gdcmRLEFramesInfo.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: gdcmRLEFramesInfo.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/11/28 15:20:34 $
   7   Version:   $Revision: 1.18 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmRLEFramesInfo.h"
  20 #include "gdcmDebug.h"
  21 #include "gdcmUtil.h"
  22
  23 namespace gdcm
  24 {
  25 //-------------------------------------------------------------------------
  26 // Constructor / Destructor
  27 RLEFramesInfo::~RLEFramesInfo()
  28 {
  29    for(RLEFrameList::iterator it = Frames.begin(); it != Frames.end(); ++it)
  30    {
  31       delete (*it);
  32    }
  33    Frames.clear();
  34 }
  35
  36 //-----------------------------------------------------------------------------
  37 // Public
  38 void RLEFramesInfo::AddFrame(RLEFrame *frame)
  39 {
  40    Frames.push_back(frame);
  41 }
  42
  43 RLEFrame *RLEFramesInfo::GetFirstFrame()
  44 {
  45    ItFrames = Frames.begin();
  46    if (ItFrames != Frames.end())
  47       return  *ItFrames;
  48    return NULL;
  49 }
  50
  51 RLEFrame *RLEFramesInfo::GetNextFrame()
  52 {
  53    gdcmStaticAssertMacro (ItFrames != Frames.end());
  54
  55    ++ItFrames;
  56    if (ItFrames != Frames.end())
  57       return  *ItFrames;
  58    return NULL;
  59 }
  60
  61 /**
  62  * \brief     Reads from disk the Pixel Data of 'Run Length Encoded'
  63  *            Dicom encapsulated file and decompress it.
  64  * @param     fp already open File Pointer
  65  *            from which the pixel data should be read
  66  * @param raw raw
  67  * @param xSize x Size
  68  * @param ySize y Size
  69  * @param zSize z Size
  70  * @param bitsAllocated Bits allocated
  71  * @return    Boolean
  72  */
  73 bool RLEFramesInfo::DecompressRLEFile( std::ifstream *fp , uint8_t *raw,
  74                                        int xSize, int ySize, int zSize,
  75                                        int bitsAllocated )
  76 {
  77    uint8_t *subRaw = raw;
  78    long rawSegmentSize = xSize * ySize;
  79
  80    // Loop on the frame[s]
  81    for(RLEFrameList::iterator it = Frames.begin(); it != Frames.end(); ++it)
  82    {
  83       subRaw = (*it)->ReadAndDecompressRLEFrame( subRaw, rawSegmentSize, fp);
  84    }
  85
  86    if ( bitsAllocated == 16 )
  87    {
  88       // Try to deal with RLE 16 Bits
  89       ConvertRLE16BitsFromRLE8Bits( raw, xSize, ySize, zSize );
  90    }
  91
  92    return true;
  93 }
  94
  95 /**
  96  * \brief  We assume Raw contains the decoded RLE pixels but as
  97  *         8 bits per pixel. We convert those pixels to 16 bits
  98  *         per pixel.
  99  * @param raw raw
 100  * @param xSize x Size
 101  * @param ySize y Size
 102  * @param numberOfFrames number of frames
 103  * @return    Boolean always true
 104  */
 105 bool RLEFramesInfo::ConvertRLE16BitsFromRLE8Bits(uint8_t *raw, int xSize,
 106                                                  int ySize, int numberOfFrames)
 107 {
 108    size_t pixelNumber = xSize * ySize;
 109    size_t rawSize     = pixelNumber * numberOfFrames * 2;
 110
 111    // We assumed Raw contains the decoded RLE pixels but as
 112    // 8 bits per pixel. In order to convert those pixels to 16 bits
 113    // per pixel we cannot work in place within Raw and hence
 114    // we copy it in a safe place, say copyRaw.
 115
 116    uint8_t *copyRaw = new uint8_t[rawSize];
 117    memmove( copyRaw, raw, rawSize );
 118
 119    uint8_t *x = raw;
 120    uint8_t *a;
 121    uint8_t *b;
 122
 123    // Warning : unckecked patch to see the behaviour on Big Endian Processors
 124
 125    if ( !Util::IsCurrentProcessorBigEndian() )
 126    {
 127       a = copyRaw;         // beginning of 'low bytes'
 128       b = a + pixelNumber; // beginning of 'hight bytes'
 129    }
 130    else
 131    {
 132       b = copyRaw;         // beginning of 'low bytes'
 133       a = b + pixelNumber; // beginning of 'hight bytes'
 134    }
 135
 136    // Re order bytes
 137    for ( int i = 0; i < numberOfFrames; i++ )
 138    {
 139       for ( unsigned int j = 0; j < pixelNumber; j++ )
 140       {
 141          *(x++) = *(b++);
 142          *(x++) = *(a++);
 143       }
 144    }
 145
 146    delete[] copyRaw;
 147
 148    return true;
 149 }
 150
 151 //-----------------------------------------------------------------------------
 152 // Protected
 153
 154 //-----------------------------------------------------------------------------
 155 // Private
 156
 157 //-----------------------------------------------------------------------------
 158 // Print
 159 /**
 160  * \brief        Print self.
 161  * @param indent Indentation string to be prepended during printing.
 162  * @param os     Stream to print to.
 163  */
 164 void RLEFramesInfo::Print( std::ostream &os, std::string indent )
 165 {
 166    os << std::endl;
 167    os << indent
 168       << "----------------- RLE frames --------------------------------"
 169       << std::endl;
 170    os << indent
 171       << "Total number of Frames : " << Frames.size()
 172       << std::endl;
 173    int frameNumber = 0;
 174    for(RLEFrameList::iterator it = Frames.begin(); it != Frames.end(); ++it)
 175    {
 176       os << indent
 177          << "   frame number :" << frameNumber++
 178          << std::endl;
 179       (*it)->Print( os, indent + "   " );
 180    }
 181 }
 182
 183 //-----------------------------------------------------------------------------
 184 } // end namespace gdcm