grid/common.sh

   1
   2 set -u
   3
   4 # print error message and exit immediately
   5 programname="$(basename ${0})"
   6 function error {
   7 echo "${programname} **ERROR** $1"
   8 exit 1
   9 }
  10
  11 # ensure a valid proxy is present for at least one hour
  12 # if no proxy is found, try to create a new one
  13 # return 0 if a valid proxy is found or created
  14 # else return voms-proxy-init error code
  15 function ensure_proxy {
  16 voms-proxy-info --exists -valid 1:0 > /dev/null && return 0
  17 voms-proxy-init --voms biomed -valid 24:00 || exit 1
  18 }
  19
  20 # print prompt to ensure that the user want to continue further
  21 # the user has to answer with 'y' to continue
  22 function check_user {
  23 prompt="${1:-is that correct?}"
  24 read -p "${prompt} [y/n] " answer
  25 test "${answer}" == "y" && return 0
  26 test "${answer}" == "n" && return 1
  27 check_user "${prompt}"
  28 }
  29
  30 # common path used
  31 lfnbase="/grid/biomed/creatis/fgate/"
  32 lfnrelease="${lfnbase}releases/"
  33 lfnworkflow="${lfnbase}"
  34 lfngasw="${lfnbase}gasw/"
  35 lfnscript="${lfnbase}bin/"
  36
  37 # define the prefix for uploaded file
  38 # default to local machine username
  39 prefix="${USER:?"USER must be set"}_"