common/clitkImage2DicomRTStructFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:         vv http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3   Main authors :   XX XX XX
   4
   5   Authors belongs to:
   6   - University of LYON           http://www.universite-lyon.fr/
   7   - Léon Bérard cancer center    http://www.centreleonberard.fr
   8   - CREATIS CNRS laboratory      http://www.creatis.insa-lyon.fr
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  15   - BSD       http://www.opensource.org/licenses/bsd-license.php
  16   - CeCILL-B  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
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  18   =========================================================================*/
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  20 #ifndef CLITKIMAGE2DICOMRTSTRUCTFILTER_H
  21 #define CLITKIMAGE2DICOMRTSTRUCTFILTER_H
  22
  23 // clitk
  24 #include "clitkDicomRT_ROI.h"
  25 #include "clitkImageCommon.h"
  26 #include "clitkFilterBase.h"
  27 #include "clitkDicomRT_StructureSet.h"
  28
  29 namespace clitk {
  30
  31   //--------------------------------------------------------------------
  32   template<class PixelType>
  33   class Image2DicomRTStructFilter: public clitk::FilterBase {
  34
  35   public:
  36     Image2DicomRTStructFilter();
  37     ~Image2DicomRTStructFilter();
  38
  39     typedef itk::Image<PixelType, 3> ImageType;
  40     typedef typename ImageType::Pointer ImagePointer;
  41     typedef typename clitk::DicomRT_StructureSet::Pointer DicomRTStructPointer;
  42
  43     // Set inputs
  44     virtual void SetInputFilenames (const std::vector<std::string> _arg)
  45     {
  46       if ( this->m_InputFilenames != _arg )
  47       {
  48         this->m_InputFilenames = _arg;
  49         this->Modified();
  50       }
  51     }
  52     itkSetMacro(StructureSetFilename, std::string);
  53     itkSetMacro(DicomFolder, std::string);
  54     itkSetMacro(OutputFilename, std::string);
  55     void SetROIType(std::string type);
  56     itkSetMacro(ThresholdValue, PixelType);
  57     itkSetMacro(SkipInitialStructuresFlag, bool);
  58
  59     // Run filter
  60     void Update();
  61
  62   protected:
  63     std::string m_StructureSetFilename;
  64     std::string m_DicomFolder;
  65     std::string m_OutputFilename;
  66     std::string m_ROIType;
  67     PixelType m_ThresholdValue;
  68     std::vector<std::string> m_InputFilenames;
  69     bool m_SkipInitialStructuresFlag;
  70   };
  71   //--------------------------------------------------------------------
  72
  73 } // end namespace clitk
  74
  75 #include "clitkImage2DicomRTStructFilter.txx"
  76
  77 #endif // CLITKIMAGE2DICOMRTSTRUCTFILTER_H
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