common/old/clitkIOCommon.txx

   1 #ifndef CLITKIOCOMMON_TXX
   2 #define CLITKIOCOMMON_TXX
   3 /**
   4    =================================================
   5    * @file   clitkIOCommon.txx
   6    * @author David Sarrut <david.sarrut@creatis.insa-lyon.fr>
   7    * @date   04 Jul 2006 08:34:11
   8    *
   9    * @brief
  10    *
  11    *
  12    =================================================*/
  13
  14 //====================================================================
  15 // To short the code for reading an image
  16 template<typename ImageType>
  17 typename ImageType::Pointer readImage(const std::string & filename, const bool verbose) {
  18   typedef itk::ImageFileReader<ImageType> ReaderType;
  19   typename ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();
  20   reader->SetFileName(filename.c_str());
  21   if (verbose) {
  22     std::cout << "Reading " << filename << " ..." << std::endl;
  23   }
  24   try {
  25     reader->Update();
  26   }
  27   catch( itk::ExceptionObject & err ) {
  28     std::cerr << "Error while reading " << filename
  29               << " " << err << std::endl;
  30     exit(0);
  31   }
  32   return reader->GetOutput();
  33 }
  34 //====================================================================
  35
  36 //====================================================================
  37 // To short the code for reading an image from several files
  38 template<typename ImageType>
  39 typename ImageType::Pointer readImage(const std::vector<std::string> & filenames,
  40                                       const bool verbose) {
  41   if (filenames.size() == 1) return readImage<ImageType>(filenames[0], verbose);
  42   typedef itk::ImageSeriesReader<ImageType> ReaderType;
  43   typename ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();
  44   reader->SetFileNames(filenames);
  45   if (verbose) {
  46     std::cout << "Reading " << filenames[0] << " and others ..." << std::endl;
  47   }
  48   try {
  49     reader->Update();
  50   }
  51   catch( itk::ExceptionObject & err ) {
  52     std::cerr << "Error while reading " << filenames[0]
  53               << " or other files ..." << err << std::endl;
  54     exit(0);
  55   }
  56   return reader->GetOutput();
  57 }
  58 //====================================================================
  59
  60 //====================================================================
  61 // To short the code for writing an image
  62 template<typename ImageType>
  63 void writeImage(const typename ImageType::Pointer image,
  64                 const std::string & filename,
  65                 const bool verbose) {
  66   typedef itk::ImageFileWriter<ImageType> WriterType;
  67   typename WriterType::Pointer writer = WriterType::New();
  68   writer->SetFileName(filename.c_str());
  69   writer->SetInput(image);
  70   if (verbose) {
  71     std::cout << "Writing " << filename << "." << std::endl;
  72   }
  73   try {
  74     writer->Update();
  75   }
  76   catch( itk::ExceptionObject & err ) {
  77     std::cerr << "Error while writing " << filename
  78               << ", the error is : " << err << std::endl;
  79     exit(0);
  80   }
  81 }
  82 //====================================================================
  83
  84 #endif /* end #define CLITKIOCOMMON_TXX */
  85