gdcmPython/testSuite.py

   1 import unittest
   2 import os
   3 from gdcmPython import *
   4 if os.name == 'posix':
   5    from libvtkgdcmPython import *
   6 else:
   7    from vtkgdcmPython import *
   8
   9 class gdcmTestCase(unittest.TestCase):
  10    # The files whose name starts with a modality (e.g. CR-MONO1-10-chest.dcm)
  11    # come from Sebastien Barre's Dicom2 highly recommendable site
  12    # http://www.barre.nom.fr/medical/samples/index.html
  13
  14    MultiFrameFiles = [
  15
  16    GdcmFiles = [
  17       # FOLLOWING FILE NOT IN GDCMDATA ANYMORE !?!?!?!
  18       ["gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm",
  19          # Interest: - possesses a sequence
  20          #           - dicom file, with a recognition code of ACR-NEMA1
  21          [ ["Transfer Syntax UID", "1.2.840.10008.1.2"],  # Implicit VR, LE
  22            ["Recognition Code (RET)", "ACR-NEMA 1.0"],
  23            ["Modality", "MR"],
  24            ["Photometric Interpretation", "MONOCHROME2"],
  25            ["Rows", "256"],
  26            ["Columns", "256"],
  27            ["Bits Stored", "8"],
  28            ["Bits Allocated", "16"],
  29            ["High Bit", "7"],
  30            ["Pixel Representation", "0"],
  31            ["Manufacturer", "Philips Medical Systems"],
  32            ["Manufacturer's Model Name", "Gyroscan Intera"],
  33            ["Sequence Variant", "OTHER"],
  34            ["Pixel Data", "gdcm::NotLoaded. Address:6584 Length:131072 x(20000)"]
  35           ] ],
  36    ]
  37
  38    def _BaseTest(self, FileSet):
  39       for entry in FileSet:
  40          fileName = os.path.join(GDCM_TEST_DATA_PATH, entry[0])
  41          reader = gdcmFile(fileName)
  42          assert reader.IsReadable(),\
  43                 "File '%s' is not readable by gdcmFile" % fileName
  44
  45          valDict = reader.GetEntryValue()
  46          for subEntry in entry[1]:
  47             element = subEntry[0]
  48             value   = subEntry[1]
  49             self.assertEqual(valDict[element], value,
  50                              ("Wrong %s for file %s (got %s, shoud be %s)"
  51                              % (element,fileName, valDict[element], value)) )
  52
  53    def testFiles(self):
  54       gdcmTestCase._BaseTest(self, gdcmTestCase.GdcmFiles)
  55
  56 if __name__ == '__main__':
  57    if not GDCM_TEST_DATA_PATH:
  58       print "GDCM_TEST_DATA_PATH (internal variable) is not setup properly."
  59       print "   This test suite requires that some Dicom reference files be "
  60       print "   installed."
  61       print "   For further details on installation of gdcmData, please"
  62       print "   refer to the developper's section of page "
  63       print "       http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm"
  64       print ""
  65       print "gdcmData directory (used in the test suite) must be placed in"
  66       print "the gdcm directory. The gdcm tree must be :"
  67       print "   gdcm"
  68       print "    |____Dicts"
  69       print "    |____Doc"
  70       print "    |____gdcmData      (not in gdcm by default)"
  71       print "    |____gdcmPython"
  72       print "    |____Test"
  73    else:
  74       unittest.main()
  75