gdcmPython/gdcm.i

   1 %module gdcm
   2 #pragma SWIG nowarn=504
   3 %{
   4 #include <iostream>
   5
   6 #include "gdcmCommon.h"
   7 #include "gdcmBase.h"
   8 #include "gdcmDict.h"
   9 #include "gdcmDictEntry.h"
  10 #include "gdcmDictSet.h"
  11 #include "gdcmDicomDir.h"
  12 #include "gdcmDicomDirElement.h"
  13 #include "gdcmDicomDirImage.h"
  14 #include "gdcmDicomDirMeta.h"
  15 #include "gdcmDicomDirObject.h"
  16 #include "gdcmDicomDirPatient.h"
  17 #include "gdcmDicomDirStudy.h"
  18 #include "gdcmDicomDirSerie.h"
  19 #include "gdcmDocEntrySet.h"
  20 #include "gdcmDocument.h"
  21 #include "gdcmElementSet.h"
  22 #include "gdcmFileHelper.h"
  23 #include "gdcmGlobal.h"
  24 #include "gdcmFile.h"
  25 #include "gdcmSerieHelper.h"
  26 #include "gdcmRLEFramesInfo.h"
  27 #include "gdcmJPEGFragmentsInfo.h"
  28 #include "gdcmSQItem.h"
  29 #include "gdcmUtil.h"
  30 #include "gdcmDocEntry.h"
  31 #include "gdcmContentEntry.h"
  32 #include "gdcmValEntry.h"
  33 #include "gdcmBinEntry.h"
  34 #include "gdcmSeqEntry.h"
  35 #include "gdcmVR.h"
  36 #include "gdcmTS.h"
  37 #include "gdcmDictGroupName.h"
  38
  39 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  40 /// Refer (below) to the definition of multi-argument typemap
  41 ///   %typemap(python, in)
  42 ///      ( gdcm::DicomDir::Method*, void*, gdcm::DicomDir::Method*)
  43 /// for detail on gdcmPythonVoidFunc() and gdcmPythonVoidFuncArgDelete().
  44 void gdcmPythonVoidFunc(void *arg)
  45 {
  46    PyObject *arglist, *result;
  47    PyObject *func = (PyObject *)arg;
  48
  49    arglist = Py_BuildValue("()");
  50
  51    result = PyEval_CallObject(func, arglist);
  52    Py_DECREF(arglist);
  53
  54    if (result)
  55    {
  56       Py_XDECREF(result);
  57    }
  58    else
  59    {
  60       if (PyErr_ExceptionMatches(PyExc_KeyboardInterrupt))
  61       {
  62          std::cerr << "Caught a Ctrl-C within python, exiting program.\n";
  63          Py_Exit(1);
  64       }
  65       PyErr_Print();
  66    }
  67 }
  68
  69 void gdcmPythonVoidFuncArgDelete(void *arg)
  70 {
  71    PyObject *func = (PyObject *)arg;
  72    if (func)
  73    {
  74       Py_DECREF(func);
  75    }
  76 }
  77
  78 /// This is required in order to avoid %including all the gdcm include files.
  79 using namespace gdcm;
  80 %}
  81
  82
  83 ///////////////////////  typemap section  ////////////////////////////////////
  84
  85 ////////////////////////////////////////////////
  86 // Redefine all types used
  87 typedef char int8_t;
  88 typedef unsigned char uint8_t;
  89 typedef short int16_t;
  90 typedef unsigned short uint16_t;
  91 typedef int int32_t;
  92 typedef unsigned int uint32_t;
  93 typedef long long int64_t;
  94 typedef unsigned long long uint64_t;
  95
  96 ////////////////////////////////////////////////
  97 // Convert a DocEntry * to the real derived class
  98 %typemap(out) gdcm::DocEntry *
  99 {
 100    PyObject *newEntry;
 101
 102    if($1)
 103    {
 104       if(dynamic_cast<SeqEntry *>($1)) // SeqEntry *
 105          newEntry = SWIG_NewPointerObj($1,SWIGTYPE_p_gdcm__SeqEntry,0);
 106       else if(dynamic_cast<BinEntry *>($1)) // BinEntry *
 107          newEntry = SWIG_NewPointerObj($1,SWIGTYPE_p_gdcm__BinEntry,0);
 108       else // ValEntry *
 109          newEntry = SWIG_NewPointerObj($1,SWIGTYPE_p_gdcm__ValEntry,0);
 110    }
 111    else
 112    {
 113       newEntry = Py_BuildValue("");
 114    }
 115    $result = newEntry;
 116 }
 117
 118 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 119 // Multi-argument typemap designed for wrapping the progress related methods
 120 // in order to control from an external application the computation of
 121 // a DicomDir object (see DicomDir::SetStartMethod*,
 122 // DicomDir::SetProgressMethod* and DicomDir::SetEndMethod*).
