gdcmPython/gdcm.i

   1 %module gdcm
   2 #pragma SWIG nowarn=504
   3 %{
   4 #include <iostream>
   5
   6 #include "gdcmCommon.h"
   7 #include "gdcmBase.h"
   8 #include "gdcmRefCounter.h"
   9 #include "gdcmTagKey.h"
  10 #include "gdcmVRKey.h"
  11 #include "gdcmDict.h"
  12 #include "gdcmDicomEntry.h"
  13 #include "gdcmDictEntry.h"
  14 #include "gdcmDictSet.h"
  15 #include "gdcmDicomDir.h"
  16 #include "gdcmDicomDirElement.h"
  17 #include "gdcmDicomDirImage.h"
  18 #include "gdcmDicomDirMeta.h"
  19 #include "gdcmDicomDirObject.h"
  20 #include "gdcmDicomDirPatient.h"
  21 #include "gdcmDicomDirStudy.h"
  22 #include "gdcmDicomDirSerie.h"
  23 #include "gdcmDocEntrySet.h"
  24 #include "gdcmDocument.h"
  25 #include "gdcmElementSet.h"
  26 #include "gdcmFileHelper.h"
  27 #include "gdcmGlobal.h"
  28 #include "gdcmFile.h"
  29 #include "gdcmSerieHelper.h"
  30 #include "gdcmRLEFramesInfo.h"
  31 #include "gdcmJPEGFragmentsInfo.h"
  32 #include "gdcmSQItem.h"
  33 #include "gdcmUtil.h"
  34 #include "gdcmDocEntry.h"
  35 #include "gdcmDataEntry.h"
  36 #include "gdcmSeqEntry.h"
  37 #include "gdcmVR.h"
  38 #include "gdcmTS.h"
  39 #include "gdcmDictGroupName.h"
  40
  41 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  42 /// Refer (below) to the definition of multi-argument typemap
  43 ///   %typemap(python, in)
  44 ///      ( gdcm::DicomDir::Method*, void*, gdcm::DicomDir::Method*)
  45 /// for detail on gdcmPythonVoidFunc() and gdcmPythonVoidFuncArgDelete().
  46 void gdcmPythonVoidFunc(void *arg)
  47 {
  48    PyObject *arglist, *result;
  49    PyObject *func = (PyObject *)arg;
  50
  51    arglist = Py_BuildValue("()");
  52
  53    result = PyEval_CallObject(func, arglist);
  54    Py_DECREF(arglist);
  55
  56    if (result)
  57    {
  58       Py_XDECREF(result);
  59    }
  60    else
  61    {
  62       if (PyErr_ExceptionMatches(PyExc_KeyboardInterrupt))
  63       {
  64          std::cerr << "Caught a Ctrl-C within python, exiting program.\n";
  65          Py_Exit(1);
  66       }
  67       PyErr_Print();
  68    }
  69 }
  70
  71 void gdcmPythonVoidFuncArgDelete(void *arg)
  72 {
  73    PyObject *func = (PyObject *)arg;
  74    if (func)
  75    {
  76       Py_DECREF(func);
  77    }
  78 }
  79
  80 /// This is required in order to avoid %including all the gdcm include files.
