common/vvImageReader.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef vvImageReader_H
  19 #define vvImageReader_H
  20 #include <string>
  21 #include <vector>
  22
  23 #include "itkCommand.h"
  24 #include "vvImage.h"
  25
  26 class vvImageReader : public itk::LightObject {
  27
  28 public:
  29   //Image types
  30   typedef enum _IMAGETYPE {
  31   IMAGE = 20,
  32   DICOM,
  33   MERGED,
  34   SLICED,
  35   IMAGEWITHTIME,
  36   MERGEDWITHTIME,
  37   VECTORFIELD,
  38   VECTORFIELDWITHTIME,
  39   VECTORPIXELIMAGE,
  40   VECTORPIXELIMAGEWITHTIME,
  41   UNDEFINEDIMAGETYPE
  42   } LoadedImageType;
  43
  44   typedef vvImageReader Self;
  45   typedef itk::SmartPointer<Self> Pointer;
  46   itkNewMacro(Self);
  47
  48   const std::vector<std::string>& GetInputFilenames(){return mInputFilenames;}
  49
  50   void SetInputFilename(const std::string & filename);
  51   void SetInputFilenames(const std::vector<std::string> & filenames);
  52
  53   vvImage::Pointer GetOutput() {
  54       return mImage;
  55   }
  56
  57   std::string GetLastError() {
  58       return mLastError;
  59   }
  60
  61   void SetSlice(unsigned int i) { mSlice = i; }
  62   void SetPatientCoordinateSystem(bool patientCoordinateSystem);
  63
  64   //====================================================================
  65   // Main function
  66   void Update();
  67   void Update(LoadedImageType type);
  68   void Update(int dim, std::string InputPixelType, LoadedImageType type);
  69
  70 protected:
  71   //====================================================================
  72   std::vector<std::string> mInputFilenames;
  73   ///Method used to load the image, see vvConstants.h for definition
  74   LoadedImageType mType;
  75   unsigned int mSlice;
  76   itk::Command::Pointer mObserver;
  77
  78   std::string mLastError;
  79
  80   //====================================================================
  81   template<unsigned int VImageDimension>
  82   void UpdateWithDim(std::string inputPixelType);
  83
  84   //====================================================================
  85   /*template<unsigned int VImageDimension>
  86   void ExtractWithDim(std::string inputPixelType, int slice);*/
  87
  88   //====================================================================
  89   template<class InputPixelType, unsigned int VImageDimension>
  90   void UpdateWithDimAndInputPixelType();
  91   template<class InputPixelType, unsigned int VImageDimension>
  92   void UpdateWithDimAndInputVectorPixelType();
  93   ///Input dimension and pixel type
  94   int mDim;
  95   bool mPatientCoordinateSystem;
  96   std::string mInputPixelType;
  97
  98   //====================================================================
  99 //  void ReadNkiImageTransform();
 100   void ReadMatImageTransform();
 101 private:
 102   vvImageReader();
 103   ~vvImageReader();
 104
 105   vvImage::Pointer mImage;
 106 }; // end class vvImageReader
 107
 108 #endif /* end #define CLITKvvImageReader_H */
 109