 123 // Motivation: since DicomDir parsing can be quite long, a GUI application
 124 //             needs to display the avancement and potentially offer a
 125 //             cancel method to the user (when this one feels things are
 126 //             longer than expected).
 127 // Example of usage: refer to demo/DicomDirProgressMethod.py
 128 // Note: Uses gdcmPythonVoidFunc and gdcmPythonVoidFuncArgDelete defined
 129 //       in the Swig verbatim section of this gdcm.i i.e. in the above section
 130 //       enclosed within the %{ ... %} scope operator ).
 131 %typemap(python, in) (void(*method)(void *),void *arg,void(*argDelete)(void *))
 132 {
 133         if($input!=Py_None)
 134         {
 135                 Py_INCREF($input);
 136                 $1=gdcmPythonVoidFunc;
 137                 $2=$input;
 138                 $3=gdcmPythonVoidFuncArgDelete;
 139         }
 140         else
 141         {
 142                 $1=NULL;
 143                 $2=NULL;
 144                 $3=NULL;
 145         }
 146 }
 147
 148 ////////////////////  STL string versus Python str  ////////////////////////
 149 // Convertion returning a C++ string.
 150 %typemap(out) std::string
 151 {
 152     $result = PyString_FromString(($1).c_str());
 153 }
 154
 155 %typemap(out) string
 156 {
 157     $result = PyString_FromString(($1).c_str());
 158 }
 159
 160 %typemap(out) std::string const &
 161 {
 162     $result = PyString_FromString(($1)->c_str());
 163 }
 164
 165 // Convertion of incoming Python str to STL string
 166 %typemap(python, in) const std::string, std::string
 167 {
 168   $1 = PyString_AsString($input);
 169 }
 170
 171 // Same convertion as above but references (since swig converts C++
 172 // refererences to pointers)
 173 %typemap(python, in) std::string const &
 174 {
 175    $1 = new std::string( PyString_AsString( $input ) );
 176 }
 177
 178 ////////////////////  gdcm.TagName versus Python str  //////////////////////
 179 %typemap(out) gdcm::TagName, const gdcm::TagName &
 180 {
 181     $result = PyString_FromString(($1)->c_str());
 182 }
 183
 184 // Convertion of incoming Python str to STL string
 185 %typemap(python, in) const gdcm::TagName, gdcm::TagName
 186 {
 187   $1 = PyString_AsString($input);
 188 }
 189
 190 // Same convertion as above but references (since swig converts C++
 191 // refererences to pointers)
 192 %typemap(python, in) gdcm::TagName const &
 193 {
 194    $1 = new std::string( PyString_AsString( $input ) );
 195 }
 196
 197 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 198 // Because overloading and %rename don't work together (see below Note 1)
 199 // we need to ignore some methods (e.g. the overloaded default constructor).
 200 // The gdcm::File class doesn't have any SetFilename method anyhow, and
 201 // this constructor is only used internaly (not from the API) so this is
 202 // not a big loss.
 203 %ignore gdcm::binary_write(std::ostream &,uint32_t const &);
 204 %ignore gdcm::binary_write(std::ostream &,uint16_t const &);
 205
 206 %ignore gdcm::DicomDir::SetStartMethod(DicomDir::Method *method,void *arg = NULL);
 207 %ignore gdcm::DicomDir::SetProgressMethod(DicomDir::Method *method,void *arg = NULL);
 208 %ignore gdcm::DicomDir::SetEndMethod(DicomDir::Method *method,void *arg = NULL);
 209
 210 // Ignore all placed in gdcmCommon.h
 211 %ignore GDCM_UNKNOWN;
 212 %ignore GDCM_UNFOUND;
 213 %ignore GDCM_BINLOADED;
 214 %ignore GDCM_NOTLOADED;
 215 %ignore GDCM_UNREAD;
 216
 217 %constant const char *UNKNOWN   = "gdcm::Unknown";
 218 %constant const char *UNFOUND   = "gdcm::Unfound";
 219 %constant const char *BINLOADED = "gdcm::Binary data loaded";
 220 %constant const char *NOTLOADED = "gdcm::NotLoaded";
 221 %constant const char *UNREAD    = "gdcm::UnRead";
 222
 223 /*
 224 %constant unsigned int LD_ALL         = 0x00000000;
 225 %constant unsigned int LD_NOSEQ       = 0x00000001;
 226 %constant unsigned int LD_NOSHADOW    = 0x00000002;
 227 %constant unsigned int LD_NOSHADOWSEQ = 0x00000004;
 228 */
 229
 230 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 231 // Warning: Order matters !