  81 using namespace gdcm;
  82 %}
  83
  84
  85 ///////////////////////  typemap section  ////////////////////////////////////
  86
  87 ////////////////////////////////////////////////
  88 // Redefine all types used
  89 typedef char int8_t;
  90 typedef unsigned char uint8_t;
  91 typedef short int16_t;
  92 typedef unsigned short uint16_t;
  93 typedef int int32_t;
  94 typedef unsigned int uint32_t;
  95 typedef long long int64_t;
  96 typedef unsigned long long uint64_t;
  97
  98 ////////////////////////////////////////////////
  99 // Convert a DocEntry * to the real derived class
 100 %typemap(out) gdcm::DocEntry *
 101 {
 102    PyObject *newEntry;
 103
 104    if($1)
 105    {
 106       if(dynamic_cast<SeqEntry *>($1)) // SeqEntry *
 107          newEntry = SWIG_NewPointerObj($1,SWIGTYPE_p_gdcm__SeqEntry,0);
 108       else if(dynamic_cast<DataEntry *>($1)) // DataEntry *
 109          newEntry = SWIG_NewPointerObj($1,SWIGTYPE_p_gdcm__DataEntry,0);
 110       else
 111          newEntry = NULL;
 112    }
 113    else
 114    {
 115       newEntry = Py_BuildValue("");
 116    }
 117    $result = newEntry;
 118 }
 119
 120 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 121 // Multi-argument typemap designed for wrapping the progress related methods
 122 // in order to control from an external application the computation of
 123 // a DicomDir object (see DicomDir::SetStartMethod*,
 124 // DicomDir::SetProgressMethod* and DicomDir::SetEndMethod*).
 125 // Motivation: since DicomDir parsing can be quite long, a GUI application
 126 //             needs to display the avancement and potentially offer a
 127 //             cancel method to the user (when this one feels things are
 128 //             longer than expected).
 129 // Example of usage: refer to demo/DicomDirProgressMethod.py
 130 // Note: Uses gdcmPythonVoidFunc and gdcmPythonVoidFuncArgDelete defined
 131 //       in the Swig verbatim section of this gdcm.i i.e. in the above section
 132 //       enclosed within the %{ ... %} scope operator ).
 133 %typemap(python, in) (void(*method)(void *),void *arg,void(*argDelete)(void *))
 134 {
 135         if($input!=Py_None)
 136         {
 137                 Py_INCREF($input);
 138                 $1=gdcmPythonVoidFunc;
 139                 $2=$input;
 140                 $3=gdcmPythonVoidFuncArgDelete;
 141         }
 142         else
 143         {
 144                 $1=NULL;
 145                 $2=NULL;
 146                 $3=NULL;
 147         }
 148 }
 149
 150 ////////////////////  STL string versus Python str  ////////////////////////
 151 // Convertion returning a C++ string.
 152 %typemap(out) std::string
 153 {
 154     $result = PyString_FromString(($1).c_str());
 155 }
 156
 157 %typemap(out) string
 158 {
 159     $result = PyString_FromString(($1).c_str());
 160 }
 161
 162 %typemap(out) std::string const &
 163 {
 164     $result = PyString_FromString(($1)->c_str());
 165 }
 166
 167 // Convertion of incoming Python str to STL string
 168 %typemap(python, in) const std::string, std::string
 169 {
 170   $1 = PyString_AsString($input);
 171 }
 172
 173 // Same convertion as above but references (since swig converts C++
 174 // refererences to pointers)
 175 %typemap(python, in) std::string const &
 176 {
 177    $1 = new std::string( PyString_AsString( $input ) );
 178 }
 179
 180 ////////////////////  gdcm.TagName versus Python str  //////////////////////
 181 %typemap(out) gdcm::TagName, const gdcm::TagName &
 182 {
 183     $result = PyString_FromString(($1)->c_str());
 184 }
 185
 186 // Convertion of incoming Python str to STL string
 187 %typemap(python, in) const gdcm::TagName, gdcm::TagName
 188 {
 189   $1 = PyString_AsString($input);
 190 }
 191
 192 // Same convertion as above but references (since swig converts C++
 193 // refererences to pointers)
 194 %typemap(python, in) gdcm::TagName const &
 195 {
 196    $1 = new std::string( PyString_AsString( $input ) );
 197 }
 198
 199 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 200 // Because overloading and %rename don't work together (see below Note 1)
 201 // we need to ignore some methods (e.g. the overloaded default constructor).
 202 // The gdcm::File class doesn't have any SetFilename method anyhow, and
 203 // this constructor is only used internaly (not from the API) so this is
 204 // not a big loss.
