common/vvImageReader.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef vvImageReader_H
  19 #define vvImageReader_H
  20 #include <string>
  21 #include <vector>
  22
  23 #include "itkCommand.h"
  24 #include "vvImage.h"
  25
  26 class vvImageReader : public itk::LightObject {
  27
  28 public:
  29   //Image types
  30   typedef enum _IMAGETYPE {
  31   IMAGE = 20,
  32   DICOM,
  33   MERGED,
  34   SLICED,
  35   IMAGEWITHTIME,
  36   MERGEDWITHTIME,
  37   VECTORFIELD,
  38   VECTORFIELDWITHTIME,
  39   UNDEFINEDIMAGETYPE
  40   } LoadedImageType;
  41
  42   typedef vvImageReader Self;
  43   typedef itk::SmartPointer<Self> Pointer;
  44   itkNewMacro(Self);
  45
  46   const std::vector<std::string>& GetInputFilenames(){return mInputFilenames;}
  47
  48   void SetInputFilename(const std::string & filename);
  49   void SetInputFilenames(const std::vector<std::string> & filenames);
  50
  51   vvImage::Pointer GetOutput() {
  52       return mImage;
  53   }
  54
  55   std::string GetLastError() {
  56       return mLastError;
  57   }
  58
  59   void SetSlice(unsigned int i) { mSlice = i; }
  60
  61   //====================================================================
  62   // Main function
  63   void Update();
  64   void Update(LoadedImageType type);
  65   void Update(int dim, std::string InputPixelType, LoadedImageType type);
  66
  67 protected:
  68   //====================================================================
  69   std::vector<std::string> mInputFilenames;
  70   ///Method used to load the image, see vvConstants.h for definition
  71   LoadedImageType mType;
  72   unsigned int mSlice;
  73   itk::Command::Pointer mObserver;
  74
  75   std::string mLastError;
  76
  77   //====================================================================
  78   template<unsigned int VImageDimension>
  79   void UpdateWithDim(std::string inputPixelType);
  80
  81   //====================================================================
  82   /*template<unsigned int VImageDimension>
  83   void ExtractWithDim(std::string inputPixelType, int slice);*/
  84
  85   //====================================================================
  86   template<class InputPixelType, unsigned int VImageDimension>
  87   void UpdateWithDimAndInputPixelType();
  88   template<class InputPixelType, unsigned int VImageDimension>
  89   void UpdateWithDimAndInputVectorPixelType();
  90   ///Input dimension and pixel type
  91   int mDim;
  92   std::string mInputPixelType;
  93
  94   //====================================================================
  95   void ReadNkiImageTransform();
  96   void ReadMatImageTransform();
  97 private:
  98   vvImageReader();
  99   ~vvImageReader();
 100
 101   vvImage::Pointer mImage;
 102 }; // end class vvImageReader
 103
 104 #endif /* end #define CLITKvvImageReader_H */
 105