 232 %include "gdcmCommon.h"
 233 %include "gdcmBase.h"
 234 %include "gdcmDictEntry.h"
 235 %include "gdcmDict.h"
 236 %include "gdcmDictSet.h"
 237 %include "gdcmDocEntrySet.h"
 238 %include "gdcmElementSet.h"
 239 %include "gdcmSQItem.h"
 240 %include "gdcmDicomDirElement.h"
 241 %include "gdcmDicomDirObject.h"
 242 %include "gdcmDicomDirImage.h"
 243 %include "gdcmDicomDirSerie.h"
 244 %include "gdcmDicomDirStudy.h"
 245 %include "gdcmDicomDirPatient.h"
 246 %include "gdcmDicomDirMeta.h"
 247 %include "gdcmDocument.h"
 248 %include "gdcmFile.h"
 249 %include "gdcmSerieHelper.h"
 250 %include "gdcmFileHelper.h"
 251 %include "gdcmUtil.h"
 252 %include "gdcmGlobal.h"
 253 %include "gdcmDicomDir.h"
 254 %include "gdcmDocEntry.h"
 255 %include "gdcmContentEntry.h"
 256 %include "gdcmValEntry.h"
 257 %include "gdcmBinEntry.h"
 258 %include "gdcmSeqEntry.h"
 259 %include "gdcmVR.h"
 260 %include "gdcmTS.h"
 261 %include "gdcmDictGroupName.h"
 262
 263 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 264 // Notes on swig and this file gdcm.i:
 265 //
 266 /////////////////////////////////////
 267 // Note 1: swig collision of method overloading and %typemap
 268 // Consider the following junk.i file:
 269 //     %module junk
 270 //     %{
 271 //     #include <string>
 272 //     #include <iostream>
 273 //     void Junk(std::string const & bozo) { std::cout << bozo << std::endl; }
 274 //     void Junk() { std::cout << "Renamed Junk()" << std::endl; }
 275 //     %}
 276 //
 277 //     %typemap(python, in) std::string const &
 278 //     {
 279 //     $1 = new std::string( PyString_AsString( $input ) );
 280 //     }
 281 //     void Junk();
 282 //     void Junk(std::string const & bozo);
 283 //
 284 // that we compile on linux with:
 285 //    swig -c++ -python junk.i
 286 //    g++ -g -I/usr/include/python2.3/ -o junk_wrap.o -c junk_wrap.cxx
 287 //    g++ junk_wrap.o -shared -g -o _junk.so -L/usr/lib/python2.3/config \
 288 //        -lpython2.3
 289 // and invoque with:
 290 //    python -c 'from junk import *; Junk("aaa") '
 291 // then we get the following unexpected (for novice) python TypeError:
 292 //    TypeError: No matching function for overloaded 'Junk'
 293 //
 294 // This happens because the swig generated code (at least for python) does
 295 // the following two stage process:
 296 //   1/ first do a dynamic dispatch ON THE NUMBER OF ARGUMENTS of the overloaded
 297 //      Junk function (the same happens with method of course). [Note that the
 298 //      dispatch is NOT done on the type of the arguments].
 299 //   2/ second apply the typemap.
 300 // When the first dynamic dispatch is executed, the swig generated code
 301 // has no knowledge of the typemap, and thus expects a pointer to a std::string
 302 // type i.e. an argument to Junk of the form _p_std__int<address>. But this
 303 // is not what python handles to Junk ! An invocation of the form 'Junk("aaa")'
 304 // will make Python pass a PyString to swig (and this is precisely why we
 305 // wrote the typemap). And this will fail....
 306 /////////////////////////////////////