 205 %ignore gdcm::binary_write(std::ostream &,uint32_t const &);
 206 %ignore gdcm::binary_write(std::ostream &,uint16_t const &);
 207
 208 %ignore gdcm::VRKey::operator=(const VRKey &_val);
 209 %ignore gdcm::VRKey::operator=(const std::string &_val);
 210 %ignore gdcm::VRKey::operator=(const char *_val);
 211 %ignore gdcm::VRKey::operator[](const unsigned int &_id) const;
 212 %ignore gdcm::VRKey::operator[](const unsigned int &_id);
 213
 214 %ignore gdcm::TagKey::operator=(const TagKey &_val);
 215 %ignore gdcm::TagKey::operator[](const unsigned int &_id) const;
 216 %ignore gdcm::TagKey::operator[](const unsigned int &_id);
 217
 218 %ignore gdcm::DicomDir::SetStartMethod(DicomDir::Method *method,void *arg = NULL);
 219 %ignore gdcm::DicomDir::SetProgressMethod(DicomDir::Method *method,void *arg = NULL);
 220 %ignore gdcm::DicomDir::SetEndMethod(DicomDir::Method *method,void *arg = NULL);
 221
 222 // Ignore all placed in gdcmCommon.h
 223 %ignore GDCM_UNKNOWN;
 224 %ignore GDCM_UNFOUND;
 225 %ignore GDCM_BINLOADED;
 226 %ignore GDCM_NOTLOADED;
 227 %ignore GDCM_UNREAD;
 228 %ignore GDCM_NOTASCII;
 229 %ignore GDCM_PIXELDATA;
 230 %ignore GDCM_LEGACY;
 231 %ignore GDCM_VRUNKNOWN;
 232
 233 %constant const char *UNKNOWN        = "gdcm::Unknown";
 234 %constant const char *UNFOUND        = "gdcm::Unfound";
 235 %constant const char *BINLOADED      = "gdcm::Binary data loaded";
 236 %constant const char *NOTLOADED      = "gdcm::NotLoaded";
 237 %constant const char *UNREAD         = "gdcm::UnRead";
 238 %constant const char *GDCM_NOTASCII  = "gdcm::NotAscii";
 239 %constant const char *GDCM_PIXELDATA = "gdcm::Pixel Data to be loaded";
 240 %constant const char *VRUNKNOWN      = "  ";
 241
 242 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 243 // Warning: Order matters !
 244 %include "gdcmCommon.h"
 245 %include "gdcmBase.h"
 246 %include "gdcmRefCounter.h"
 247 %include "gdcmTagKey.h"
 248 %include "gdcmVRKey.h"
 249 %include "gdcmDicomEntry.h"
 250 %include "gdcmDictEntry.h"
 251 %include "gdcmDict.h"
 252 %include "gdcmDictSet.h"
 253 %include "gdcmDocEntrySet.h"
 254 %include "gdcmElementSet.h"
 255 %include "gdcmSQItem.h"
 256 %include "gdcmDicomDirElement.h"
 257 %include "gdcmDicomDirObject.h"
 258 %include "gdcmDicomDirImage.h"
 259 %include "gdcmDicomDirSerie.h"
 260 %include "gdcmDicomDirStudy.h"
 261 %include "gdcmDicomDirPatient.h"
 262 %include "gdcmDicomDirMeta.h"
 263 %include "gdcmDocument.h"
 264 %include "gdcmFile.h"
 265 %include "gdcmSerieHelper.h"
 266 %include "gdcmFileHelper.h"
 267 %include "gdcmUtil.h"
 268 %include "gdcmGlobal.h"
 269 %include "gdcmDicomDir.h"
 270 %include "gdcmDocEntry.h"
 271 %include "gdcmDataEntry.h"
 272 %include "gdcmSeqEntry.h"
 273 %include "gdcmVR.h"
 274 %include "gdcmTS.h"
 275 %include "gdcmDictGroupName.h"