common/clitkHndImageIO.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ======================================================================-====*/
  18 #ifndef CLITKHNDIMAGEIO_H
  19 #define CLITKHNDIMAGEIO_H
  20
  21 // itk include
  22 #include "itkImageIOBase.h"
  23
  24 #if defined (_MSC_VER) && (_MSC_VER < 1600)
  25 //SR: taken from
  26 //#include "msinttypes/stdint.h"
  27 typedef unsigned int uint32_t;
  28 #else
  29 #include <stdint.h>
  30 #endif
  31
  32 namespace clitk {
  33
  34   //====================================================================
  35   // Class for reading Hnd Image file format
  36   class HndImageIO: public itk::ImageIOBase
  37   {
  38   public:
  39         /** Standard class typedefs. */
  40   typedef HndImageIO              Self;
  41         typedef itk::ImageIOBase        Superclass;
  42         typedef itk::SmartPointer<Self> Pointer;
  43         typedef signed short int        PixelType;
  44
  45   typedef struct hnd_header {
  46       char sFileType[32];
  47       uint32_t FileLength;
  48       char sChecksumSpec[4];
  49       uint32_t nCheckSum;
  50       char sCreationDate[8];
  51       char sCreationTime[8];
  52       char sPatientID[16];
  53       uint32_t nPatientSer;
  54       char sSeriesID[16];
  55       uint32_t nSeriesSer;
  56       char sSliceID[16];
  57       uint32_t nSliceSer;
  58       uint32_t SizeX;
  59       uint32_t SizeY;
  60       double dSliceZPos;
  61       char sModality[16];
  62       uint32_t nWindow;
  63       uint32_t nLevel;
  64       uint32_t nPixelOffset;
  65       char sImageType[4];
  66       double dGantryRtn;
  67       double dSAD;
  68       double dSFD;
  69       double dCollX1;
  70       double dCollX2;
  71       double dCollY1;
  72       double dCollY2;
  73       double dCollRtn;
  74       double dFieldX;
  75       double dFieldY;
  76       double dBladeX1;
  77       double dBladeX2;
  78       double dBladeY1;
  79       double dBladeY2;
  80       double dIDUPosLng;
  81       double dIDUPosLat;
  82       double dIDUPosVrt;
  83       double dIDUPosRtn;
  84       double dPatientSupportAngle;
  85       double dTableTopEccentricAngle;
  86       double dCouchVrt;
  87       double dCouchLng;
  88       double dCouchLat;
  89       double dIDUResolutionX;
  90       double dIDUResolutionY;
  91       double dImageResolutionX;
  92       double dImageResolutionY;
  93       double dEnergy;
  94       double dDoseRate;
  95       double dXRayKV;
  96       double dXRayMA;
  97       double dMetersetExposure;
  98       double dAcqAdjustment;
  99       double dCTProjectionAngle;
 100       double dCTNormChamber;
 101       double dGatingTimeTag;
 102       double dGating4DInfoX;
 103       double dGating4DInfoY;
 104       double dGating4DInfoZ;
 105       double dGating4DInfoTime;
 106   } Hnd_header;
 107
 108   HndImageIO():Superclass() {;}
 109
 110         /** Method for creation through the object factory. */
 111         itkNewMacro(Self);
 112
 113         /** Run-time type information (and related methods). */
 114   itkTypeMacro(HndImageIO, ImageIOBase);
 115
 116         /*-------- This part of the interface deals with reading data. ------ */
 117         virtual void ReadImageInformation();
 118         virtual bool CanReadFile( const char* FileNameToRead );
 119         virtual void Read(void * buffer);
 120
 121         /*-------- This part of the interfaces deals with writing data. ----- */
 122         virtual void WriteImageInformation(bool keepOfStream) { ; }
 123         virtual void WriteImageInformation() { WriteImageInformation(false); }
 124         virtual bool CanWriteFile(const char* filename);
 125         virtual void Write(const void* buffer);
 126
 127   protected:
 128         int m_HeaderSize;
 129
 130   }; // end class HndImageIO
 131 } // end namespace
 132
 133 // explicit template instantiation
 134 //template class itk::CreateObjectFunction<clitk::HndImageIO>;
 135
 136 #endif /* end #define CLITKHNDIMAGEIO_H */
 137