common/clitkDicomRTDoseIO.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef clitkDicomRTDoseIO_h
  19 #define clitkDicomRTDoseIO_h
  20
  21 // clitk include
  22 #include "clitkCommon.h"
  23
  24 // itk include
  25 #include <itkImageIOBase.h>
  26 #include <gdcmFile.h>
  27 #if GDCM_MAJOR_VERSION >= 2
  28   #include <gdcmImageReader.h>
  29 #endif
  30
  31 // std include
  32 #include <fstream>
  33
  34 namespace clitk
  35 {
  36
  37 //====================================================================
  38 // Class for reading Vox Image file format
  39 class DicomRTDoseIO: public itk::ImageIOBase
  40 {
  41 public:
  42   /** Standard class typedefs. */
  43   typedef DicomRTDoseIO              Self;
  44   typedef itk::ImageIOBase        Superclass;
  45   typedef itk::SmartPointer<Self> Pointer;
  46   typedef signed short int        PixelType;
  47
  48   DicomRTDoseIO():Superclass() {
  49     mustWriteHeader = false;
  50 #if GDCM_MAJOR_VERSION < 2
  51     m_GdcmFile=NULL;
  52 #endif
  53   }
  54
  55   /** Method for creation through the object factory. */
  56   itkNewMacro(Self);
  57
  58   /** Run-time type information (and related methods). */
  59   itkTypeMacro(DicomRTDoseIO, ImageIOBase);
  60
  61   /*-------- This part of the interface deals with reading data. ------ */
  62   virtual void ReadImageInformation() ITK_OVERRIDE;
  63   virtual bool CanReadFile( const char* FileNameToRead ) ITK_OVERRIDE;
  64   virtual void Read(void * buffer) ITK_OVERRIDE;
  65
  66   /*-------- This part of the interfaces deals with writing data. ----- */
  67   virtual void WriteImageInformation(bool keepOfStream);
  68   virtual void WriteImageInformation() ITK_OVERRIDE {
  69     WriteImageInformation(false);
  70   }
  71   virtual bool CanWriteFile(const char* filename) ITK_OVERRIDE;
  72   virtual void Write(const void* buffer) ITK_OVERRIDE;
  73
  74 protected:
  75   template <class T> void dose_copy_raw (float *img_out, T *img_in, int nvox, float scale);
  76
  77   bool mustWriteHeader;
  78   int m_HeaderSize;
  79   std::ofstream file;
  80 #if GDCM_MAJOR_VERSION >= 2
  81   gdcm::ImageReader m_GdcmImageReader;
  82 #else
  83   gdcm::File *m_GdcmFile;
  84 #endif
  85   float m_DoseScaling;
  86 }; // end class DicomRTDoseIO
  87
  88 } // end namespace
  89
  90 #endif /* end #define clitkDicomRTDoseIO_h */
  91