
 134 //--------------------------------------------------------------------
 135 template<class ImageType>
 136 void CloneImage(const typename ImageType::Pointer & input, typename ImageType::Pointer & output) {
 137   output->SetRegions(input->GetLargestPossibleRegion());
 138   output->SetOrigin(input->GetOrigin());
 139   output->SetSpacing(input->GetSpacing());
 140   output->Allocate();
 141   typedef itk::ImageRegionConstIterator<ImageType> ConstIteratorType;
 142   ConstIteratorType pi(input,input->GetLargestPossibleRegion());
 143   pi.GoToBegin();
 144   typedef itk::ImageRegionIterator<ImageType> IteratorType;
 145   IteratorType po(output,input->GetLargestPossibleRegion());
 146   po.GoToBegin();
 147   while (!pi.IsAtEnd()) {
 148     po.Set(pi.Get());
 149     ++pi;
 150     ++po;
 151   }
 152 }
 153 //--------------------------------------------------------------------
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 155 #endif /* end #define CLITKCOMMON_TXX */
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