common/clitkImage2DicomRTStructFilter.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:         vv http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3   Main authors :   XX XX XX
   4
   5   Authors belongs to:
   6   - University of LYON           http://www.universite-lyon.fr/
   7   - Léon Bérard cancer center    http://www.centreleonberard.fr
   8   - CREATIS CNRS laboratory      http://www.creatis.insa-lyon.fr
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  11   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
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  15   - BSD       http://www.opensource.org/licenses/bsd-license.php
  16   - CeCILL-B  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
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  18   =========================================================================*/
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  20 #ifndef CLITKIMAGE2DICOMRTSTRUCTFILTER_H
  21 #define CLITKIMAGE2DICOMRTSTRUCTFILTER_H
  22
  23 // clitk
  24 #include "clitkDicomRT_ROI.h"
  25 #include "clitkImageCommon.h"
  26 #include "clitkFilterBase.h"
  27 #include "clitkDicomRT_StructureSet.h"
  28
  29 namespace clitk {
  30
  31   //--------------------------------------------------------------------
  32   template<class PixelType>
  33   class Image2DicomRTStructFilter: public clitk::FilterBase {
  34
  35   public:
  36     Image2DicomRTStructFilter();
  37     ~Image2DicomRTStructFilter();
  38
  39     typedef itk::Image<PixelType, 3> ImageType;
  40     typedef typename ImageType::Pointer ImagePointer;
  41     typedef typename clitk::DicomRT_StructureSet::Pointer DicomRTStructPointer;
  42
  43     // Set inputs
  44     itkSetMacro(InputFilenames, std::vector<std::string> );
  45     itkSetMacro(StructureSetFilename, std::string);
  46     itkSetMacro(DicomFolder, std::string);
  47     itkSetMacro(OutputFilename, std::string);
  48     void SetROIType(std::string type);
  49     itkSetMacro(ThresholdValue, PixelType);
  50     itkSetMacro(SkipInitialStructuresFlag, bool);
  51
  52     // Run filter
  53     void Update();
  54
  55   protected:
  56     std::string m_StructureSetFilename;
  57     std::string m_DicomFolder;
  58     std::string m_OutputFilename;
  59     std::string m_ROIType;
  60     PixelType m_ThresholdValue;
  61     std::vector<std::string> m_InputFilenames;
  62     bool m_SkipInitialStructuresFlag;
  63   };
  64   //--------------------------------------------------------------------
  65
  66 } // end namespace clitk
  67
  68 #include "clitkImage2DicomRTStructFilter.txx"
  69
  70 #endif // CLITKIMAGE2DICOMRTSTRUCTFILTER_H
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