common/clitkDicomRT_StructureSet.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:         vv http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3   Main authors :   XX XX XX
   4
   5   Authors belongs to:
   6   - University of LYON           http://www.universite-lyon.fr/
   7   - Léon Bérard cancer center    http://www.centreleonberard.fr
   8   - CREATIS CNRS laboratory      http://www.creatis.insa-lyon.fr
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  13
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  17
  18   =========================================================================*/
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  20 #ifndef CLITKDICOMRT_STRUCTURESET_H
  21 #define CLITKDICOMRT_STRUCTURESET_H
  22
  23 // clitk
  24 #include "clitkCommon.h"
  25 #include "clitkDicomRT_ROI.h"
  26
  27 // vv
  28 #include "vvImage.h"
  29
  30 // gdcm
  31 #if GDCM_MAJOR_VERSION == 2
  32 #include "gdcmReader.h"
  33 #include "gdcmWriter.h"
  34 #include "gdcmAttribute.h"
  35 #endif
  36
  37 namespace clitk {
  38
  39 //--------------------------------------------------------------------
  40 class DicomRT_StructureSet : public itk::LightObject{
  41
  42 public:
  43   typedef DicomRT_StructureSet Self;
  44   typedef itk::SmartPointer<Self> Pointer;
  45   itkNewMacro(Self);
  46
  47   typedef std::map<int, clitk::DicomRT_ROI::Pointer>::iterator ROIIteratorType;
  48   typedef std::map<int, clitk::DicomRT_ROI::Pointer>::const_iterator ROIConstIteratorType;
  49
  50   void Print(std::ostream & os = std::cout) const;
  51   void Read(const std::string & filename);
  52   bool IsDicomRTStruct(const std::string & filename);
  53   void Write(const std::string & filename);
  54
  55   clitk::DicomRT_ROI * GetROIFromROINumber(int n);
  56   std::map<int, clitk::DicomRT_ROI::Pointer> & GetROIs() { return mROIs; }
  57   const std::string & GetStudyID() const;
  58   const std::string & GetStudyTime() const;
  59   const std::string & GetStudyDate() const;
  60   const std::string & GetLabel() const;
  61   const std::string & GetName() const;
  62   const std::string & GetDate() const;
  63   const std::string & GetTime() const;
  64
  65   int AddBinaryImageAsNewROI(vvImage * i, std::string name);
  66
  67 #if GDCM_MAJOR_VERSION == 2
  68   // Static
  69   static int ReadROINumber(const gdcm::Item & item);
  70 #endif
  71
  72 protected:
  73   std::string mStudyID;
  74   std::string mStudyTime;
  75   std::string mStudyDate;
  76   std::string mLabel;
  77   std::string mName;
  78   std::string mDate;
  79   std::string mTime;
  80
  81   std::map<int, clitk::DicomRT_ROI::Pointer> mROIs;
  82   std::map<int, std::string> mMapOfROIName;
  83 #if GDCM_MAJOR_VERSION == 2
  84   gdcm::Reader * mReader;
  85   gdcm::SmartPointer<gdcm::SequenceOfItems> mROIInfoSequenceOfItems;
  86   gdcm::SmartPointer<gdcm::SequenceOfItems> mROIContoursSequenceOfItems;
  87 #endif
  88   gdcm::File * mFile;
  89
  90 private:
  91   DicomRT_StructureSet();
  92   ~DicomRT_StructureSet();
  93 };
  94 //--------------------------------------------------------------------
  95
  96 } // end namespace clitk
  97 #endif // CLITKDICOMRT_STRUCTURESET_H
  98